python ml windows环境搭建 numpy(mkl)+scipy

cmd进入Python27\scripts （中有一个pip.exe就是 ）

pip install 库名

Windows下 缺少编译器 要自己下载 并且要下载numpy+mkl 版本（numpy不行）

网址：http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/

以SciPy为例：0.18.1是库版本号；cp27、cp35分别对应Python2.7、Python3.5；win32、win_amd64对应操作系统是32位、64 位，下载时应该根据自己电脑配置下载

eg. scipy-0.18.1-cp35-cp35m-win_amd64.whl

下载好了 (速度慢)

pip install 文件路径（包括文件名）

好了

//*************************************************************//

了解mkl：

　　Numpy+MKL is linked to the Intel® Math Kernel Library and includes required DLLs in the numpy.core directory.

Python下有很多关于机器学习的库，最常用的组合有一下四个:

　　numpy :主要用来做一些科学运算，主要是矩阵的运算。NumPy为Python带来了真正的多维数组功能，并且提供了丰富的函数库处理这些数组。它将常用的数学函数都进行数组化，使得这些数学函数能够直接对数组进行操作，将本来需要在Python级别进行的循环，放到C语言的运算中，明显地提高了程序的运算速度。
　　scipy：主要是一些科学工具集，信号处理工具集（如线性代数使用LAPACK库，快速傅立叶变换使用FFTPACK库）及数值计算的一些工具（常微分方程求解使用ODEPACK库，非线性方程组求解以及最小值求解等）。
　　scikit-learn：里面有很多机器学习相关的算法（如聚类算法，SVM等）。
　　matplotlib：是一个画图工具和Matlab中的画图工程类似。

//***************************************//

LFD,非官方的Windows二进制文件的Python扩展包

LFD,非官方版本、32和64位、Windows、二进制文件、科学开源、Python扩展包
克里斯托夫·戈尔克(by Christoph Gohlke)，LFD(荧光动力学实验室），加利福尼亚大学，Irvine,

网址：http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/

------------------------------

A
APSW，另一个Python Sqlite封装。
Aspell-python，Aspell软件的Python绑定
Assimulo，求解常微分方程的软件包,需要numpy + MKL。
Astropy，python天文学软件的核心包。
Atom，原子，高效的内存的Python对象,这个包与谷歌的GData有冲突。
Autopy，GUI自动化工具。

B
Babel，巴贝尔，Python程序的国际化工具。
Backports.lzma，通过Python 3.3测试的LZMA算法模块。
Basemap, 底图绘制，基于地质图的二维数据Matplotlib工具包。
Bazaar,集市，版本控制系统。
Bcolz，数据压缩容器。
BigFloat，任意精度的浮点运算，通过MPFR,取代gmpy2。
Bio_formats， JCC 生物软件包，需要Bio-Formats 和 SCIFIO Java库
Bioformats，读写生命科学文件格式:Bio-Formats,需要javabridge。
Biopython，生物计算工具。
BitArray，有效表示布尔值数组的对象类型。
Blaze，白斑是新一代的NumPy计算软件包。
Blender-mathutils，科学计算工具，提供矩阵，欧拉，四元数和向量功能。
Blist,泡，更好的列表list类型，支持大型list。
Blosc，二进制数据的高性能、优化库。
Blz，压缩数据容器（内存和磁盘）。
Bokeh，HTML5 canvas图形语法处理,需要很多依赖包。
Boost.Python，提供C++和Python之间无缝的互操作性。
Bottleneck,瓶颈，提供了快速的NumPy数组函数写在Cython。
Bsdiff4，bsdiff4格式工具。
BTrees，B树，数据结构，可扩展的持久对象的容器。

C
CArray，数据容器，可以压缩内存。
Cartopy，制图工具库。
Casuarius,鹤鸵，Cassowary约束求解工具。
Cdecimal，任意精度的十进制浮点运算。
Cellcognition，荧光的时间推移显微镜图像分析框架。
CellProfiler，生物图像定量分析软件。
ceoDBC，ODBC数据库API。
Certifi，认证，Mozilla的C工具。
Cffi，外部数调用的C代码接口，需要pycparser。
CGAL-bindings，计算几何算法库绑定。
Cgkit，计算机图形工具包，可处理三维数据。
Cheetah,猎豹，模板引擎和代码生成工具。
Conda，跨平台的，Python无关的二进制软件包管理器。需要pyyaml，pycosat，requests。
Console,控制台，一个简单的控制台界面。
Coverage，覆盖率，测试执行过程中，程序代码的覆盖率。
CRC16，计算CRC16（循环冗余校验）。
Crcmod，计算循环冗余校验（CRC）。
Curses,基于PDCurses模块库的延伸。不支持Unicode字符
Cvxopt（实验非MKL ICL建设），一个凸优化包,包括GSL，FFTW，和GLPK MPIR模块,需要numpy +MKL。
Cvxpy，一个凸优化问题的建模语言,需要numpy + MKL，SciPy，cvxopt，SC，和ecos。
cx_freeze，把Python脚本封装为可执行程序（如exe）的工具包。
Cyassimp，开放式assimp导入函数库。
Cython，用于编写Python的C扩展语言。
cytoolz，高性能的函数工具包。

D
Debug-information-files,安装Windows调试信息文件（*。PDB）。
Delny，生成n维Delaunay三角网格，使用libqhull。
Dipy，MR扩散成像分析工具箱。
Django，最流行的Web框架。
Docutils，python文档工具
Dulwich，Git函数库
DyND,，绑定到libdynd C++动态ndarray模块库。

E
ECos，求解嵌入式二次曲线。
Enaml，用最少的资源，创建用户界面的编程语言和框架。
Entropy,熵，熵的快速计算。
Epydoc，用于生成模块API的文档工具。
ETS（enthought工具套件），科学计算的应用组件的集合。

F
Fann2, fann2绑定快速人工神经网络的模块库。
Fastcluster，提供快速层次聚类例程。
Faulthandler，回溯追踪、显示Python运行错误。
Ffnet，前馈神经网络。
Fiona,菲奥娜，OGR的API,需要GDAL。
Fipy，有限体积偏微分方程求解,需要pysparse。
Fisx，增强C + +端口所使用的pymca物理例程。
Fonttools，字体工具库（Python 3源码）。
Freeimagedll，安装FreeImage DLL系统。
Friture，实时音频输入分析。

G
GDAL（Geospatial Data AbstractionLibrary），栅格地理空间数据格式转换库。包括一个完整的GDAL的安装。不要同时使用osgeo4w或gdalwin32。
Genshi，用于生成产生输出web网页。
Gensim，快速的向量空间模型框架。
Gevent，基于网络工具库，基于greenlet、libevent。
Glumpy，Numpy和现代OpenGL之间的天然的接口。
GMPY，支持快速多精度算术,封装了MPIR，MPFR，和MPC的模块库。
GR，跨平台可视化应用的通用框架。
Greenlet,轻量级并行编程。
GuiQwt，一个高效的2D绘图库,需要pyqwt。

H
H5py，通用的HDF5接口库。
HDDM，实现漂移-扩散模型的分层贝叶斯分析。
Holopy，数字全息图和光散射的工具。
HTSeq，处理从高通量测序检测数据。

I
Ilastik，互动学习和分割工具。
Imread，读取图像到NumPy数组。
Intbitset，intbitset数据对象。
IOCBio，系统生物学实验室的开源软件,需要numpy + MKL。
Iris,虹膜，用于分析和可视化气象和海洋数据集

J
Javabridge，为Java本地接口封装
JCC，C + +代码生成器，生成一个C + +对象接口，封装一个Java库，通过Java本地接口（JNI）。
Jinja2，文本模板引擎,需要markupsafe。
JPype,允许完全访问Java类库
Jsonlib，JSON解释器

K
Kivy,基维，开发多点触摸应用程序模块库，需要pygame
Kiwisolver，约束求解算法的高效实现。
Kwant，简单的量子传输模拟,需要numpy + MKL和tinyarray。

L
La，标记NumPy数组。
Lazyflow，基于数据流图的NumPy
LibLAS，读取和写入 LiDAR（光探测和测距）格式数据。
LIBLINEAR，线性分类模块库,需要numpy + MKL
Libpython，安装libpython系统模块库,使用mingw64和rtools。
libSBML，读，写，操纵，传送，并验证SBML（系统生物学标记语言）文件和数据流。
LIBSVM，SVM向量机模块库。
Libtfr，计算多锥度窗口和时频重排谱图,需要numpy + MKL。
Libxml-python，是libxml2和libxslt库的绑定
Line_profiler，代码检测
Llist，提供链表的数据结构
Llvmlite，写一个轻量级的LLVM编译器绑定。
LLVMPy，LLVM编译器封装
Lmfit，带约束条件的最小二乘最小化。
lp_solve，混合整数线性规划（MILP）求解
Lsqfit非线性最小二乘拟合
Lxml，绑定的libxml2和libxslt模块库

M
Mahotas，图像处理。
Mako,灰鲭鲨，快速的模板语言
Marisa-trie，提供静态、高效的内存trie树结构。
MarkupSafe，标记XML或HTML/XHTML安全字符串。
Matplotlib，著名的2D绘图库,类似matlab
Mercurial，快速的可扩展的SCM版本控制系统
MeshPy，生成高质量的三角形和四面体网格
Milk,牛奶，机器学习工具
Minepy，最大非参数分析
Mistune，失谐，纯Python版本的Markdown解析器。
Mlpy，机器学习模块
mmLib，Python的大分子模块库
MMTK（分子模拟工具包），分子模拟应用程序库
Mod_wsgi，Apache服务器WSGI工具模块库
Mpi4py,绑定消息传递接口（MPI）标准,要求微软MPI V5。
Msgpack，高效的二进制序列化格式
mxBase，包含mxdatetime，mxTextTools，mxtools，等模块库
Mysqlclient，Python 3兼容的叉MySQL的Python模块库。
Mysqlclient，MySQL数据库的Python接口。

N
Natgrid，网格，不规则数据的natgrid C库的接口
NetCDF4，读取和写入NetCDF和HDF5文件
NetworkX，一个复杂的网络包。
NiBabel，访问神经影像文件格式
Nipype，神经影像学检查模块库接口
NiTime，神经科学实验数据的时间序列分析模块库
NLopt，非线性优化模块库
NLTK，自然语言工具包。
nMOLDYN，分子动力学模拟的交互式分析程序。
Noise,噪声，产生的Perlin（柏林）/ Simplex噪声
Nose,鼻子,简化测试单元
Numba，NumPy的动态编译库,需要numpy + MKL和llvmlite
Numexpr，快速数值数组表达式计算器,需要numpy + MK
NumPy（NumPy + MKL），科学计算所需要的基本包, NumPy + MKL是静态链接到英特尔数学核心函数库。

O
ODE，开放动力学引擎，用于模拟刚体动力学的高性能模块库。
OpenBabel，开放源码的化学工具箱
OpenCV，计算机视觉库
OpenGLContext，pyopengl测试和学习环境
OpenImageIO，用于读写动画和视觉效果图像库,包括OpenColorIO。
OpenPIV，粒子图像测速技术（PIV）包
Orange，橙色，机器学习与交互式数据挖掘工具箱
Oursql，MySQL数据库绑定

P
Pandas，时间序列数据分析工具包
Patsy,帕西，统计模型和建筑设计矩阵包
Persistent，持久的，透明的持久对象
Pgmagick，graphicsmagick图像库的另一封装
Pillow，Python图像库PIL的替代工具，提供图像处理功能，支持多种文件格式。
Pims，Python的序列图像，视频工具
Pip，Python包安装推荐工具
Planar,平面，二维平面几何库
Pmw，使用Tkinter模块构建高层次复合控件的工具箱
Polygon,二维多边形处理模块库，非商业用途免费。
Polymode，微结构光纤的模态分析。
Psutil，提供有关正在运行的进程和系统利用率的信息
PsychoPy，心理学和神经科学的软件
Psycopg，PostgreSQL数据库接口。
PuLP，采用coinmp模块库的LP模型,需要pyparsing。
Py-fcm，用于流式细胞库
Py-lmdb，LMDB雷电数据库工具
py2exe，Python脚本转换成可执行的exe程序
PyAlembic，Alembi计算机图形交换框架,包括OpenEXR pyilmbase
PyAMF,提供动态消息格式（AMF）的支持
PyAMG，多重网格（AMG）求解模块库
PyAudio,PortAudio模块库，支持ASIO，DS，wmme，WASAPI，wdmks
PyBluez，蓝牙工具。
PyBox2D，二维Box2D物理运动模块库
Pycairo，开罗图形库，不兼容PyGTK和wxPython
Pycares，c-ares接口
PyCifRW，CIF文件支持模块
PyCluster，基因数据聚类分析
PyCogent，基因组生物学软件库
Pycosat，PicoSAT卫星的SAT求解工具。
Pycparser，一个完整的C语言解析器
PyCUDA，NVIDIA的GPU并行计算API，需要pytools，CUDA6.5，NVIDIA驱动程序，msvc编译器
PycURL，libcurl接口库
PyDbg，Win32调试界面,包括pydasm反编译模块库
PyDDE，时滞微分方程系统的数值解算器（DDES）。
PyEDA，电子设计自动化的模块库
PyEMD，地球移动距离计算。
PyEphem，星历，科学级的天文计算
Pyexiv2，exiv2图像元数据模块库。
PyFITS，FITS格式的文件接口。
pyFLTK，快速、轻量级、跨平台、图形用户界面库。
PyFMI，加载和交互功能实体单元（FMUs）,需要numpy + MKL，assimulo，lxml和SciPy。
pygame，基于SDL的游戏模块库
pygit2，libgit2共享库
pyglet，跨平台的窗口和多媒体库，使用AVbin。
pygments，通用的语法高亮模块库
PyGraphviz，图像布局和可视化软件包,需要graphviz-2.38
PyGTK，GTK+库封装。
PyHDF，NCSA HDF4接口库
PyHook，用于Windows全局输入钩子函数的封装
PyICU, ICU（Unicode国际成分）模块库。
PyISAPIe，IIS的ISAPI扩展
PyLibDeconv，deconv封装库,需要numpy + MKL。
PyLibTiff，读写TIFF和LSM文件包
PyLZMA，LZMA压缩库接口
PyMC，蒙特卡罗，马尔可夫链工具,需要numpy + MKL。
PyMca，X射线荧光数据分析工具包
PyMedia，媒体文件操作模块。
PyMetis，METIS图工具包
PyMinui，Minuit接口，n维函数。
PyMix，算法和数据结构在数据挖掘中的应用
PyMOL，分子渲染和动画，3D分子结构可视化产品。
Pymongo，Mongo数据库的驱动程序
Pymssql MS SQL的Python扩展模块
Pymunk，建立在顶部的2D物理模块库
pymutt，多锥傅立叶谱估计,需要numpy + MKL
PyMVPA，多元模式分析
PyODBC，开放数据库连接（ODBC）接口。
PyOpenCL，通向OpenCL并行计算接口API,需要pytools
PyOpenGL,3D图像函数库OpenGL接口
pypmc，自适应抽样工具包
pyproj，PROJ接口
PyQt4，Qt4应用框架
PyQwt，NumPy数据绘图
Pyropes，可扩展性和高效率的字符串
pyRXP，快速，XML验证解析器
Pyserial，串行端口的访问模块
PySFML，简单、快速的SFML多媒体库接口
PySide，QT跨平台应用程序和用户界面框架
PySparse，快速稀疏矩阵库。
pyspharm，球面调和变换模块
pysqlite，SQLite数据库接口。
PyStemmer，单词计算、分析
PyTables，层次数据管理工具，基于HDF5库,需要numexpr。
tables 3.1.1 cp33 none win32.whl, tables 3.1.1 cp33 nonewin_amd64.whl, tables 3.1.1 cp34 none win32.whl, tables 3.1.1 cp34none win_amd64.whl,
Python-cjson，快速JSON编码器/解码器
Python-Dateutil，扩展标准datetime模块。
Python-igraph，高性能图形库接口
Python-ldap，面向对象的API，通过OpenLDAP访问LDAP目录服务器。
Python-Levenshtein，计算字符串相似之处。
python-lz4，为lz4压缩模块库
Python-LZO，对LZO数据压缩库
Python-snappy，压缩模块库。
Python-sundials，日晷，一个日晷求解器套件，Cython封装。
PythonMagick，面向对象的ImageMagick接口库
PythonNET，集成的.NET通用语言运行库（CLR）和应用程序的脚本工具。
pytools，工具集
PyTST，三元搜索树模块
pytz，世界时区的定义
PyViennaCL，用于GPGPU和异构系统的viennacl线性代数和数值计算库。
PyVISA，绑定到“虚拟仪器软件架构“VISA库
PyVRML97，VRML场景建模
PyWavelets，离散小波包变换,基于Ralf Gommers分支。
PyWCS，世界坐标系统库封装
PyX，PostScript和PDF文件生成模块库
PyXML，XML处理
PyYAML，YAML解析器
PyZMQ，绑定到ZeroMQ消息库,基于OpenPGM

Q
Qimage2ndarray，快速转换，qimages和NumPy之间
QuantLib，定量金融学模块库
QuickFIX，金融信息交换（FIX）协议引擎
QuTiP，模拟开放量子系统的动力学,需要numpy + MKL

R
RasterIO，提供清洁、快速和地理空间栅格的I/O ,需要GDAL。
RE2，正则表达式库封装。
Regex，正则表达式模块
ReportLab，PDF生成工具
Requests，人性化的HTTP模块库。
rpy2，用于统计计算和图形显示的R语言接口。需要R 3.1
Rtree，R树，空间索引，基于libspatialindex

S
ScientificPython，科学计算模块的集合
Scikit-fmm,快速行进法, scikit_fmm 0.0.6 CP26没有Win32。WHL , scikit_fmm0.0.6 CP26不win_amd64。WHL
scikit_image,SciPy图像处理例程
Scikit-learn,经典机器学习算法,需要numpy + MKL
scikits.ann，近似最近邻网络模块库的封装。
scikits.audiolab，音频文件IO库，使用numpy数组封装
scikits.delaunay，三角插值工具
scikits.hydroclimpy，操纵水文气候数据,需要numpy + MKL
scikits.odes，常微分方程（ODE）求解器SciPy,需要numpy + MKL
scikits.samplerate，高质量的音频重采样模块。
scikits.scattpy执行光散射模拟,需要numpy + MKL。
scikits.timeseries，各种频率的时间序列类和函数，包括处理，报告，绘图。
scikits.umfpack，UMFPACK不对称稀疏线性系统的求解。
scikits.vectorplot，线积分卷积算法绘制矢量域
SciPy，数学，科学，工程软件库,需要numpy + MKL和可选的太平。
Scipy-cluster，集群，聚类分析功能
SciTools，是科学计算的工具包。
SCons，软件工程工具
SCS（非MKL建立），求解大规模问题的C++封装的凸锥
SendKeys，模拟键盘，用来向活动窗口发送键击。
Setproctitle，定制过程标题
Setuptools，下载，安装，升级，构建，和卸载Python包
Shapely,几何对象模块库，创建，操作、分析平面对象
SilverCity，词法分析程序包，基于Scintilla
SimpleITK，图像分割与配准工具包
simplejson，简单，快速，可扩展的JSON编码器/解码器
Six，Python 2和3兼容的模块库
Sparsesvd，SVDLIBC封装，用于计算奇异值分解的模块库
Spyder，科学计算的Python开发环境
SQLAlchemy，SQL工具包和对象关系映射
Statsmodels，统计模型类和函数库，需要pandas、patsy
STEPS,步骤，随机路径模拟引擎。
sympy，符号数学库

T
TA-Lib，TA-LIB技术分析库封装。
Thrift，可扩展的、跨语言、软件开发框架
tinyarray，优化数组模块。
Tornado,龙卷风，可扩展的，非阻塞Web服务器
trackpy，粒子跟踪工具
trfit，时间分辨荧光衰减软件包
Triangle，Triangle的封装，二维网格生成模块库
TWAINmodule,扫描仪TWAIN接口模块
Twisted，扭曲，事件驱动网络引擎

U
UDUNITS，支持物理量的单位软件包
ujson，超快速的JSON编码器和解码器
umysql，超快速的MySQL驱动程序。

V
Veusz，GUI科学绘图和图形包,需要PyQt4
VideoCapture,视频采集，视频设备软件包
VIGRA,维格拉（泛型视觉算法），计算机视觉库。需要numpy + MKL

virtualenv，Python虚拟环境建造
vispy，交互式、可视化OpenGL
Visvis,面向对象的、1D-4D数据可视化模块库
ViTables，GUI软件包，浏览PyTables和HDF5格式编辑的文件
vLFD，LFD（荧光动力学实验室）开发的软件包,需要numpy +MKL，SciPy，Matplotlib，和h5py。
VPython，3D编程,需要ttfquery，fonttools，和Polygon, ttfquery
VTK（Visualization Toolkit），三维计算机图形，图像处理、和可视化软件系统，。

W
WFastCGI，提供的IIS的FastCGI支持Python WSGI协议之间的网关
wxPython，绑定到wxWidgets的跨平台工具包

Y
Yappi，另一个Python分析器，支持多线程、CPU时间优化
YT，多分辨率的数据可视化分析模块库。

Z
zfec，实现“纠删码”，或“前向纠错码”。
ZODB，Zope对象数据库，面向对象的数据库
zodbpickle，统一的ZODB接口界面
Zope.interface，Zope软件的Python对象接口
ZS，数据压缩，只读文件格式

 

-------------------------------
其他的Python扩展包

A
AIDA，自适应的图像反卷积算法,
ALGLIB，跨平台的数值分析和数据处理库。

B
BALLView，分子建模和可视化应用
Biogeme，行离散选择模型的估计。
BioImageXD，多维生物医学图像可视化分析软件。
BisQue（生物图像的语义查询用户环境），存储，可视化，组织和分析的云图像。

C
CasADi，实现向前和伴随模式自动分化
CGAL-Python, Python的CGAL，CGAL计算几何算法库模块库
coloc_utils，计算定位系数,从共聚焦图像,密码暴露的密码原语和食谱。

D
DeVIDE，为医学可视化,和图像处理技术的,快速成形数据流应用程序生成器。
dpmix，大规模、混合模型拟合模块库。

E
EMAN2，灰度图像处理套件，用于透射电子显微镜。支持多种图像格式。

F
FARSIGHT，基于Bio-Formats生物格式，显微图像分析的工具包

G
Gexiv2，GObject图像元数据封装。
GHMM，隐马尔可夫模型库
Graph-tool,图形工具，用于操纵和图表统计分析模块库。

I
ITK（Insight分割和配准工具包），用于图像分析软件系统,

M
M2Crypto，OpenSSL完整的封装包。
Mantid,螳螂，高性能计算、科学数据可视化框架
MathGL, 科学数据可视化库。
MDP，数据处理模块和工具包,质谱的工具,
MMCorePy，控制显微镜硬件。
Msim，多细胞生物的超分辨荧光显微镜

N
ncrypt，OpenSSL封装包。
NIPY，结构和功能神经影像学数据分析,需要numpy + MKL
Nodebox-GL，用于产生二维动画库。
Numeric，NumPy的替代工具

O
OpenEXR，ILM的OpenEXR格式的图像文件绑定。
OpenKinect，访问Xbox的Kinect装置,需要libusb 1.2.6。
OpenMDAO，多学科分析和优化设计（麦道）框架。
OpenSlide，读取幻灯片图像，支持超过内存大小的、高分辨率图像

P
Panda3D，3D渲染和游戏开发框架。
ParticleStats，细胞内颗粒运动和细胞骨架的极性分析。
Peak_detection实现Segré等人所描述的高斯峰值检测。
PolyVox，用于存储和处理空间环境中的模块库
priithon，图像分析和算法开发平台，支持读取HIS，SDT，SIF，和SPE文件
Py-bcrypt，OpenBSD的Blowfish密码哈希代码。
PyAudiere，高级音频接口使用Audiere音色库
pyCGNS，提供CGNS/SIDS数据模型的接口。
PyCorrFit，通用的FCS数据分析工具
PyCrypto，提供加密模块。
PyDSTool，动力系统建模，环境模拟与分析。
pyffmpeg，ffmpeg封装，解决记录，转换和流音频和视频
PyFFTW3，绑定FFTW C语言库。
PyGreSQL，PostgreSQL数据库接口
pygrib，用于读取GRIB气象文件模块。
PyGSL，GNU科学模块库接口（GSL）
pyGst，GStreamer多媒体框架接口。
pykit，高层次的代码后端编译器。
PyMe，Python显微镜环境，提供了图像采集和数据分析功能。
pymex，在MATLAB嵌入Python，
pyNFFT，NFFT模块库封装。
PyNIfTI，提供访问和分析NifTI文件
Pyo，数字信号处理模块,
PyODE，开放的动力学引擎绑定。
pyOpenSSL，OpenSSL接口库
PyQt5，QT5应用框架。
PyReadline，基于Windows的Readline。
pysam，读取和操作：SAM核苷酸序列比对文件模块
pysifreader，读取和Andor SIF(应力强度因子)的多通道图像文件。
PySUNDIALS,SUNDIALS日晷套件接口
PySVN,Subversion版本控制系统接口。
Python-Ogre,Ogre 3D图形库接口
pythonisosurfaces，Marching Cubes等值面实施模块库。
PythonOCC，3D CAD/CAE/PLM开发框架

R

RootPy,提供Root根数据分析框架上的pyroot接口。

S
Scikit-bio,生物信息学的教育资源,数据结构，算法。
Scikit-tracker,目标检测和细胞生物学的鲁棒跟踪
Sherpa,夏尔巴人，建模和拟合中的应用。
SimpleCV,计算机视觉应用的框架
SMC.FreeImagesmc.freeimage，对FreeImage库封装。
SpacePy，空间科学共同体spacepy工具
Stdic,计算图像间的变形函数（图像配准）。
STScI_python,通用的天文数据分析基础

V
VIPS,贵宾，没有图像大小限制的图像处理库。
VisionEgg,视觉研究实验模块库