Linux3天培训总结

3天培训总结

尽自己努力回顾，后续还有付出更多去练习

1.R语言

要做的作业，先附上链接，方便查找

今晚继续练习linux哈，最低要求是完成我的 linux 20题 http://www.bio-info-trainee.com/2900.html

其次完成生物信息学数据格式的习题(blast/blat/fa-fq/sam-bam/vcf/bed/gtf-gff)，收集这些格式的说明书。

fasta和fastq格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3575.html

sam和bam格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3578.html

VCF格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3577.html

2.Linus基础命令行

1.接下来要通过反复实践练习的内容：

1.路径

1）根目录：/

2）家/主目录：～

3）上级目录：..

4. 后退目录：-

5）当前目录：./或.

文件和文本的区别:Linux下所有的文本文本行都是\n结尾

mac多窗口间切换：command+Tab

浏览器的窗口间切换：shift+command+[：向左切换

shift+command+]：向右切换

2.需要理清的概念

绝对路径是指目录下的绝对位置，直接到达目标位置，通常是从盘符开始的路径。（概念来自百度）

绝对路径和相对路径：

绝对路径是指目录下的绝对位置，直接到达目标位置，通常是从盘符开始的路径。

相对路径：指由这个文件所在的路径引起的跟其它文件（或文件夹）的路径关系。

• src是标签的必选属性，它的值是图像文件的 URL，也就是引用该图像的文件的的绝对路径或相对路径。

• 是source的简写，意思就是资源位置，你所引用的位置。

• 绝对 URL - 指向其他站点（比如 src="http://www.autofull.com/"）。

• 相对 URL - 指向站点内的文件（比如 src="/i/image.gif"）。

• src是source的缩写，指向外部资源的位置，指向的内容将会嵌入到文档中当前标签所在位置；在请求src资源时会将其指向的资源下载并应用到文档内，例如js脚本，img图片和frame等元素。src和href之间有区别，可以混着用。src用于替换当前元素，href用于在当前文档和引用资源之间确立联系。

  我自己的理解就是：我要是想要从别人的根目录下下载文件，我是下载不了的，这是绝对路径；相对路径是我从别人的非根目录下要下载文件——暂且先这么理解着，后续再改

3.老大博客里写到的需要了解的命令：http://www.bio-info-trainee.com/1661.html

https://www.jianshu.com/p/b0bf2336a8c8 写的挺全了

ls

命令：ls -l -R /home/peidachang=ls -lR /home/peidachang

例二：列出当前目录中所有以“t”开头的目录的详细内容，可以使用如下命令：

命令：ls -l t*

例三：只列出文件下的子目录

命令：ls -F /opt/soft |grep /$

其他有选择看了下，后面边练习边添加

echo 指令:用于字符串的输出。