Pandas 中 SettingwithCopyWarning 的原理和解决方案

Pandas 中 SettingwithCopyWarning 的原理和解决方案


原文链接:https://www.dataquest.io/blog/settingwithcopywarning/
原文标题:Understanding SettingwithCopyWarning in pandas
原文发布时间:5 JULY 2017(需要注意时效性,文中有一些方法已经弃用,比如 ix)

学习 Python 数据分析的同学总是遇到这个警告,查询中文资料,一般只能找到个别的解决办法,不一定适用于自己遇到的情况。查到的最常见解决办法就是直接设置为不显示警告。这实际上并不能解决问题,搜索资料发现这篇英文讲解 SettingWithCopyWarning原理非常系统的文章,翻译了一下,分享给大家。

太长不看

  • 解决方案:学会识别链式索引,不惜一切代价避免使用链式索引

    注意:如果你看不懂这里的解决方案,请阅读此文前半部分,直到真正理解如何去做

    • 如果要更改原始数据,请使用单一赋值操作(loc):
    data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', 'bidderrate'] = 100
    
    • 如果想要一个副本,请确保强制让 Pandas 创建副本:
    winners = data.loc[data.bid == data.price].copy() 
    winners.loc[304, 'bidder'] = 'therealname'
    
  • 强烈不推荐直接关闭警告,不过还是提供一下关闭警告的设置方法:

pd.set_option('mode.chained_assignment', None)
  • 深度解析底层代码和历史演变(可选阅读)

Pandas 中 SettingwithCopyWarning 的原理和解决方案_第1张图片

题图

SettingWithCopyWarning 是人们在学习 Pandas 时遇到的最常见的障碍之一。搜索引擎可以搜索到 Stack Overflow 上的问答、GitHub issues 和一些论坛帖子,分别提供了该警告在某些特定情况下的含义。会有这么多人同样遇到这个警告并不奇怪:有很多方法可以索引 Pandas 数据结构,每种数据结构都有各自的细微差别,甚至 Pandas 本身并不能保证两行代码的运行结果看起来完全相同。

本指南包含了生成警告的原因及解决方案,其中还包括一些底层细节,让你更好地了解代码内部的运行机制,最后提供了有关该话题的一些历史情况,解释代码底层以这样的方式运行的原因。

为了探索 SettingWithCopyWarning,我们将使用 eBay 3 天拍卖出售的 Xbox 的价格数据集,该数据集出自 Modelling Online Auctions 一书。先来了解下数据的基本结构:

import Pandas as pd

data = pd.read_csv('xbox-3-day-auctions.csv')
data.head()
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price
0 8213034705 95.0 2.927373 jake7870 0 95.0 117.5
1 8213034705 115.0 2.943484 davidbresler2 1 95.0 117.5
2 8213034705 100.0 2.951285 gladimacowgirl 58 95.0 117.5
3 8213034705 117.5 2.998947 daysrus 10 95.0 117.5
4 8213060420 2.0 0.065266 donnie4814 5 1.0 120.0

如你所见,数据集的每一行都是某一次 eBay Xbox 出价信息。下面是对数据集中每列的简要说明:

  • auctionid - 每次拍卖的唯一标识符
  • bid - 本次拍卖出价
  • bidtime - 拍卖的时长,以天为单位,从投标开始累计
  • bidder - 投标人的 eBay 用户名
  • bidderrate - 投标人的 eBay 用户评级
  • openbid - 卖方为拍卖设定的开标价
  • price - 拍卖结束时的中标价

什么是 SettingWithCopyWarning?

首先要理解的是,SettingWithCopyWarning 是一个警告 Warning,而不是错误 Error。

错误表明某些内容是“坏掉”的,例如无效语法(invalid syntax)或尝试引用未定义的变量;警告的作用是提醒编程人员,他们的代码可能存在潜在的错误或问题,但是这些操作在该编程语言中依然合法。在这种情况下,警告很可能表明一个严重但不容易意识到的错误。

SettingWithCopyWarning 告诉你,你的操作可能没有按预期运行,需要检查结果以确保没有出错。

如果代码确实按预期工作,那么我们会很容易忽略该警告,但是 SettingWithCopyWarning不应该被忽略。在进行下一步操作之前,我们需要花点时间了解这一警告显示的原因。

要了解 SettingWithCopyWarning,首先要知道,Pandas 中的某些操作会返回数据的视图(View),某些操作会返回数据的副本(Copy)。

Pandas 中 SettingwithCopyWarning 的原理和解决方案_第2张图片

View VS Copy

如上所示,左侧的视图 df2 只是原始数据 df1 一个子集,而右侧的副本创建了一个新的对象 df2

当我们尝试对数据集进行更改时,这可能会出现问题:

Pandas 中 SettingwithCopyWarning 的原理和解决方案_第3张图片

修改视图或副本

根据需求,我们可能想要修改原始 df1(左),也可能想要修改 df2(右)。警告让我们知道,代码可能并没有符合需求,修改到的可能并不是我们想要修改的那个数据集。

稍后会深入研究这个问题,但是现在先来了解一下,警告出现的两个主要原因以及对应的解决方案。

链式赋值(Chained Assignment)

当 Pandas 检测到链式赋值(Chained Assignment)时会生成警告。为了方便后续的解释,先来解释一些术语:

  • 赋值(Assignment) - 设置某些变量值的操作,例如 data = pd.read_csv('xbox-3-day-auctions.csv') ,有时会将这个操作称之为 设置(Set)
  • 访问(Access) - 返回某些值的操作,具体参照下方的索引和链式索引示例。有时会将这个操作称之为 获取(Get)
  • 索引(Indexing) - 任何引用数据子集的赋值或访问方法,例如 data[1:5]
  • 链式索引(Chaining) - 连续使用多个索引操作,例如data[1:5][1:3]

链式赋值是链式索引和赋值的组合。先快速浏览一下之前加载的数据集,稍后将详细介绍。在这个例子中,假设我们了解到用户 'parakeet2004'bidderrate 值不正确,需要修改这个 bidderrate 值,那么先来查看一下用户 'parakeet2004' 的当前值:

data[data.bidder == 'parakeet2004']
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price
6 8213060420 3.00 0.186539 parakeet2004 5 1.0 120.0
7 8213060420 10.00 0.186690 parakeet2004 5 1.0 120.0
8 8213060420 24.99 0.187049 parakeet2004 5 1.0 120.0

有三行数据需要更新 bidderrate 字段,继续操作:

data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate'] = 100
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/36/lib/python3.6/ipykernel/__main__.py:1:SettingWithCopyWarning: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from aDataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead
See the caveats in the documentation:http://Pandas.pydata.org/Pandas-docs/stable/indexinghtml#indexing-view-versus-copy
  if __name__ == '__main__':

神奇!我们“创造”出了 SettingWithCopyWarning

检查一下用户 'parakeet2004' 的相关值,可以看到值没有按预期改变:

data[data.bidder == 'parakeet2004']
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price
6 8213060420 3.00 0.186539 parakeet2004 5 1.0 120.0
7 8213060420 10.00 0.186690 parakeet2004 5 1.0 120.0
8 8213060420 24.99 0.187049 parakeet2004 5 1.0 120.0

这次警告是因为将两个索引操作链接在一起,直接使用了两次方括号的链式索引比较容易理解。但如果使用其他访问方法,例如 .bidderrate.loc[].iloc[].ix[],也会如此,这次的链式操作有:

  • data[data.bidder == 'parakeet2004']
  • ['bidderrate'] = 100

以上两个链式操作一个接一个地独立执行。第一次链式操作是为了 Get,返回一个 DataFrame,其中包含所有 bidder 等于 'parakeet2004' 的行;第二次链式操作是为了 Set,是在这个新返回的 DataFrame 上运行的,并没有修改原始的 DataFrame。

这种情况对应的解决方案很简单:使用 loc 将两次链式操作组合成一步操作,确保 Pandas 进行 Set 的是原始 DataFrame。Pandas 始终确保下面这样的非链式 Set 操作起作用:

# 设置新值
data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', 'bidderrate'] = 100
# 检查结果
data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate']


6    100
7    100
8    100
Name: bidderrate, dtype: int64

这就是警告的文本(Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead)中建议的操作,在这种情况下完美适用。

隐蔽的链式操作(Hidden chaining)

现在来看遇到 SettingWithCopyWarning 的第二种常见方式。创建一个新的 DataFrame 来探索中标者数据,因为现在已经学习了链式赋值的内容,请注意使用 loc

winners = data.loc[data.bid == data.price]
winners.head()
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price
3 8213034705 117.5 2.998947 daysrus 10 95.00 117.5
25 8213060420 120.0 2.999722 djnoeproductions 17 1.00 120.0
44 8213067838 132.5 2.996632 *champaignbubbles* 202 29.99 132.5
45 8213067838 132.5 2.997789 *champaignbubbles* 202 29.99 132.5
66 8213073509 114.5 2.999236 rr6kids 4 1.00 114.5

winners 变量可能会被用来编写一些后续代码:

mean_win_time = winners.bidtime.mean()
... # 20 lines of code
mode_open_bid = winners.openbid.mode()

我们在偶然间发现了一个数据错误:标记为 304 的行中缺少了 bidder 值。

winners.loc[304, 'bidder']

nan

对这个例子来说,假设我们已知该投标人的真实用户名,并据此更新数据:

winners.loc[304, 'bidder'] = 'therealname'
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/36/lib/python3.6/Pandas/core/indexing.py:517:SettingWithCopyWarning: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from aDataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead

See the caveats in the documentation: http://Pandas.pydata.org/Pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy
  self.obj[item] = s

另一个 SettingWithCopyWarning!但是这次使用了 loc,为什么还会出现警告?让我们来看代码的结果来一探究竟:

print(winners.loc[304, 'bidder'])

therealname

代码确实起了预期的作用,为什么仍然出现警告?

链式索引可能在一行代码内发生,也可能跨越两行代码。因为 winners 变量是作为 Get 操作的输出创建的(data.loc[data.bid == data.price]),它可能是原始 DataFrame 的副本,也可能不是,除非检查,否则我们不能确认。对 winners 进行索引时,实际上使用的就是链式索引。

这意味着当我们尝试修改 winners 时,可能也修改了 data

在实际的代码中,相关的两行链式索引代码之间,可能相距很多行其他代码,追踪问题可能会更困难,但大致情况是与示例类似的。

这种情况下的警告解决方案是:创建新 DataFrame 时明确告知 Pandas 创建一个副本:

winners = data.loc[data.bid == data.price].copy()
winners.loc[304, 'bidder'] = 'therealname'
print(winners.loc[304, 'bidder'])
print(data.loc[304, 'bidder'])

therealname
nan

就这么简单!

窍门就是,学会识别链式索引,不惜一切代价避免使用链式索引。如果要更改原始数据,请使用单一赋值操作。如果你想要一个副本,请确保你强制让 Pandas 创建副本。这样既可以节省时间,也可以使代码保持逻辑严密。

另外请注意,即使 SettingWithCopyWarning 只在你进行 Set 时才会发生,但在进行 Get 操作时,最好也避免使用链式索引。链式操作代码效率较低,而且只要稍后进行赋值,就会导致问题。

处理 SettingWithCopyWarning 的提示和技巧

在进行下面更深入的分析之前,让我们看看 SettingWithCopyWarning 的更多细节。

关闭警告

如果不讨论如何明确地控制 SettingWithCopy 警告设置,本文则不够完整。Pandas 的 mode.chained_assignment 选项可以采用以下几个值之一:

  • 'raise' - 抛出异常(exception)而不是警告
  • 'warn' - 生成警告(默认)
  • None - 完全关闭警告

例如,如果要关闭警告:

pd.set_option('mode.chained_assignment', None)
data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate'] = 100

这样没有给出任何提示或警告,除非完全了解代码的运行情况,否则请不要尝试。只要你对想要实现的代码功能有任何一丁点疑问,不要关闭警告。有些开发者非常重视 SettingWithCopy 甚至选择将其提升为异常,如下所示:

pd.set_option('mode.chained_assignment', 'raise')
data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate'] = 100
---------------------------------------------------------------------------
SettingWithCopyError                      Traceback (most recent call last)
 in ()
      1 pd.set_option('mode.chained_assignment', 'raise')
----> 2 data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate'] = 100

/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/Pandas/core/frame.py in __setitem__(self, key, value)
    2427         else:
   2428             # set column
-> 2429             self._set_item(key, value)
   2430 
   2431     def _setitem_slice(self, key, value):

/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/Pandas/core/frame.py in _set_item(self, key, value)
   2500         # value exception to occur first
   2501         if len(self):
-> 2502             self._check_setitem_copy()
    2503 
   2504     def insert(self, loc, column, value, allow_duplicates=False):

/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/Pandas/core/generic.py in _check_setitem_copy(self, stacklevel, t, force)
   1758 
   1759             if value == 'raise':
-> 1760                 raise SettingWithCopyError(t)
   1761             elif value == 'warn':
   1762                 warnings.warn(t, SettingWithCopyWarning, stacklevel=stacklevel)

SettingWithCopyError: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead

See the caveats in the documentation: http://Pandas.pydata.org/Pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy

如果你正与缺乏经验的 Pandas 开发人员合作开发项目,或者正在开发需要高度严谨的项目,这可能特别有用。

更精确使用此设置的方法是使用 上下文管理器 context manager 。

# resets the option we set in the previous code segment
pd.reset_option('mode.chained_assignment')

with pd.option_context('mode.chained_assignment', None):
    data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate'] = 100

如你所见,这种方法可以实现针对性的警告设置,而不影响整个环境。

is_copy 属性

避免警告的另一个技巧是修改 Pandas 用于解释 SettingWithCopy 的工具之一。每个 DataFrame 都有一个 is_copy 属性,默认情况下为 None,但如果它是副本,则会使用 weakref 引用原始 DataFrame 。通过将 is_copy 设置为 None,可以避免生成警告。

winners = data.loc[data.bid == data.price]
winners.is_copy = None
winners.loc[304, 'bidder'] = 'therealname'

但是请注意,这并不会奇迹般地解决问题,反而会使错误检测变得更加困难。

单类型 VS 多类型对象

值得强调的另一点是单类型对象和多类型对象之间的差异。如果 DataFrame 所有列都具有相同的 dtype,则它是单类型的,例如:

import numpy as np

single_dtype_df = pd.DataFrame(np.random.rand(5,2), columns=list('AB'))
print(single_dtype_df.dtypes)
single_dtype_df

A    float64
B    float64
dtype: object
A B
0 0.383197 0.895652
1 0.077943 0.905245
2 0.452151 0.677482
3 0.533288 0.768252
4 0.389799 0.674594

如果 DataFrame 的列不是全部具有相同的 dtype,那么它是多类型的,例如:

multiple_dtype_df = pd.DataFrame({'A': np.random.rand(5),'B': list('abcde')})
print(multiple_dtype_df.dtypes)
multiple_dtype_df

A    float64
B     object
dtype: object
A B
0 0.615487 a
1 0.946149 b
2 0.701231 c
3 0.756522 d
4 0.481719 e

由于下面历史部分中所述的原因,对多类型对象的索引 Get 操作将始终返回副本。而为了提高效率,索引器对单类型对象的操作几乎总是返回一个视图,需要注意的是,这取决于对象的内存布局,并不能完全保证。

误报

误报,即无意中报告链式赋值的情况,曾经在早期版本的 Pandas 中比较常见,但此后大部分都被解决了。为了完整起见,在本文中包含一些已修复的误报示例也是有用的。如果你在使用早期版本的 Pandas 时遇到以下任何情况,则可以安全地忽略或抑制警告(或通过升级 Pandas 版本完全避免警告!)

使用当前列的值,将新列添加到 DataFrame 会生成警告,但这已得到修复。

data['bidtime_hours'] = data.bidtime.map(lambda x: x * 24)
data.head(2)
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price bidtime_hours
0 8213034705 95.0 2.927373 jake7870 0 95.0 117.5 70.256952
1 8213034705 115.0 2.943484 davidbresler2 1 95.0 117.5 70.643616

在一个 DataFrame 切片上使用 apply 方法进行 Set 时,也会出现误报,不过这也已得到修复。

data.loc[:, 'bidtime_hours'] = data.bidtime.apply(lambda x: x * 24)
data.head(2)
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price bidtime_hours
0 8213034705 95.0 2.927373 jake7870 0 95.0 117.5 70.256952
1 8213034705 115.0 2.943484 davidbresler2 1 95.0 117.5 70.643616

直到 0.17.0 版本前,DataFrame.sample 方法中存在一个错误,导致 SettingWithCopy 警告误报。现在,sample 方法每次都会返回一个副本。

sample = data.sample(2)
sample.loc[:, 'price'] = 120
sample.head()
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price bidtime_hours
481 8215408023 91.01 2.990741 sailer4eva 1 0.99 120 71.777784
503 8215571039 100.00 1.965463 lambonius1 0 50.00 120 47.171112

链式赋值深度解析

让我们重用之前的例子:试图更新 databidder 值为 'parakeet2004' 的所有行的 bidderrate 字段。

data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate'] = 100
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/ipykernel/__main__.py:1: SettingWithCopyWarning: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead

See the caveats in the documentation: http://Pandas.pydata.org/Pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy
  if __name__ == '__main__':

Pandas 用 SettingWithCopyWarning 告诉我们的是,代码的行为是模棱两可的,要理解原因和警告的措辞,以下概念将会有所帮助。

之前简要了解了视图(View)和副本(Copy)。有两种方法可以访问 DataFrame 的子集:可以创建对内存中原始数据的引用(视图),也可以将子集复制到新的较小的 DataFrame 中(副本)。视图是查看 原始 数据特定部分的一种方式;副本是将该数据 复制 到内存中的新位置。正如之前的图表所示,修改视图将修改原始变量,而修改副本则不会。

由于某些原因(本文稍后介绍),Pandas 中 Get 操作的输出无法保证。索引 Pandas 数据结构时,视图或副本都可能被返回,也就是说:对某一 DataFrame 进行 Get 操作返回一个新的 DataFrame,新的数据可能是:

  • 来自原始对象的数据副本
  • 没有复制,而是直接对原始对象的引用

因为不确定返回的对象是什么,而且每种可能性都有非常不同后续影响,所以忽略警告就是“玩火”。

为了更清楚地解释视图、副本和其中的歧义,我们创建一个简单的 DataFrame 并对其进行索引:

df1 = pd.DataFrame(np.arange(6).reshape((3,2)), columns=list('AB'))
df1
A B
0 0 1
1 2 3
2 4 5

df1 的子集赋值给 df2

df2 = df1.loc[:1]
df2
A B
0 0 1
1 2 3

根据刚才学到的知识,我们知道 df2 可能是 df1 的视图或 df1 子集的副本。

在解决问题之前,我们还需要再看一下链式索引。扩展一下 'parakeet2004' 示例,将两个索引操作链接在一起:

data[data.bidder == 'parakeet2004']
__intermediate__['bidderrate'] = 100

__intermediate__ 表示第一个调用的输出,对我们是完全不可见的。请记住,如果我们使用了属性访问(.+列名形式的访问),会得到相同的有问题的结果:

data[data.bidder == 'parakeet2004'].bidderrate = 100

这同样适用于任何其他形式的链式调用,因为我们正在生成中间对象

在底层代码中,链式索引意味着对 __getitem____setitem__ 进行多次调用以完成单个操作。这些是 特殊的 Python 方法,通过在实现它们类的实例上使用方括号,可以调用这些方法,这是一种语法糖。下面看一下 Python 解释器如何执行示例中的内容。

# Our code
data[data.bidder == 'parakeet2004']['bidderrate'] = 100

# Code executed
data.__getitem__(data.__getitem__('bidder') == 'parakeet2004').__setitem__('bidderrate', 100)

你可能已经意识到,SettingWithCopyWarning 是由此链式 __setitem__ 调用生成的。可以自己尝试一下 - 上面这些代码的功能相同。为清楚起见,请注意第二个 __getitem__ 调用(对 bidder 列)是嵌套的,而不是链式问题的所有部分。

通常,如上面所述,Pandas 不保证 Get 操作是返回视图还是副本。如果示例中返回了一个视图,则链式赋值中的第二个表达式将是对原始对象 __setitem__ 的调用。但是,如果返回一个副本,那么将被修改的是副本 - 原始对象不会被修改。

这就是警告中 “a value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame” 的含义。由于没有对此副本的引用,它最终将被回收 。SettingWithCopyWarning 让我们知道 Pandas 无法确定第一个 __getitem__ 调用是否返回了视图或副本,因此不清楚该赋值是否更改了原始对象。换一种说法就是:“我们是否正在修改原始数据?”这一问题的答案是未知的。

如果确实想要修改原始文件,警告建议的解决方案是使用 loc 将这两个单独的链式操作转换为单个赋值操作。这样代码中没有了链式索引,就不会再收到警告。修改后的代码及其扩展版本如下所示:

# Our code
data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', 'bidderrate'] = 100

# Code executed
data.loc.__setitem__((data.__getitem__('bidder') == 'parakeet2004', 'bidderrate'), 100)

DataFrame 的 loc 属性保证是原始 DataFrame 本身,具有扩展的索引功能。

假阴性(False negatives)

使用 loc 并没有结束问题,因为使用 loc 的 Get 操作仍然可以返回一个视图或副本,下面是个有点复杂的例子。

data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', ('bidderrate', 'bid')]
bidderrate bid
6 100 3.00
7 100 10.00
8 100 24.99

这次拉出了两列而不是一列。下面尝试 Set 所有的 bid 值。

data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', ('bidderrate', 'bid')]['bid'] = 5.0
data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', ('bidderrate', 'bid')]
bidderrate bid
6 100 3.00
7 100 10.00
8 100 24.99

没有效果,也没有警告!我们在切片的副本上 Set 了一个值,但是 Pandas 没有检测到它 - 这就是假阴性。这是因为,使用 loc 之后并不意味着可以再次使用链式赋值。这个特定的 bug,有一个未解决的 GitHub issue 。

正确的解决方法如下:

data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', 'bid'] = 5.0
data.loc[data.bidder == 'parakeet2004', ('bidderrate', 'bid')]
bidderrate bid
6 100 5
7 100 5
8 100 5

你可能怀疑,是否真的有人会在实践中遇到这样的问题。其实这比你想象的更容易出现。当我们像下一节中这样做:将 DataFrame 查询的结果赋值给变量。

隐藏的链式索引

再看一下之前隐藏的链式索引示例,我们试图设置 winners 变量中,标记为 304 行的 bidder 字段。

winners = data.loc[data.bid == data.price]
winners.loc[304, 'bidder'] = 'therealname'
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/Pandas/core/indexing.py:517: SettingWithCopyWarning: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead

See the caveats in the documentation: http://Pandas.pydata.org/Pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy
  self.obj[item] = s

尽管使用了 loc,还是得到了 SettingWithCopyWarning 。这可能令人非常困惑,因为警告信息建议的方法,我们已经做过了。

不过,想一下 winners 变量究竟是什么?由于我们通过 data.loc[data.bid == data.price] 将它初始化,无法知道它是原始 data 的视图还是副本(因为 Get 操作返回视图或副本)。将初始化与生成警告的行组合在一起可以清楚地表明我们的错误。

data.loc[data.bid == data.price].loc[304, 'bidder'] = 'therealname'
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/Pandas/core/indexing.py:517: SettingWithCopyWarning: 
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead

See the caveats in the documentation: http://Pandas.pydata.org/Pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy
  self.obj[item] = s

再次使用了链式赋值,只是这次它被分在了两行代码中。思考这个问题的另一种方法是,问一个问题:“这个操作会修改一个对象,还是两个对象?”在示例中,答案是未知的:如果 winners 是副本,那么只有 winners 受到影响,但如果是视图,则 winnersdata 都将被更新。这种情况可能发生在脚本或代码库中相距很远的行之间,这使问题很难被追根溯源。

此处警告的意图是提醒,自以为代码将修改原始 DataFrame,实际没有修改成功,或者说我们将修改副本而不是原始数据。深入研究 Pandas GitHub repo 中的 issue,可以看到开发人员自己对这个问题的解释。

如何解决这个问题在很大程度上取决于自己的意图。如果想要使用原始数据的副本,解决方案就是强制 Pandas 制作副本。

winners = data.loc[data.bid == data.price].copy()
winners.loc[304, 'bidder'] = 'therealname'

print(data.loc[304, 'bidder']) # Original
print(winners.loc[304, 'bidder']) # Copy

nan
therealname

另一方面,如果需要更新原始 DataFrame,那么应该使用原始 DataFrame 而不是重新赋值一些具有未知行为的其他变量。之前的代码可以修改为:

# Finding the winners
winner_mask = data.bid == data.price

# Taking a peek
data.loc[winner_mask].head()

# Doing analysis
mean_win_time = data.loc[winner_mask, 'bidtime'].mean()
... # 20 lines of code
mode_open_bid = data.loc[winner_mask, 'openbid'].mode()

# Updating the username
data.loc[304, 'bidder'] = 'therealname'

在更复杂的情况下,例如修改 DataFrame 子集的子集,不要使用链式索引,可以在原始 DataFrame 上通过 loc 进行修改。例如,可以更改上面的新 winner_mask 变量或创建一个选择中标者子集的新变量,如下所示:

high_winner_mask = winner_mask & (data.price > 150)
data.loc[high_winner_mask].head()
auctionid bid bidtime bidder bidderrate openbid price bidtime_hours
225 8213387444 152.0 2.919757 uconnbabydoll1975 15 0.99 152.0 70.074168
328 8213935134 207.5 2.983542 toby2492 0 0.10 207.5 71.605008
416 8214430396 199.0 2.990463 volpendesta 4 9.99 199.0 71.771112
531 8215582227 152.5 2.999664 ultimatum_man 2 60.00 152.5 71.991936

这种技术会使未来的代码库维护和扩展地更加稳健。

历史

你可能想知道为什么要造成这么混乱的现状,为什么不明确指定索引方法是返回视图还是副本,来完全避免 SettingWithCopy 问题。要理解这个问题,必须研究 Pandas 的过去。

Pandas 确定返回一个视图还是一个副本的逻辑,源于它对 NumPy 库的使用,这是 Pandas 库的基础。视图实际上是通过 NumPy 进入 Pandas 的词库的。实际上,视图在 NumPy 中很有用,因为它们能够可预测地返回。由于 NumPy 数组是单一类型的,因此 Pandas 尝试使用最合适的 dtype 来最小化内存处理需求。因此,包含单个 dtype 的 DataFrame 切片可以作为单个 NumPy 数组的视图返回,这是一种高效处理方法。但是,多类型的切片不能以相同的方式存储在 NumPy 中。Pandas 兼顾多种索引功能,并且保持高效地使用其 NumPy 内核的能力。

最终,Pandas 中的索引被设计为有用且通用的方式,其核心并不完全与底层 NumPy 数组的功能相结合。随着时间的推移,这些设计和功能元素之间的相互作用,导致了一组复杂的规则,这些规则决定了返回视图还是副本。经验丰富的 Pandas 开发者通常都很满意 Pandas 的做法,因为他们可以轻松地浏览其索引行为。

不幸的是,对于 Pandas 的新手来说,链式索引几乎不可避免,因为 Get 操作返回的就是可索引的 Pandas 对象。此外,用 Pandas 的核心开发人员之一 Jeff Reback 的话来说,“从语言的角度来看,直接检测链式索引是不可能的,必须经过推断才能了解”(It is simply not possible from a language perspective to detect chain indexing directly; it has to be inferred)。

因此,在 2013 年底的 0.13.0 版本中引入了警告,作为许多开发者遇到链式赋值导致的无声失败的解决方案。

在 0.12 版本之前,ix 索引器是最受欢迎的(在 Pandas 术语中,“索引器”比如 ixlociloc,是一种简单的结构,允许使用方括号来索引对象,就像数组一样,但具有一些特殊的用法)。但是大约在 2013 年中 ,Pandas 项目开始意识到日益增加的新手用户的重要性,有动力开始提高新手用户的使用体验。自从此版本发布以来,lociloc索引器因其更明确的性质和更易于解释的用法而受到青睐。(译者注:pandas v0.23.3 (July 7, 2018),其中 ix 方法已经被弃用

Pandas 中 SettingwithCopyWarning 的原理和解决方案_第4张图片

Google Trends: Pandas

SettingWithCopyWarning 在推出后持续改进,多年来在许多 GitHub issue 中得到了热烈的讨论 ,甚至还在不断更新 ,但是要理解它,仍然是成为 Pandas 专家的关键。

总结

SettingWithCopyWarning 的基础复杂性是 Pandas 库中为数不多的坑。这个警告的源头深深嵌在库的底层中,不应被忽视。Jeff Reback 自己的话 ,“Their are no cases that I am aware that you should actually ignore this warning. ……If you do certain types of indexing it will never work, others it will work. You are really playing with fire.”

幸运的是,解决警告只需要识别链式赋值并将其修复——看完本文你唯一需要理解的事。

你可能感兴趣的:(Pandas)