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KMer
GenomeScope评估基因组大小和杂合度
对于不同的基因组杂合度,
kmer
分布如下当杂合度为0.001时,只有一个峰;当杂合度为0.01和
生信修炼手册
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2019-12-26 00:26
jellyfish
kmer
_assembly (NEKTAR) 打碎再组装
https://github.com/gmarcais/Jellyfish/releases下载https://github.com/gmarcais/Jellyfish/releases/download/v2.2.3/jellyfish-2.2.3.tar.gz./configure--prefix=$HOME//make-j4makeinstall将bin下jellyfish加入环境路径中即
gong0037
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2019-04-04 13:50
基因组的重头组装
1.denovoassemblyDeBruijn图是目前二代测序序列最常用的拼接算法,该算法将已经非常短的reads再分割成更多个
kmer
短序列(k小于reads序列的长度),相邻的kmers序列通过(
lizg
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2018-11-26 22:09
Adam学习之7代码
kmer
.scala完善(统计和SaveAsFile)
Adam学习之7代码
kmer
.scala完善(统计和SaveAsFile)代码:packagetestAdam importorg.apache.spark._ importorg.bdgenomics.adam.rdd.ADAMContext
bob601450868
·
2016-03-07 11:00
scala
spark
Adam
Adam学习之6代码解读
kmer
.scala(附源码)
Adam学习之6源码解读
kmer
.scala代码:packagetestAdam importorg.apache.spark._ importorg.bdgenomics.adam.rdd.ADAMContext
bob601450868
·
2016-03-06 21:00
Adam学习3之ADAMContext类没有找到
Adam学习3之ADAMContext类没有找到问题:hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/testAdam34/
kmer
$.
bob601450868
·
2016-03-05 21:00
scala
spark
Adam
中国好声音为什么这么火:什么样的知识可卖、为什么存起来没人看?
为什么会火的探讨也很多,本文试图从信息和知识角度进行简单分析,希望能对内容制作、出版、
KMer
的人们有所启发。什么样的知识能够卖钱?
kmctianzhigang
·
2013-09-26 14:11
中国好声音
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