Namroud2012 SNP检查人工选择对遗传多样性的影响

1. Namroud M, Bousquet J, Doerksen T, Beaulieu J (2012) Scanning SNPs from a large set of expressed genes to assess the impact of artificial selection on the undomesticated genetic diversity of white spruce. Evol Appl 5(6):641–656.

使用来自709个表达基因的涉及1134个单核苷酸多态性（SNP）的扫描来评估人工选择高度生长对白云杉的遗传多样性的潜在影响。从魁北克育种计划中描绘了模拟不同家族选择强度（分别为K = 13％和5％）的不同大小的两种病例群体。将其遗传多样性和等位基因频率与相同大小和地理来源的对照群体的遗传多样性和等位基因频率进行比较，以评估增加选择强度的效果。还比较两个对照群体以评估减少采样大小的效果。一方面，在所有成对比较中，遗传多样性参数是可比较的，在病例群体中没有等位基因与对照相比丢失，除了在大病例群体中少数罕见等位基因。此外，等位基因频率的分布在所比较的群体之间没有显着变化（P≤0.05），但是大和小尺寸的病例和对照群体之间的10和9个SNP（0.8％）在频率（P≤0.01） ， 分别。在15岁的高度的育种值与这些SNP之间的关联测试的结果支持选择对包含这些SNP的基因的潜在影响的假设。另一方面，与期望相反，没有证据表明选择诱导可能受选择影响的基因中的连锁不平衡的增加。这些结果表明，样品量的减少和选择强度的增加都不足以诱导所选群体的遗传多样性的显着变化。显然，没有基因位于强选择压力下，证实白色云杉的高度生长的遗传控制涉及许多具有小效应的基因。因此，在当前强度的高度生长的选择没有表现出妥协背景遗传多样性，但是，如理论所预测的，在几个基因SNP具有中间等位基因频率检测到的影响。