2018-07-09（关于环境变量和系统日志查看）

今天下午学习转录组分析的时候，出现程序被killed,一查才发现原来是内存不够，一怒之下买了个12核，24G的云服务器。

新买的服务器下载东西的时候总是要考虑环境变量，之前学过，但总是跟着文档设置，这次自己设置一下，也算是熟练掌握和理解了。

首先我在用户目录下的soft文件中写了一个简单的bash脚本temp.sh

#！/bin/bash

echo "i love u"

然后直接输入temp.sh

系统会报错没有这个command，这是因为当前目录并不在环境变量中

首先新购的服务器下是没有~/.bash_profile文件的，我用ls -a只找到了.bashrc,但是打开并输入：

export PATH="/home/ubuntu/soft：$PATH"

然后在命令行输入echo $PATH能看到环境变量中有当前目录，但是在命令行键入temp.sh,系统依然报错：没有这个command

分析可能的原因是~/.bashrc, 在本地登录时才会被读取，而现在是远程登陆，所以需要用~/.bash_profile

没有这个文件的话就自己建一个，然后输入export PATH="/home/ubuntu/soft：$PATH"后，并且source ~/.bash_profile后，temp.sh就可以生效了。

几个知识点提一下：

1.linux系统中程序被kill，很可能是没有内存了

2.远程登陆服务器，环境变量需要在~/.bash_profile中添加

3.source之后才能生效

4.另外写的脚本，注意一下权限的问题，不行就chmod一下

5.bash脚本中开头会有 #！/bin/bash

7.环境变量用：分割，从前往后调用

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有一点想要补充一下，开始我的程序被kill掉后，如果是centos系统，可以在/var/log/message中查看问题，可以找到是内存不够的原因

但是对于ubuntu系统，我并没有找到这个message,于是我百度了一下，看到一些人给的方法还是没有用。实际上，Ubuntu没有message一定是因为它将日志放在了别的文件中，不需要我们去人为的将message弄出来。

实际上：

基于 Debian 的系统如 Ubuntu 在 /var/log/syslog 中存储它们，而基于 RedHat 的系统如 RHEL 或 CentOS 则在 /var/log/messages 中存储它们。/var/log/kern 存储内核的错误和警告数据，这对于排除与定制内核相关的故障尤为实用。

所以报错信息可以在/var/log/kern中查找就可以了

另外

学会一个小技能，vim命令行模式下用G可以到文件底部