Beagle

11.2 GWAS流程学习

主要使用plink和structure：1、在snp-calling后得到vcf文件2、基因型填充：https://www.jianshu.com/p/dafd1e6e4a98使用beagle3、数据质量控制
KK_f2d5·2024-01-02 17:39

2021-05-25 picard和beagle软件使用过程中遇到的各种问题

声明：因为本人使用过程中遇到了很多原来人碰得到的问题，放防止以后遗忘，所以做一下记录，因为前总结的很到位，所以直接引用到自己日常记录，供日后查阅。主要引用为：【原创文章】辣椒BSA分析对数据进行质控、去重、索引等预处理的几个姿势（https://www.baishujun.com/archives/7191.html）！去除PCR扩增重复序列由于构建文库的时候进行了pcr扩增，然后进行测序，这么测
AsuraPrince·2023-12-03 14:54

antmedia评估

sr=0-1&ref_=beagle&applicationId=AWSMPContessa优势：auto-scaling。Scalable,Ultra
草根大哥·2023-11-05 09:22

用Beagle做基因型填充（Imputation）

在学习基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing（基因定相、单倍体分型），主要是参考公众号碱基矿工中的一篇文章：人类基因组的Phasing原理是什么。建议多读几遍Phasing和Imputation1.Phasing后形成的单倍型参考序列集(Referencepanel)是基因型推断（Imputation）必须的数据材料2.除了ReferencePanel的制造需要使用Phasing技术之外，
TOP生物信息·2023-09-24 20:01

2021-05-25记录一个beagle使用过程中的坑

对816个样品的SNP的VCF进行impute，首先上beagle，遇到了上个贴子说的各种内存不足问题，然后换tassel进行impute依旧不行，中间耗时小一周。
AsuraPrince·2023-07-14 07:42

新晋猫奴，隆重介绍我的丫丫

先是要边境牧羊犬(BorderCollie)，因后院不大，劝她换个体型别那么大的，于是改要比格犬(Beagle)。我俩花了好长时间研究这两个品种的知识。
海边小妹·2023-03-23 10:04

进化心理学读后随笔-002

第一章进化思想史英国人的内敛，是开往"科学"的渡船22岁那年，壮志未酬的达尔文登上了Beagle号，开始了他为期5年的环球旅行，环球旅行回来后，他觉醒了。
aniev·2023-01-27 06:36

《小說藥丸•庸庸碌碌》

十大奇幻小說《最後的獨角獸》（TheLastUnicorn）彼得•S.比格尔（PeterS.Beagle）《Zoo城》（ZooCity）勞倫•伯克斯（LaurenBeukes）《馬戲團
蘿卜·2021-06-06 00:28

在 ARMv7 的设备上编译 Swift 3.0

为了在一个ARMv7的系统上原生编译Swift3.0，你需要做以下准备工作：一个性能强劲的ARMv7设备；我们使用Beagle
梁杰_numbbbbb·2021-06-05 14:53

每日一画 | 极致光影之美

每日一画GabrielGomez西班牙视觉开发艺术家艺术家主页：www.artstation.com/beagle*声明：分享仅作交流与学习使用，不可用于商业目的。
wuhu动画人空间·2020-10-10 00:00

Python周刊452期

文章、教程和讲座ChupaCarBrah-用Beagle
在下杨六郎·2020-09-12 08:15

Beagle选型参数对照表

ProductComparisonTableBeagleBoneBlackBeagleBoneBeagleBoard-xMBeagleBoardProcessorAM3358ARMCortex-A8AM3358ARMCortex-A8DM3730ARMCortex-A8OMAP3530ARMCortex-A8MaximumProcessorSpeed1GHz720MHz1GHz720MHzAnal
bbsview·2020-08-11 11:04

python 中__slots__类属性

现在，你创建了Dog类的子类：Beagle。如果你在毫不知情的情况下又创建了名为mood的实例属性，那么在继承的方法中就会把Dog类的mood属性覆盖掉。这是个难以
MZP_man·2020-07-15 18:00

Python 的私有属性和‘受保护的’属性

举个例子，有个人编写了一个名为dog的类，这个类的内部用到了mood实例属性，但是没有将其开放，现在，你创建了dog类的子类：beagle，如果你有创建了名为mood的实例属性，那么在继承的方法中就会把
Kun Li·2020-07-08 09:58

JavaScript篇

中括号操作符的另一个使用方式是用变量来访问一个属性，当你需要遍历对象的属性列表或者查表时varmyDog="Hunter";vardogs={Fido:"Mutt",Hunter:"Doberman",Snoopie:"Beagle
GpingFeng·2020-06-29 04:21

《物种起源》书评

1831年从剑桥大学毕业后，以博物学家的身份乘海军勘探船“贝格尔号(Beagle)”作历时5年(1831－1836)的环球旅行，观察和搜集了动物、
英天·2020-06-26 08:25

每日一画 | The Ghost of Wind

心上一画GabrielGomez西班牙插画师www.artstation.com/beagle*声明：分享仅作交流与学习使用，不可用于商业目的。版权为原作者所有。
wuhu动画人空间·2020-06-20 00:00

On The Origin Of THE SPECIES 物种起源

Beagle,"asnaturalist,Iwasmuchstruckwi
Perry大叔·2020-03-03 22:07

贝格尔号

贝格尔号贝格尔号帆船贝格尔号(H.M.S.Beagle)是一艘老式二桅方帆小型军舰。贝格尔号是一艘装备有10门大炮的探测船，贝格尔号船长90英尺，能运载120余人。
于英加·2020-01-03 19:33

我的GWAS学习笔记

我前面的两篇笔记做了一些说明：用Beagle做基因型填充基因型填充之后如何过滤0.小白眼中的GWAS第一次听说GWAS是在统计课上，当时的认识是这样的：依次对成千上万个SNP位点，讨论不同基因型在有特定性状
TOP生物信息·2019-08-03 20:54

10.26 安装mrbayes

再看一眼readme：给了网址下beagele：https://github.com/beagle-dev/beagle-lib/r
KK_f2d5·2018-10-26 15:21

在 ARMv7 的设备上编译 Swift 3.0

为了在一个ARMv7的系统上原生编译Swift3.0，你需要做以下准备工作：一个性能强劲的ARMv7设备；我们使用Beagle
SwiftGG翻译组·2016-10-27 00:00

玩儿转物联网IoT - 在Beagle Bone Black上运行node.js 程序

物联网（IoT)技术方兴未艾，智能手环，智能血压计，智能眼镜甚至智能鞋垫都开始进入我们的生活，各种智能设备层出不穷，世界已经到了一个“人有多大胆，地有多大产”的时代，不玩儿点物联网都不好意思和人打招呼了。之前玩儿过开源硬件Arduino，这次再找个功能强劲的BeagleBoneBlack（BBB）。大家可能知道名气更大的树莓派，BBB也是类似的单片计算机开发板，就在名片大小的一块板子上集成了计算机
峻祁连·2016-03-09 18:00

玩儿转物联网IoT - 在Beagle Bone Black上运行node.js 程序

物联网（IoT)技术方兴未艾，智能手环，智能血压计，智能眼镜甚至智能鞋垫都开始进入我们的生活，各种智能设备层出不穷，世界已经到了一个“人有多大胆，地有多大产”的时代，不玩儿点物联网都不好意思和人打招呼了。之前玩儿过开源硬件Arduino，这次再找个功能强劲的BeagleBoneBlack（BBB）。大家可能知道名气更大的树莓派，BBB也是类似的单片计算机开发板，就在名片大小的一块板子上集成了计算机
峻祁连·2016-03-09 18:00

beagle MONO 应用的desktop search

      beagle是linux的desktop search软件，跟winows下的google desktop search类似的东西，它可以搜索各种各样格式的文件
·2015-10-21 10:33

beagleboneblcak的Debian镜像下登录控制方式

参考《小菜教你玩转Beaglebone-black》完成Debian7镜像的下载和烧写beagle的J1区的UART0口是作为监控口打印启动信息的控制BBB的方式有：1.串口线+putty需要USB转串口模块一个
cike44·2015-08-05 19:32

rsync+inotify实时同步文件

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。inotify既可以监控文件，也可以监
ly36843·2015-05-05 10:28

rsync+inotify实时同步文件

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。inotify既可以监控文件，也可以监
ly36843·2015-05-05 10:28

inotify用法简介及结合rsync实现主机间的文件实时同步

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。inotify既可以监控文件，也可
老王课程·2015-01-18 21:02

inotify及rsync的用法

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。inotify既可以监控文件，也可以监
hanye韩也·2014-09-11 08:43

inotify及rsync的用法

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。inotify既可以监控文件，也可以监
hanye1263567419·2014-09-11 08:43

【linux教程】inotify用法简介及结合rsync实现主机间的文件实时同步

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。inotify既可以监控文件，也可以监
马哥教育·2014-09-05 14:46

【linux教程】inotify用法简介及结合rsync实现主机间的文件实时同步

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。inotify既可以监控文件，也可以监
马哥教育·2014-09-05 14:46

logback_eclipse_plugin_beagle

logback_eclipse_plugin_beaglehttp://logback.qos.ch/beagle/index.html先安装依赖插件：http://download.eclipse.org
星游领地·2014-07-13 19:00

Linux服务之inotify+rsync数据同步

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在诸多缺陷的dnotify。二、rsync简介rsync是类u
liyandong3465·2013-09-01 22:37

beagle board dm3730添加串口4

原始代码只有串口1-3。添加串口4按照以下几个步骤：1.修改arch/arm/mach-omap2/serial.c添加串口4的信息101staticstructplat_serial8250_portserial_platform_data2[]={102    {103        .mapbase    =OMAP_UART3_BASE,104        .irq      =74,1
cokewei·2013-03-25 11:00

Inotify+Rsync实现linux文件实时同步

该机制由著名的桌面搜索引擎项目beagle引入用于替代此前具有类似功能但存在
myaliqiang·2012-08-28 22:43

linux文件系统变化通知机制—inotify

inotify是一种文件系统的变化通知机制，如文件增加、删除等事件可以立刻让用户得知，该机制是著名的桌面搜索引擎项目beagle引入的
zhangskd·2012-05-18 13:00

系统清理 ccleaner在linux mint 下的替代工具 BleachBit

当前，BleachBit能够清理Beagle、Firefox、Opera、Epiphany、Flash、OpenOffice.org等软件所产生的垃圾文件。
tycomputer·2012-05-09 16:00

Android源码编译（二）----------->Android’s kernel for beagleboard-xm

gitorious.org/rowboat1,Build1:makeCROSS_COMPILE=arm-eabi-distclean2:makeCROSS_COMPILE=arm-eabi-omap3_beagle_android_defconfig3
Peter_hucq·2011-08-03 14:00

硬件也开源?400美元就能DIY平板电脑

这种名为Beagle的平板电脑被Liquidware的产品开发主管定义为一种模块化的开源便携电脑，并且完全基于定制化和嵌入式
walkerxk·2010-06-21 11:00

Android成功刷到beagle board ^_^

阅读更多捣鼓了3天,终于成功把android刷到beagleboard上面了.beagleboard是个很小型的计算机主板,一般可以运行各种嵌入式linux,比如Ångström.详细specs看这里:具体刷机guide看这里:http://labs.embinux.org/index.php/Main_Page个人经验概述一下,首先是要编译boot用的kernel.这个没什么难度,按照guide
lordhong·2009-04-08 11:00

Android成功刷到beagle board ^_^

捣鼓了3天,终于成功把android刷到beagleboard上面了.beagleboard是个很小型的计算机主板,一般可以运行各种嵌入式linux,比如Ångström.详细specs看这里:具体刷机guide看这里:http://labs.embinux.org/index.php/Main_Page个人经验概述一下,首先是要编译boot用的kernel. 这个没什么难度,按照guide就可以
lordhong·2009-04-08 11:00

聚焦.NET开源世界里的奇葩：Beagle

就Beagle这款著名的开源.NET应用，InfoQ采访了JoeShaw和PierreOstlund。Beagle是目前Linux平台上最为著名的Mono应用之一，为Linux社区提供了桌面搜索功能。
James Vastbinder·2007-08-17 00:00

Beagle the desktop search tool

阅读更多我所了解的人当中大多数都会把自己的磁盘整理得头头是道，很少有找不到自己的文件的情况，当然我自己也是这样的。可是有些时候使用桌面搜索引擎不是找得到找不到的问题，有时候要定位一个文件确实是比较麻烦的，即使你清楚地知道它在哪里。我自己体会最深刻的就是文档API。看看系统自带了多少文档吧：$ls-1/usr/share/doc/|wc-l14861486项。挺吓人的数字，每次都输入/usr/sha
pluskid·2007-05-31 11:00

Beagle the desktop search tool

我所了解的人当中大多数都会把自己的磁盘整理得头头是道，很少有找不到自己的文件的情况，当然我自己也是这样的。可是有些时候使用桌面搜索引擎不是找得到找不到的问题，有时候要定位一个文件确实是比较麻烦的，即使你清楚地知道它在哪里。我自己体会最深刻的就是文档API。看看系统自带了多少文档吧：$ls-1/usr/share/doc/|wc-l 1486 1486项。挺吓人的数字，每次都输入/usr/share
pluskid·2007-05-31 11:00

Beagle the desktop search tool

阅读更多我所了解的人当中大多数都会把自己的磁盘整理得头头是道，很少有找不到自己的文件的情况，当然我自己也是这样的。可是有些时候使用桌面搜索引擎不是找得到找不到的问题，有时候要定位一个文件确实是比较麻烦的，即使你清楚地知道它在哪里。我自己体会最深刻的就是文档API。看看系统自带了多少文档吧：$ls-1/usr/share/doc/|wc-l14861486项。挺吓人的数字，每次都输入/usr/sha
pluskid·2007-05-31 11:00

avast! Virus Cleaner 1.0.210

VirusCleaneriscurrently(inversion1.0.210)abletoidentifyandremovethefollowingwormfamilies:-Win32:Badtrans[Wrm]-Win32:Beagle
starger·2007-03-21 08:32

avast! Virus Cleaner 1.0.210

VirusCleaneriscurrently(inversion1.0.210)abletoidentifyandremovethefollowingwormfamilies:-Win32:Badtrans[Wrm]-Win32:Beagle
starger·2007-03-21 08:32

在Windows上玩转Mono/Linux

MonoppixMonoLive这两个都包含mono运行环境和工具.MonoLive分发包中包含一些运行在Mono的程序例如beagle、tomboy.也包含一些asp.net程序。
张善友·2006-10-24 20:00
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