update:2014-2-27 LinJM @HQU 『 libsvm专栏地址:http://blog.csdn.net/column/details/libsvm.html 』
下面来分析Cache类的源码,该类位于svm.cpp中。这个类的主要功能是:负责运算所涉及的内存管理,包括申请、释放等。
简单来说:这个Cache类,首先通过Cache构造函数申请一块空间,这块空间的大小是:L个head_t大小的空间。然后get_data函数保证结构head_t中至少有len个float的内存,并且将可以使用的内存块的指针放在data指针中;而swap_index函数则是用于交换head[i]和head[j]。
Cache类的定义如下:
class Cache { public: Cache(int l,long int size); ~Cache(); // request data [0,len) // return some position p where [p,len) need to be filled // (p >= len if nothing needs to be filled) int get_data(const int index, Qfloat **data, int len); void swap_index(int i, int j); private: int l; long int size;//所指定的全部内存,据说用Mb做单位 //结构head_t用来记录所申请内存的指针,并记录长度,而且通过双向的指针,形成链表,增加寻址的速度 struct head_t { head_t *prev, *next; // a circular list是一个双向链表,非循环链表 Qfloat *data; int len; // data[0,len) is cached in this entry }; head_t *head;//变量指针,该指针记录程序中所申请的内存。 head_t lru_head;//双向链表的表头 void lru_delete(head_t *h);//从双向链表中删去某个元素的链接,一般是删去当前所指向的元素 void lru_insert(head_t *h);//在链表后面插入一个新的链接 };主要包含:
关于上面的结构体head_t,它是一个双向链表方便前后内存的访问,在文献LIBSVM:A Libray for SVM中如下说法:
构造函数的代码如下:
Cache::Cache(int l_,long int size_):l(l_),size(size_) { //calloc函数的功能与malloc函数的功能相似,都是从堆分配内存该函数与malloc函数的一个显著不同时 //是,calloc函数得到的内存空间是经过初始化的,其内容全为0。 head = (head_t *)calloc(l,sizeof(head_t)); // initialized to 0 size /= sizeof(Qfloat);//先将原来byte数目转化为float的数目。 size -= l * sizeof(head_t) / sizeof(Qfloat);//扣除掉L个head_t的内存数目 size = max(size, 2 * (long int) l); // cache must be large enough for two columns lru_head.next = lru_head.prev = &lru_head; }该函数根据实参:样本数L,申请L个head_t的空间,初始化为0;size的处理是:先将输入的size值(byte单位)转化为float的数目,然后再减去L个head_t所占的空间;其中lru_head因为尚没有head_t中申请到内存,故双向链表指向自己。
析构函数的代码如下:
Cache::~Cache() { for(head_t *h = lru_head.next; h != &lru_head; h=h->next) free(h->data); free(head); }这个很简单,不用多说。
双向链表的删去函数代码:
void Cache::lru_delete(head_t *h) { // delete from current location h->prev->next = h->next; h->next->prev = h->prev; }该函数用于后面swap_index函数断开双向链表的实现。只是断开链接,没有删去数据。
双向链表的插入函数代码:
void Cache::lru_insert(head_t *h) { // insert to last position h->next = &lru_head; h->prev = lru_head.prev; h->prev->next = h; h->next->prev = h; }该函数用于后面swap_index函数恢复前面断开连接的两个数据的实现。
get_data函数的代码:
int Cache::get_data(const int index, Qfloat **data, int len)
{
head_t *h = &head[index];
if(h->len) lru_delete(h);
int more = len - h->len;
//因为shrink后h->len可能变小,那么more>0,现在要做的就是重新filled,即把内存变成len那么大(主要是通过realloc实现的)
if(more > 0)
{
// free old space,这一步一般不会运行
while(size < more) //size为所指定的全部内存
{
head_t *old = lru_head.next;
lru_delete(old);
free(old->data);
size += old->len;
old->data = 0;
old->len = 0;
}
// allocate new space
h->data = (Qfloat *)realloc(h->data,sizeof(Qfloat)*len);//把内存扩大到len
size -= more;
swap(h->len,len);
}
lru_insert(h);
*data = h->data;
return len;
}
该函数主要的就是每个head[i]具有len大小的内存空间。关于realloc函数是扩大内存用的。
void Cache::swap_index(int i, int j) { if(i==j) return; if(head[i].len) lru_delete(&head[i]);//断开双向链表 if(head[j].len) lru_delete(&head[j]);//断开双向链表 swap(head[i].data,head[j].data); swap(head[i].len,head[j].len); if(head[i].len) lru_insert(&head[i]); if(head[j].len) lru_insert(&head[j]); if(i>j) swap(i,j); for(head_t *h = lru_head.next; h!=&lru_head; h=h->next) { if(h->len > i) { if(h->len > j) swap(h->data[i],h->data[j]); else { // give up lru_delete(h); free(h->data); size += h->len; h->data = 0; h->len = 0; } } } }这个函数就是交换head_t[i]和head_t[j]的内容。首先将head_t[i]和head_t[j]从双向链表中脱离出去,然后交换它们的内容,最后重新把它们恢复到链表中。
完整代码如下:
// // Kernel Cache // // l is the number of total data items // size is the cache size limit in bytes // //类Cache负责运算所涉及的内存的管理,包括申请、释放等 class Cache { public: Cache(int l,long int size); ~Cache(); // request data [0,len) // return some position p where [p,len) need to be filled // (p >= len if nothing needs to be filled) int get_data(const int index, Qfloat **data, int len); void swap_index(int i, int j); private: int l; long int size;//所指定的全部内存,据说用Mb做单位 //结构head_t用来记录所申请内存的指针,并记录长度,而且通过双向的指针,形成链表,增加寻址的速度 struct head_t { head_t *prev, *next; // a circular list是一个双向链表,非循环链表 Qfloat *data; int len; // data[0,len) is cached in this entry }; head_t *head;//变量指针,该指针记录程序中所申请的内存。 head_t lru_head;//双向链表的表头 void lru_delete(head_t *h);//从双向链表中删去某个元素的链接,一般是删去当前所指向的元素 void lru_insert(head_t *h);//在链表后面插入一个新的链接 }; Cache::Cache(int l_,long int size_):l(l_),size(size_) { //calloc函数的功能与malloc函数的功能相似,都是从堆分配内存该函数与malloc函数的一个显著不同时 //是,calloc函数得到的内存空间是经过初始化的,其内容全为0。 head = (head_t *)calloc(l,sizeof(head_t)); // initialized to 0 size /= sizeof(Qfloat);//先将原来byte数目转化为float的数目。 size -= l * sizeof(head_t) / sizeof(Qfloat);//扣除掉L个head_t的内存数目 size = max(size, 2 * (long int) l); // cache must be large enough for two columns lru_head.next = lru_head.prev = &lru_head; } Cache::~Cache() { for(head_t *h = lru_head.next; h != &lru_head; h=h->next) free(h->data); free(head); } void Cache::lru_delete(head_t *h) { // delete from current location h->prev->next = h->next; h->next->prev = h->prev; } void Cache::lru_insert(head_t *h) { // insert to last position h->next = &lru_head; h->prev = lru_head.prev; h->prev->next = h; h->next->prev = h; } //该函数保证head_t[index]中至少有len个float的内存,并且将可以使用的内存块的指针放在data指针中,返回值为申请到的内存 int Cache::get_data(const int index, Qfloat **data, int len) { head_t *h = &head[index]; if(h->len) lru_delete(h); int more = len - h->len; if(more > 0) { // free old space while(size < more) //size为所指定的全部内存 { head_t *old = lru_head.next; lru_delete(old); free(old->data); size += old->len; old->data = 0; old->len = 0; } // allocate new space h->data = (Qfloat *)realloc(h->data,sizeof(Qfloat)*len); size -= more; swap(h->len,len); } lru_insert(h); *data = h->data; return len; } void Cache::swap_index(int i, int j) { if(i==j) return; if(head[i].len) lru_delete(&head[i]);//断开双向链表 if(head[j].len) lru_delete(&head[j]);//断开双向链表 swap(head[i].data,head[j].data); swap(head[i].len,head[j].len); if(head[i].len) lru_insert(&head[i]); if(head[j].len) lru_insert(&head[j]); if(i>j) swap(i,j); for(head_t *h = lru_head.next; h!=&lru_head; h=h->next) { if(h->len > i) { if(h->len > j) swap(h->data[i],h->data[j]); else { // give up lru_delete(h); free(h->data); size += h->len; h->data = 0; h->len = 0; } } } }
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