转录组入门二（mac版）：读文献下数据

转录组入门二，读文献下数据

• 在NCBI查文章：

AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing factors. Nat Commun 2016 Nov 8;7:13347. PMID: 27824034

• 找数据地址

  
  
  

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• 去GSE网站，搜GSE81916

  
  
  

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• 下载代码

# 在终端运行
#用axel下载会快一些
brew install axel
for i in {56..62}
do
# 也可以用wget 下载
axel ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByStudy/sra/SRP/SRP075/SRP075747/SRR35899$i/SRR35899$i.sra
done

参考文献：

1. http://www.biotrainee.com/thread-1908-1-1.html