PICRUSt2

picrust2 预测功能

PhylogeneticInvestigationofCommunitiesbyReconstructionofUnobservedStates)是一个从标记基因（如16SrRNA,ITS等）测序数据预测功能丰度的软件.picrust2
超人立志做国王·2023-10-15 21:41

Picrust2学习

16S的细菌群落功能预测工具PICRUSt2学习2018年推出了全新版本的PICRUSt，即PICRUSt2（https://github.com/picrust/picrust2）PICRUSt2(PhylogeneticInvestigationofCommunitiesbyReconstructionofUnobservedStates
星空_2739·2023-04-09 11:58

PICRUSt2功能预测分析

16S高通量测序的群落数据分析中,更深层次的数据挖掘是很重要的一环,但是微生物群落标记基因测序的一个局限性就在于它无法提供有关采样群落功能组成的信息。所以我们引入了功能预测分析.“功能”通常指的是基因家族，如KEGG同源基因和酶分类号，但可以预测任何一个任意的特性。同样，预测通常基于16SrRNA基因测序数据，但也可以使用其他标记基因。正常来说,进行功能分析有多个研究方法可选:基于16S分析进行功
微基生物·2023-02-07 11:23

PICRUST2 16s扩增子群落功能预测 安装和使用

测试系统：WSL2Ubuntu20.04LTS1.照着Github一键安装condacreate-npicrust2-cbioconda-cconda-forgepicrust2=2.4.1-ycondaactivatepicrust2错误可能如下：（1）卡在Solvingenvironment，安装不上去，多半网络问题，多执行几次就好尽管我使用的也是清华源，但是因为前期设置的.condarc没有
leoxiaobei·2022-04-15 22:28

PICRUSt2安装及对16s数据进行功能预测

1.PICRUSt简介PICRUSt全称为PhylogeneticInvestigationofCommunitiesbyReconstructionofUnobservedStates，由Langille等人于2013年开发，文章发表在NatureBiotechnology上（Langilleetal.2013）。它是最早被开发的基于16SrRNA基因序列预测微生物群落功能的工具，包括在线版（h
大轮寺鸠摩智·2022-02-09 18:07

微生物群落基于KEGG预测功能的丰度分布图绘制

功能预测在基于16SrRNA扩增子的研究中，因为了解微生物群落功能的需要，我们经常会使用一些软件工具对16SrRNA扩增子数据进行功能预测，比如PICRUSt2。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:26

PICRUSt2：OTU/ASV等16S序列随意预测宏基因组，参考数据库增大10倍

现推出PICRUSt2https://github.com/picrust/picrust2具有以下三大优势：任何OTU/ASV直接预测功能；数据库扩大10倍；一条命令完成全部分析。
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:20
上一页 1 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他