1️⃣序列获取(3)：蛋白质序列获取

序列比对和序列特征分析总目录

1 NCBI Protein database

related information可以查看非常详细的各种相关信息

2 EXProt :database for EXPerimentally verified Protein functions

ps，写到这里，安利一个航母网址https://www.expasy.org/

3 第一推荐：UniProtKB：不能再详细

Swiss-Prot

数据来源

• 核酸数据库翻译推导
• 蛋白质数据库PIR挑选
• 科学文献摘录
• 研究人员直接提交的蛋白序列

特点

• 每一条序列包括核心数据和注释两类,其中
  核心数据包括序列，参考文献，分类信息等
  注释数据包括功能描述，翻译后修饰，结构域和功能位点，四级结构，相关疾病，PPI等
• 融合多个数据库，降低冗余
• 与其它数据库交叉引用

UniprotKB主要包括两部分：

• UniprotKB/Swiss-Prot：包含检查过的，手工注释的条目

-###UniprotKB/TrEMBL:包含未校验的，自动注释的。由计算机分析获得，未人工审核。

4 PIR

The Protein Information Resource (PIR) is an integrated public bioinformatics resource to support genomic, proteomic and systems biology research and scientific studies (Wu et al., 2003).

PIR

5 MIPS比较全面的一个网站 参考文章

ps：内嵌