Caffe 中LMDB接口处理多标签(Multi-Label)数据

Caffe的数据接口主要有原始图像(ImageData), HDF5, LMDB/LevelDB。由于Caffe自带的图像转LMDB接口只支持但label,对于多label的任务,往往需要使用HDF5。

然而,Caffe对于HDF5的数据,需要预先读取整个h5文件,这对于小数据的情况不成问题,而且一次性读到内存里还节省训练中的IO开销。可是对于数据量大的情况,内存可能放不下整个h5文件,则需要划分成几个小的h5文件。可这样的实现一方面不优雅,另一方面训练中需要不停地轮流读取h5文件。一种可能的解决方案是把图像数据放到lmdb,label数据放到h5文件,prototxt里面label和data分别来自两个data layer。可是个人觉得这样的实现也不好看,毕竟代码里面要做HDF5和LMDB的存储。

最近从网上看到一种更直接的方法,大致是结合Python的LMDB库和Caffe的Python 接口 caffe.io.array_to_datum,把图像数据和label,分别存储到两个lmdb文件。
代码如下:

def write_lmdb(image_name_list,label_array,lmdb_img_name,lmdb_label_name,resize_image = False):
    for lmdb_name in [lmdb_img_name, lmdb_label_name]:
        db_path = os.path.abspath(lmdb_name)
        if os.path.exists(db_path):
            shutil.rmtree(db_path)
    counter_img = 0
    counter_label = 0
    batchsz = 100
    fail_cnt = 0
    print("Processing {:d} images and labels...".format(len(image_name_list)))
    for i in xrange(int(np.ceil(len(image_name_list)/float(batchsz)))):
        image_name_batch = image_name_list[batchsz*i:batchsz*(i+1)]
        label_batch = label_array[batchsz*i:batchsz*(i+1),:]
        print label_batch[np.newaxis,np.newaxis,0].dtype
        raw_input('r')
        imgs, labels = [], []
        for idx,image_name in enumerate(image_name_batch):
                img = skimage.io.imread(image_name)
                if resize_image==True:
                    img = skimage.transform.resize(img,(96,96))
                imgs.append(img)

        db_imgs = lmdb.open(lmdb_img_name, map_size=1e12)
        with db_imgs.begin(write=True) as txn_img:
            for img in imgs:
                datum = caffe.io.array_to_datum(np.expand_dims(img, axis=0))
                txn_img.put("{:0>10d}".format(counter_img), datum.SerializeToString())
                counter_img += 1
        print("Processed {:d} images".format(counter_img))
        db_labels = lmdb.open(lmdb_label_name, map_size=1e12)
        with db_labels.begin(write=True) as txn_label:
            for idx in range(label_batch.shape[0]):
                datum = caffe.io.array_to_datum(label_batch[np.newaxis,np.newaxis,idx])
                txn_label.put("{:0>10d}".format(counter_label), datum.SerializeToString())
                counter_label += 1
        print("Processed {:d} labels".format(counter_label))
    print fail_cnt,'images fail reading'
    db_imgs.close()
    db_labels.close()

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