R语言安装

https://www.howtoing.com/how-to-install-r-on-ubuntu-18-04

sudo -i R

GEOquery，affy安装
要先执行

sudo apt-get install r-base-core libxml2-dev libcurl4-openssl-dev curl

> # 下载 Bioconductor 的安装程序
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> # 安装 Bioconductor 的核心包
> biocLite()
> # 安装 GEO 包
> biocLite("GEOquery")

https://www.jianshu.com/p/07ecff240548