perftools查看堆外内存并解决hbase内存溢出

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    最近线上运行的hbase发现分配了16g内存,但是实际使用了22g,堆外内存达到6g。感觉非常诡异。堆外内存用一般的工具很难查看,可以通过google-perftools来跟踪:
http://code.google.com/p/google-perftools/downloads/list
    它的原理是在java应用程序运行时,当调用malloc时换用它的libtcmalloc.so,这样就能做一些统计了
  • 下载http://download.savannah.gnu.org/releases/libunwind/libunwind-0.99-beta.tar.gz,configure;make;sudo make install
  • 下载http://google-perftools.googlecode.com/files/google-perftools-1.8.1.tar.gz, configure --prefix=/home/user/perftools;make;sudo make install
  • 在应用程序启动前加入:export LD_PRELOAD=/home/hadoop/perftools/lib/libtcmalloc.so以及export HEAPPROFILE=/home/user/perftools/test
  • 修改lc_config:sudo vi /etc/ld.so.conf.d/usr_local_lib.conf,加入/usr/local/lib(libunwind的lib所在目录)
  • 执行sudo /sbin/ldconfig,使libunwind生效
  • 启动应用程序,此时会在/home/user/perftools/下看到诸如test_pid.xxxx.heap的heap文件,可使用bin/pprof --text $JAVA_HOME/bin/java test_pid.xxxx.heap来查看


    通过perftools查看到以下内容:
Total: 3263.2 MB
  3145.2  96.4%  96.4%   3145.2  96.4% zcalloc
    83.8   2.6%  99.0%     83.8   2.6% os::malloc
    30.0   0.9%  99.9%     30.0   0.9% init
     2.2   0.1%  99.9%      2.2   0.1% ObjectSynchronizer::omAlloc
     1.0   0.0% 100.0%   3144.1  96.4% Java_java_util_zip_Deflater_init
     0.6   0.0% 100.0%      0.7   0.0% readCEN

    可见调用了java.util.zip.Deflater占用绝大多数。了解到这个deflater存在无法释放内存的bug,于是编写btrace查看是否进入了这个函数:
import static com.sun.btrace.BTraceUtils.*;
import com.sun.btrace.annotations.*;

import java.nio.ByteBuffer;
import java.lang.Thread;

@BTrace public class TestRegion1{
   @OnMethod(
      clazz="java.util.zip.Deflater",
      method="deflate"
   )
   public static void traceCacheBlock(){
println("deflate?");
   }
}

    发现果然在不停调用这行代码。应该如何办呢?
  由于deflater是gzip需要使用的代码,查看用户创建的表,发现COMPRESSOR设置的是GZ,尝试调整为LZO,结果发现btrace无法进入上述代码,再通过perftools查看时,堆内存不再申请,完全不再申请...
  小插曲,perftools的作者是个老实人,提供了zip版下载,但是不提供安装文件,原因?在README中有以下一段话:
  
I don't know very much about how to install DLLs on Windows, so you'll
have to figure out that part for yourself.

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