转录组测序2

转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA(non-coding

RNA,ncRNA)。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定的生物学过程,已广应用于植物候选基因发掘、功能鉴定及遗传改良等领域。


转录组测序2_第1张图片

    随着新一代测序平台的市场化,RNA测序(RNAsequenclng,RNA-Seq)技术已成为了转录组学研究的重要手段之一。该技术利用新一代高通量测序平台对基因组cDNA测序,通过统计相关Reads(用于测序的cDNA小片段)数计算出不同mRNA的表达量,分析转录本的结构和表达水平,同时发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及编码序列单核苷酸多态性,提供最全面的转录组信息。

         转录组测序技术流程主要包括样品制备、文库构建、DNA成簇扩增、高通量测序和数据分析,相对于传统的芯片杂交平台,RNA-Seq技术具有诸多独特优势,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号、更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组的强大工具

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