论文笔记:BridgeDPI: a novel Graph Neural Network for predicting drug–protein interactions
2022Bioinformatics1introduction使用图神经网络预测药物和蛋白质的相互作用(DPI,drug-proteininteraction)目前预测药物和蛋白质相互作用的方式主要有以下几种:基于对接的方法(docking-based)使用分子动力学模拟重建蛋白质与药物在空间中的接触关系目标是寻找药物分子在蛋白质上结合的最佳位点缺点是需要精确的蛋白质结构,实际有时无法得到蛋白质的