2019-11-18-解码SAM flags

昨天生信技能树的线上课程学习生物信息学基础数据格式，关于sam文件讲师讲到一个flag。当时演示了一个查找的软件，由于不熟悉，没有预习，然后就问了一下这个问题，曾老师说要完成一个作业。
现在开始准备作业。
什么是sam格式：通过查找生信技能树，菜鸟团等以往的推送我找到如下内容
http://www.bio-info-trainee.com/2924.html
专题目录传送门
然后我迅速找到了浅谈SAM格式

然后这个Flag就能理解了。
我觉得好惭愧，没有查找就问了这个问题，在此深刻检讨。后面问问题之前一定要先查一下。

然后曾老师和斯老师还是把他们讲的软件连接发到了群里。

• https://broadinstitute.github.io/picard/explain-flags.html
• https://www.samformat.info/sam-format-flag

这就是那个Flag

来自https://www.samformat.info/sam-format-flag

可以通过读取比对后的数据来判断比对的情况。
在线工具输入一个数字就出来判断的结果

输入99，有些栏目变颜色了，就是比对的结果