生物信息学论文阅读小记第4页

最美武隆，夜游白马山茶山小镇小记

到达白马山时已是午后，去白马山的标志景点飞天之吻游玩一番后，夕阳的余晖已经染上云彩了。本来还在哀叹这次行程路上耽搁了太久，一天就这么匆匆而过时，却在忘仙崖边发现了夕阳西下时的绝美山河图。能得见如此美景，一天的烦闷顿时烟消雨散了。我不知道杜甫作《赠花卿》时是赞美还是讽刺，亦或者双关，但此时此刻，我却是发自肺腑地赞叹这白马山傍晚时的美景，“此景只应天上有，人间能得几回闻。”白马山观云海不像西藏一望无际

重庆旅游资讯·2024-09-03 23:29

5位高 I 劳动节出行小记

2020年5月1日周五珠海晴207/1000劳动节【主题】5位高I劳动节出行小记【字数】1128今天5月1日，国际劳动节，又称“国际示威游行日”（InternationalWorkers'Day或者MayDay

Coco万在简述·2024-09-03 22:55

2021-06-01

读书会小记-《亲密关系》第九期时间：2021.06.01上午9:30-12:00地点：猫屎咖啡-新江南.生活荟店哈喽，大家好，我是丁香，名字熟悉哦，没错，我也是《亲密关系》这本书一期不落的忠实粉丝了哦。

丁香_a31d·2024-09-03 20:34

八月二十一日小记

这个月，人际关系下降。有时候去做一些责任心的事情，却不经意间容易“得罪”人。平衡真的是很重要的吧。跟自己说：少说话，多做事。我只能不停的跟自己说：没事，你尽力而为就好了。前两天，想着爸爸在医院老是吃外卖的快餐。就想着买菜回去做饭给他。一下班赶紧回去，然后做饭，自己吃完饭后再坐地铁带饭给老爸。来回折腾一个多小时。自己用心做出来的饭菜，总比外面点的快餐好多了。我开始喜欢做饭的自己了。老爸现在健谈了很多

彩语星空·2024-09-03 19:18

A Tutorial on Near-Field XL-MIMO Communications Towards 6G【论文阅读笔记】

此系列是本人阅读论文过程中的简单笔记，比较随意且具有严重的偏向性（偏向自己研究方向和感兴趣的），随缘分享，共同进步~论文主要内容：建立XL-MIMO模型，考虑NUSW信道和非平稳性；基于近场信道模型，分析性能（SNRscalinglaws，波束聚焦、速率、DoF）XL-MIMO设计问题：信道估计、波束码本、波束训练、DAMXL-MIMO信道特性变化：UPW➡NUSW空间平稳–>空间非平稳（可视区域

Cc小跟班·2024-09-03 08:22

论文阅读：scMGCA----模型方法

Yu,Z.,Su,Y.,Lu,Y.etal.Topologicalidentificationandinterpretationforsingle-cellgeneregulationelucidationacrossmultipleplatformsusingscMGCA.NatCommun14,400(2023).https://doi.org/10.1038/s41467-023-36134

dundunmm·2024-09-03 07:46

论文阅读：scHybridBERT

ZhangWei,WuChenjun,XingFeiyang,JiangMingfeng,ZhangYixuan,LiuQi,ShiZhuoxing,DaiQi,scHybridBERT:integratinggeneregulationandcellgraphforspatiotemporaldynamicsinsingle-cellclustering,BriefingsinBioinform

dundunmm·2024-09-03 07:42

NCBI BLAST+：分析生物内在编码的工具

在生物信息学的广阔领域中，NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation，美国国立生物技术信息中心）开发的BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool

belldeep·2024-09-02 23:52

外出团建小记

闹钟比往常早了一个小时醒过来从水龙头哇啦啦跑出来的水还是那么冰冻集合的地方似乎在月亮的旁边地铁把我吞了进去，过了一个世纪再吐出来来自不同地方，不同部门的我们再次相聚高速路只是虚有其名，跑跑停停但最终我们还是到了山脚下远远眺望，似泡沫的瀑布环绕而下直升飞机在天空盘旋，俯视大地山清水秀，水秀山清不聊工作，不聊生活，只是看着这山，还有水活动在一顿午饭后结束然后我们就像飘散的蒲公英，各自飞散明年再会，如果

桦岩·2024-09-02 18:00

【生活小记录】孩子在家一天就是忙碌的一天！(2022173)

因为小中考的原因，女儿的休息时间从这周六调整到周日了，这个休息安排非常好，可以让我好好的陪陪爸爸妈妈，只不过要在父亲节这天不能好好陪父亲过个节了！唉！没办法呀！也不知道为什么孩子总不喜欢住在外边，即使是从小最疼爱她的姥姥家也不行，就觉得自己家里好！孩子休息的时间本来就短还是尊重一下孩子的选择，只好在陪爸爸妈妈还是陪女儿之间忍痛选择一下了！希望爸爸妈妈理解！这女儿一休息，我就像一个小陀螺似的忙起来了

恋上清咖·2024-09-02 16:47

【图论简介】

图论在计算机科学、网络理论、优化问题、生物信息学等多个领域都有广泛的应用。本文将简要介绍图论的基本概念、常见算法及其在实际中的应用。

WA-自动机·2024-09-02 13:26

【论文阅读】Purloining Deep Learning Models Developed for an Ultrasound Scanner to a Competitor Machine

TheArtoftheSteal:PurloiningDeepLearningModelsDevelopedforanUltrasoundScannertoaCompetitorMachine（2024）摘要Atransferfunctionapproach（传递函数方法）hasrecentlyproveneffectiveforcalibratingdeeplearning(DL)algorit

Bosenya12·2024-09-02 06:40

《Motion Forecasting with Dual Consistency and Multi-Pseudo-Target Supervision》论文阅读之DCMS

山水之间2018·2024-09-02 04:30

能力越小责任越小YA·2024-09-02 00:37

【论文阅读|cryoET】本周粗读汇总

论文1：CryoDRGN-ET：深度重建生成网络以可视化细胞内动态生物分子Abstract虽然冷冻电子断层扫描可以以分子分辨率揭示结构，但图像处理算法仍然是解决原位生物分子结构异质性的瓶颈。本文介绍CryoDRGN-ET用于cryoET断层图的异质重建。CryoDRGN-ET直接从子断层扫描倾斜系列图像中学习三维密度图的深度生成模型，并且可以捕获成分和构象不同的状态。通过原位恢复肺炎支原体核糖体中

吃吃今天努力学习了吗·2024-09-01 20:46

Your Diffusion Model is Secretly a Zero-Shot Classifier论文阅读笔记

YourDiffusionModelisSecretlyaZero-ShotClassifier论文阅读笔记这篇文章我感觉在智源大会上听到无数个大佬讨论，包括OpenAISora团队负责人，谢赛宁，好像还有杨植麟

Rising_Flashlight·2024-09-01 20:46

【论文阅读】QUEEN: Query Unlearning against Model Extraction（2024）

摘要Modelextractionattacks（模型提取攻击）currentlyposeanon-negligiblethreat（不可忽视的威胁）tothesecurity（安全性）andprivacy（隐私性）ofdeeplearningmodels.Byqueryingthemodelwithasmalldataset（通过小数据集查询模型）andusingthequeryresultsa

Bosenya12·2024-09-01 20:45

【论文阅读33】Deep learning optoacoustic tomography with sparse data

Deeplearningoptoacoustictomographywithsparsedata论文题目：基于稀疏数据的深度学习光声断层扫描论文链接：Deeplearningoptoacoustictomographywithsparsedata|NatureMachineIntelligence代码链接：GitHub-ndavoudi/sparse_artefact_unet数据链接：Data发

弹伦琴的雷登·2024-09-01 18:29

2024-04-29 - AI 实践课 - SUNO 生成歌曲 - 流雨声

摘要2024-04-29周一杭州雾色迷蒙小记:摸着自己的肱二头肌，变硬了也变大了，哈哈哈，坚持锻炼虽然酸爽但是很开心。

流雨声·2024-09-01 15:08

小记

能把一件事情理清还真不容易。因为在两个人相处的过程中，一件事往往伴随着另一件事，这之间不会没有联系，不会不相互受影响。所以单独择清一件事不可能。但其实可以看清一个人，这就是所谓的别人不知道你还不知道吗？以后再遇见烦心的事就想两点，一是这件事影不影响我去做我想做的事，二是将来有孩子了，这个决定会不会不好意思跟孩子提。

人潮只是曾来过·2024-09-01 12:36

读论语：雍也第六·人之生也直，罔之生也幸而免

读论语，修己身，暂且小记当下的理解，方便未来回读增进，“温故而知新”。今分享于个人公众号，笔者王升请你多多指教。子曰：“人之生也直，罔之生也幸而免。”

书谷一言·2024-09-01 07:09

原创小记第145天《有多少需求可以用钱解决》

忙了一整个学期，终于有空可以去逛逛街买买衣服，恍然发现自己错过了整个夏天。已是七月，各个店铺都在收盘上秋装，虽然降价处理，但要挑出合心意的衣服是很难的，这便增加了买到衣服的愉悦度。当你看到自己喜欢的衣服时，金钱变得尤为重要却又微不足道，你需要它来交换而且大多时候你会毫不犹豫开开心心的交换。从这个意义上来说，金钱是好的，它给了你满足和潇洒。钱，是个好东西，在它的使用范围内，它给人掌控和主宰感，我们喜

青浅_33·2024-08-31 22:41

我读论语小记：八佾第三·乐而不淫，哀而不伤

读论语，修己身，暂且小记当下的理解，方便未来回读增进，“温故而知新”。今分享于个人公众号，也请你多多指教。子曰：“关雎，乐而不淫，哀而不伤。”【孔子说：诗经，快乐但不过分，悲哀但不伤害。】

书谷一言·2024-08-31 17:57

交朋友小记

慢慢了解一个人，突然好纠结，居然认识一个跟叔叔一样的，在外面工作，想找个家里的老婆。我似乎无法接受了，毕竟我是看着我表姐这些年怎么过来的，虽然在外人看来风风光光，可是苦只有自己知道啊。也许那句我只是想伤心的拥有一个拥抱，但是确实如此的困难。而且公公婆婆也对他不是很好，这就似乎更困难了。夫妻两个人长期分居似乎也不好吧。我没有那个信心跟他一直走下去，到他说我想多了，只是朋友。对啊，只是朋友，不可依赖。

晓祎琴·2024-08-31 15:33

生信圆桌：专业生信服务器与平台服务的提供者

生信圆桌是一个专注于提供生物信息学（生信）服务器和平台服务的领先企业，致力于为全球科研机构、企业和独立研究者提供高性能的生信分析解决方案。

生信圆桌x生信云服务器·2024-08-31 03:45

论文阅读瞎记(四) Cascade R-CNN: Delving into High Quality Object Detection 2017

概述在物体检测中1，IOU阈值被用于判定正负样本。在低IOU阈值比如0.5的状态下训练模型经常产生噪音预测，然而检测效果会随着IOU增加而降低。两个主要因素：1.训练时的过拟合，正样本指数消失2.检测器最优IOU与输入假设的不匹配。一个单阶段的物体检测器CascadeR-CNN被提出用于解决这些问题。网络由一个检测序列组成，这些序列训练时会伴随IOU增长从而对FP样本更加有选择性地判别。检测器一个

码大哥·2024-08-30 15:58

鬼屋小记1

玩性呀，还是控制不住的。去玩鬼屋了，是长藤鬼校的，背景是偏校园风的，不过，有些破旧，有些黑，有些怕人，有些恐怖，有些刺激。啊～～好怕啊！其实我还好，并不是太怕，不过，有些小许被吓到了。我还是第一次玩这种鬼屋探险的，我还以为有多吓人呢，可能是我胆子比较大些吧，哈哈。不过说真的，我的轮滑小伙伴才是真的大胆呢，关键人家还是个女生。我和她还有一对情侣组队闯关的，他们拿了驱魔令，而我们没有。说明了一点，要了

尹露同行·2024-08-30 08:20

编译出错“.....ntrospect.PropertyInfo”和溢出问题“OutOfMemoryError”（bug小记）

问题一问题描述：当我们在修改完项目代码后，执行maven命令的clean与compile时（作用：以确保最新的更改编译成功并生成正确的可执行文件）发现控制台报错：com.sun.beans.introspect.PropertyInfo解决方式：这里的版本要与项目结构以及编译版本都一致。问题二问题描述：当我们在运行多个服务时（实际上是某方法的参数、局部变量和返回地址等信息压入栈中，随着方法的执行，

ao-it·2024-08-30 03:12

小记

此刻，第一次有种想写点东西的冲动。临近开学，一切筹备都提上了日程，心似乎比手还要忙，让人应接不暇。新的年级，新的教育，新的展望，我们在准备带给孩子们教育，同时我们自己也在被教育。今天给学生的开班第一堂课展示，张老师对璞石教室的希冀让我很受触动。我好像很多年没有被一堂课给这么感动到了，我说不出是不是张老师的声音让我觉得迷恋，或者在她的描绘下，璞石教室的孩子的发展轨迹是我所向往的，又或者两者都是。此刻

侯慧hh·2024-08-30 01:21

周六小记

今天更了4k字，明天再更4k就可以签约了，希望能通过。下个月争取全勤。小说是用手机写的，上次用电脑写被室友发现了，有点尴尬，改为用手机写了。用手机写比用电脑累，大拇指都酸了。这本小说写了1个多月了，才写1.6w。感觉就算签约了，也不能保证每天能更4k。又是想吃水果的一天。买了桑椹，不太新鲜。怕它烂掉，把一盒都吃完了，现在手指还是紫色的。学校的水果一直不新鲜，还贵，一个菠萝18，记得在家这个时候菠萝

七岁半辞·2024-08-29 10:58

卿平小记

为什么人长大了也会有痛哭流涕的时候，也会因为一件极小的事突然情绪爆发。这一刻，我觉得十几年所有的委屈突然涌入心头，当头一棒疼痛感渗入胸膛，而我，无病呻吟，想暂停生活，想一病而亡。我回想着，十几年来有多少个夜晚我躲在房内啜泣痛苦，不敢发出一丝声音，是憋哭。我又有多少次萌发出想要轻生来给他们看她对我人生的指伤有多么痛，我人生的不幸就是她。第一次抓坏我的皮肤，第一次踹我，第一次拿刀想杀我，无数次吵架，无

陈卿海·2024-08-28 21:04

【论文阅读】LLM4SGG: Large Language Models for Weakly Supervised Scene Graph Generation

【论文阅读】LLM4SGG:LargeLanguageModelsforWeaklySupervisedSceneGraphGenerationabstract由于全监督方法严重依赖昂贵标注，最近弱监督场景图生成

进击的乔洋·2024-08-28 19:03

日常小记

家门前一条马路，来来往往，川流不息。马路两旁有秩序地每隔几米立起一颗榕树。我家前面的这颗榕树我知道的也有十几二十年了，算是小时候搬到这边，就看到它立在这里。这个期间它也是历经各种磨难，有车祸、虫害、霜冻、更是几经砍伐枝干还坚强地活下来。从一开始的两三米，现在枝干长到六米多。想起有地方一个习俗，父母会在家旁给几岁大的小孩子种一棵树，小孩子长高了，树也高了。这棵树就相当于他的见证者。而我家门前的这棵树

无蠓·2024-08-28 10:02

用Python实现生信分析——基序（Motif）识别详解

在生物信息学中，基序（Motif）是指在生物序列（如DNA、RNA或蛋白质序列）中具有特定功能或结构的短序列片段。基序通常在生物进化中得到保留，因为它们在生物学功能中起着重要作用。

写代码的M教授·2024-08-28 08:19

今日小记之四

我有一个密密，我们大学两年室友，现在在一起实习，他腼腆，内向，但偶尔也语出惊人比如有人给我打电话说喜欢我，别人会问：是谁啊？而他会问：打得什么电话，是微信电话，还是qq电话？他不吃辣，不吃甜，不吃油，不吃肉，但是喜欢吃苦瓜，喝苦丁茶，不亦乐乎。有时候觉得他挺无聊的，也挺安静的，所以当我来到一个新的环境，认识了新的人，就容易忘了老朋友。那天，我指甲油掉了一点儿，但其它的怎么也不下来，很丑，他就超级耐

彼此唯爱不负·2024-08-27 23:07

生活小记

周一上课时，一直活泼开朗好动的女孩小张突然趴在桌子上，显得很没有精神。课间，我把她叫到走廊，问她，咋回事？看着她眼泪在眼睛打转，知道肯定有事。她说，爸爸妈妈吵架了，还说要离婚。我说，你害怕？她点点头。我说，爸爸妈妈现在在气头上，说的是气话，你不要在意，晚上回家就好了。看她还是满脸愁容，说，早晨你上学时，爸妈的情绪咋样？爸爸上班了，妈妈没上班。我说，你回家劝劝爸爸妈妈，让妈妈和爸爸和好。她点点头。昨

昭云之印·2024-08-27 22:51

神雕：绝顶高手之林朝英与王重阳时间线小记

林朝英，一个传奇的女侠。她在射雕剧情开启前就已经离世多年了，所以她的身影早就湮没在了江湖的岁月中。她在当年也是技压群雄的绝顶高手，而那个时候，所谓的五绝中的四大绝顶高手应该刚刚崭露头角，还没有闯出后来的偌大名声。她的武功一度超过名震江湖的王重阳，并且一直与王重阳相爱相杀。两人都把对方视为一生的伴侣，但最后却以遗憾告终，林朝英成了那个在古墓中枯守至死的人。而王重阳也抱憾终生。本文试着根据书中线索整理

江明月好·2024-08-27 21:44

周末小记：为了成为一种身份

本来以为今天上班，没想到会有休息日；昨天晚上大姨妈刚刚来，疼得我睡不着直到折腾到1:55才睡，结果不用多说。困的要死，像老天爷马上要了我的命一样。而我刚刚经历了一周的反复无常换工作之后终于稳定下来了，这样我今天的一个愿望终于实现了。关于实现愿望这点，我觉得有个观点很有意思，说出来和大家分享一下；你为了实现某个目标，不是为了做某件事情，而是成为一种身份。仔细看，这句话不是那么容易理解，但是实际上还真

芊芊office·2024-08-27 19:25

Code Llama: Open Foundation Models for Code论文阅读

整体介绍CodeLlama发布了3款模型，包括基础模型、Python专有模型和指令跟随模型，参数量分别为7B、13B、34B和70B。这些模型在长达16ktokens的序列上训练。都是基于Llama2。作者针对infilling(FIM)、长上下文、指令专门做了微调long-contextfine-tuning(LCFT).codellama细节CodeLlama模型家族初始化:所有CodeLla

yang_daxia·2024-08-27 18:46

随手小记-Oracle数据库导出行数大于1048576行的数据集到excel

--第一次导出前1048576行SELECT*FROMyour_tableWHEREROWNUM1048576;备注：1048576是xlsx文件的最大行数

李安迪是大神·2024-08-26 22:43

【论文阅读】Model Stealing Attacks Against Inductive Graph Neural Networks（2021）

摘要Manyreal-worlddata（真实世界的数据）comeintheformofgraphs（以图片的形式）.Graphneuralnetworks(GNNs图神经网络),anewfamilyofmachinelearning(ML)models,havebeenproposedtofullyleveragegraphdata（充分利用图数据）tobuildpowerfulapplicat

Bosenya12·2024-08-26 12:29

算法小记——二分查找

目录二分查找二分查找publicclassMyTest3{publicstaticvoidmain(String[]args){int[]arr={10,20,30,40,50,60,70,80,90,100};intindex=getIndex(arr,30);System.out.println(index);}privatestaticintgetIndex(int[]arr,inti){i

Jmh-Ethereal·2024-08-26 09:07

数据结构与算法——动态规划

LeetCode70题）2.斐波那契数列（LeetCode126题）3.最长公共子序列（LeetCode95题）引言动态规划（DynamicProgramming,简称DP）是一种在数学、计算机科学、经济学和生物信息学等领域广泛使用的算法设计技术

passion更好·2024-08-26 06:54

生活小记录

2021年7月4日，周一，晴。晚上8点多，爸爸打电话过来，一是问问我到了没有，二是问问我妈的状况。说了一会儿，可可便跑过来接电话：“妈妈，你们在哪里呀？”“妈妈在昆明啊！你在家里要听外公的话，要乖，好不好？”“嗯，我乖，我听话，你们要快快地回来哦，不然我找不到妈妈我就想妈妈啦！”“嗯，宝贝乖，妈妈过几天就回来了，妈妈爱你哦！”“我也爱你哦！木嘛！”小家伙，在家里的时候嘛，总是因为不听话挨打骂，分开

紫岚兮·2024-08-25 21:10

日杂小记也 - 2022.2.8

为了输出，倒逼输入。发现存在话题重复，发现思考的维度没有展开出来。源于生活的日复一日，源于近期的关注点就那么一两个，源于对感兴趣的东西没有继续感兴趣。近期看的影视作品都是有几年的东西了，近期看的文章有点杂，还没有能形成自己的观点。有没有什么书推荐呢。推荐友人去看最基础的《小狗钱钱》，他说开启了两个梦想计划，希望能好好执行。我则是从书里明确我要养鹅，在别的博主解读下，我明白，我要养几只鹅，来应对接下

近忧远虑·2024-08-25 09:38

抗疫小记：基层抗疫人

你驻足于一片春色中，你向等待着你的人奔跑过去，拿着鲜花，就像电影场景一般。我的家乡是在湖南的一个小山村，虽与湖北省交界，但由于重山的阻隔，经济的欠缺，人流往来并不是那么的密切，因此，家乡很幸运的没有受到疫情的过大影响。但是，家乡人民依然响应祖国的号召，做好基层抗疫。也是由于疫情的原因，在家乡待了将近三个月的时间，可以说是见证了家乡抗疫的全过程。只愿以所学，用文字表以对基层抗疫人崇高的敬意与感谢。“

三遇时·2024-08-24 18:20

VIT论文阅读： A Image is Worth 16x16 Words

简介在2024年，大家都知道了transformer的故事，但是在4年前,CNN和Transformer谁才是CV的未来，还没有那么确定。在简介部分，作者提到了一个令人失望的事实，在基于imagenet的实验中发现，transformer的表现差于同尺寸的ResNet。作者把原因归结到biastranslationequivarianceandlocality，这些CNN具有，但是transfor

Undefined游侠·2024-08-24 17:37

【论文阅读】GLiRA: Black-Box Membership Inference Attack via Knowledge Distillation

摘要While（虽然）DeepNeuralNetworks(DNNs)havedemonstratedremarkableperformanceintasksrelatedtoperception（感知）andcontrol（控制）,therearestillseveralunresolvedconcerns（未解决的问题）regardingtheprivacyoftheirtrainingdat

Bosenya12·2024-08-24 16:35

【论文阅读】APMSA: Adversarial Perturbation Against Model Stealing Attacks（2023）

摘要TrainingaDeepLearning(DL)model（训练深度学习模型）requiresproprietarydata（专有数据）andcomputing-intensiveresources（计算密集型资源）.Torecouptheirtrainingcosts（收回训练成本）,amodelprovidercanmonetizeDLmodelsthroughMachineLearni

Bosenya12·2024-08-24 16:04

植物小记|花叶蔓长春花，零星开花了

前天在花叶蔓长春花的蔓丛里看到了零星的花朵，真早啊，印象里3月开始开花的花叶蔓长春花，在2月下旬就看到花朵出来了，不过也是，快到春天的第二个节气——雨水了，春天的脚步越来越近。还是那熟悉的紫色花朵，像叶丛里的一只只风车，夹竹桃科的花叶蔓长春花开花有一个特点，花朵是旋转着打开，颇具动感，夹竹桃科的夹竹桃、鸡蛋花、长春花等，都是这样。花叶蔓长春，是蔓长春的花叶品种，叶片呈现出绿色与奶油白色的混合色调，

辛夷有个花园梦·2024-08-24 15:21

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