spark 内存分配

一个Executor对应一个JVM进程。

Spark的角度看,Executor占用的内存分为两部分:ExecutorMemoryMemoryOverhead


一、ExecutorMemory

ExecutorMemoryJVM进程Java堆区域。大小通过属性spark.executor.memory设置。也可以在spark-submit命令时用参数--executor-memory设置。

 

用于缓存RDD数据memoryStore位于这一区域。

 

memoryStore占用空间的比例通过属性spark.storage.memoryFractionspark.storage.safetyFraction控制

相关源码:

[java] viewplain copy

  1. //core/src/main/scala/org/apache/spark/storage/BlockManager.scala  

  2. /** Return the total amount of storage memory available. */  

  3. private def getMaxMemory(conf: SparkConf): Long = {  

  4.   val memoryFraction = conf.getDouble("spark.storage.memoryFraction", 0.6)  

  5.   val safetyFraction = conf.getDouble("spark.storage.safetyFraction", 0.9)  

  6.   (Runtime.getRuntime.maxMemory * memoryFraction * safetyFraction).toLong  

  7. }  



所以,一个Executor用于存储RDD的空间=(ExecutorMemory– MEMORY_USED_BY_RUNTIME)* spark.storage.memoryFraction *spark.storage.safetyFraction

 

 

二、MemoryOverhead

MemoryOverheadJVM进程中除Java以外占用的空间大小,包括方法区(永久代)、Java虚拟机栈、本地方法栈、JVM进程本身所用的内存、直接内存(DirectMemory等。通过spark.yarn.executor.memoryOverhead设置,单位MB

相关源码:

[java] viewplain copy

  1. //yarn/common/src/main/scala/org/apache/spark/deploy/yarn/YarnSparkHadoopUtil.scala  

  2.   val MEMORY_OVERHEAD_FACTOR = 0.07  

  3.   val MEMORY_OVERHEAD_MIN = 384  

  4.   

  5. //yarn/common/src/main/scala/org/apache/spark/deploy/yarn/YarnAllocator.scala  

  6.   protected val memoryOverhead: Int = sparkConf.getInt("spark.yarn.executor.memoryOverhead",  

  7.     math.max((MEMORY_OVERHEAD_FACTOR * executorMemory).toInt, MEMORY_OVERHEAD_MIN))  

  8. ......  

  9.       val totalExecutorMemory = executorMemory + memoryOverhead  

  10.       numPendingAllocate.addAndGet(missing)  

  11.       logInfo(s"Will allocate $missing executor containers, each with $totalExecutorMemory MB " +  

  12.         s"memory including $memoryOverhead MB overhead")  



 

三、相关问题

如果用于存储RDD的空间不足,先存储的RDD的分区会被后存储的覆盖。当需要使用丢失分区的数据时,丢失的数据会被重新计算

如果Java或者永久代的内存不足,则会产生各种OOM异常,executor会被结束。spark会重新申请一个Container运行executor。失败executor上的任务和存储的数据会在其他executor上重新计算。

如果实际运行过程中ExecutorMemory+MemoryOverhead之和(JVM进程总内存)超过container的容量。YARN会直接杀死containerexecutor日志中不会有异常记录。spark同样会重新申请container运行executor



Java以外的JVM进程内存占用较多的情况下,应该将MemoryOverhead设置为一个足够大的值,应该将MemoryOverhead设置为一个足够大的值,以防JVM进程因实际占用的内存超标而被kill。如果默认值math.max((MEMORY_OVERHEAD_FACTOR*executorMemory).toInt,MEMORY_OVERHEAD_MIN不够大,可以通过spark.yarn.executor.memoryOverhead手动设置一个更大的值。


Spark统一内存管理

1.6.0的统一内存管理如下:

spark 内存分配_第1张图片
Spark-Memory-Management-1.6.0

主要有三部分组成:

1 Reserved Memory

这部分内存是预留给系统使用,是固定不变的。在1.6.0默认为300MB(RESERVED_SYSTEM_MEMORY_BYTES = 300 * 1024 * 1024),这一部分内存不计算在spark execution和storage中,除了重新编译spark和spark.testing.reservedMemory,Reserved Memory是不可以改变的,spark.testing.reservedMemory不推荐使用在实际运行环境中。是用来存储Spark internal objects,并且限制JVM的大小,如果executor的大小小于1.5 * Reserved Memory = 450MB ,那么就会报 “please use larger heap size”的错误,源码如下。

    val minSystemMemory = reservedMemory * 1.5
    if (systemMemory < minSystemMemory) {
      throw new IllegalArgumentException(s"System memory $systemMemory must " +
        s"be at least $minSystemMemory. Please use a larger heap size.")
    }

2 User Memory

分配Spark Memory剩余的内存,用户可以根据需要使用。可以存储RDD transformations需要的数据结构,例如, 重写spark aggregation,使用mapPartition transformation,通过hash table来实现aggregation,这样使用的就是User Memory。在1.6.0中,计算方法为(“Java Heap” – “Reserved Memory”) * (1.0 – spark.memory.fraction),默认为(“Java Heap” – 300MB) * 0.25,比如4GB的heap大小,那么User Memory的大小为949MB。由用户来决定存储的数据量,因此要遵守这个边界,不然会导致OOM。

3 Spark Memory

计算方式是(“Java Heap” – “Reserved Memory”) * spark.memory.fraction,在1.6.0中,默认为(“Java Heap” – 300MB) * 0.75。例如推的大小为4GB,那么Spark Memory为2847MB。Spark Memory又分为Storage MemoryExecution Memory两部分。两个边界由spark.memory.storageFraction设定,默认为0.5。但是两部分可以动态变化,相互之间可以借用,如果一方使用完,可以向另一方借用。先看看两部分是如何使用的。

  • Storage Memory 用来存储spark cached data也可作为临时空间存储序列化unrollbroadcast variables作为cached block存储,但是需要注意,这是unroll源码,unrolled block如果内存不够,会存储在driver端。broadcast variables大部分存储级别为MEMORY_AND_DISK

  • Execution Memory 存储Spark task执行过程中需要的对象,例如,Shuffle中map端中间数据的存储,以及hash aggregation中的hash table。如果内存不足,该空间也容许spill到磁盘。

Execution Memory不可以淘汰block,不然执行的时候就会fail,如果找不到block。Storage Memory中的内容可以淘汰。Execution Memory满足两种情况可以向Storage Memory借用空间:

  1. Storage Memory还有free空间

  2. Storage Memory大于初始化时的空间("Spark Memory" * spark.memory.storageFraction = (“Java Heap” – “Reserved Memory”) * spark.memory.fraction * spark.memory.storageFraction)

Storage Memory只有在Execution Memory有free空间时,才可以借用




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