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BWA_MEM
基因数据处理14之BWA三种方式bwa、BWA_SW、
BWA_MEM
使用
1.构建索引:bwaindexref.fa或者从ftp下载,请参考【1】2.BWA:bwa.sh为脚本文件hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310/bwa3sh$catbwa.sh#!/bin/bashbwaaln../GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis
KeepLearningBigData
·
2020-07-09 13:16
基因数据处理
基因数据处理8之
BWA_MEM
小数据集处理(成功)
基因数据处理8之
BWA_MEM
小数据集处理环境:ubuntu14.046G内存参考基因:GRCH38来源请参考【1】1.fastq数据:SRR003161.fastq的头20行,即5条reads操作记录
KeepLearningBigData
·
2020-07-09 13:16
基因数据处理
基因数据处理7之
BWA_MEM
运行太长
基因数据处理7之
BWA_MEM
运行太长hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310$bwamemGCA_000001405.15_GRCh38/GCA
KeepLearningBigData
·
2020-07-09 13:16
基因数据处理
BWA_MEM
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