- 五星:必须推荐的一个连接data.table 与 dplyr的数据清洗小操作
热衷组培的二货潜
链接至上:https://atrebas.github.io/post/2019-03-03-datatable-dplyr/看到一份特别精彩的关于对data.table和dplyr对我们平时常用的数据清洗的命令的总结,看完之后感觉原来操作可以这么骚,可以说是对《Rfordatascience》的一个升华吧。极力推荐啊!!啊啊啊,五星。需要PDF版本的可以私密我。IntroductionAbout
- 《高效R语言编程》5-高效输入输出
zd200572
在读取一行数据之前,应该先考虑下重复数据管理的通用规则,不改写原始数据。原始文件视为只读,保留原始文件名字并说明来源,是一个好办法。软件配置几个包:install.packages(c("rio","readr","data.table","feather","WDI"))关于数据I/O的高级技巧R语言自己的文件格式是.Rds,可以使用readRDS()与saveRDS()函数导入与导出,是一种速
- r语言赋值为na_如何将R数据中的NA值替换为0?
weixin_39980129
r语言赋值为na
dplyr杂交选项现在比BaseR子集重新分配快30%左右。在一个100米的数据池上mutate_all(~replace(.,is.na(.),0))比基数R快半秒d[is.na(d)]如果你在为大量的数据而挣扎,data.table是最快的选择:比标准快40%。基R接近。它还可以修改现有的数据,有效地允许您一次处理几乎两倍的数据。其他有用的潮汐替换方法的聚类地点:指数mutate_at(c(5
- R语言小作业-中级
鱼啸九天
学习了一段时间的R,开始做些题,来加深所学的知识。1.根据R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl基因ID对应的基因名(symbol)1.新建TXT,将题中基因复制到TXT,并命名。然后导入到R。a<-data.table::fread("1.txt",header=F)2.导入R后发现得进行小数点分割,由于lappy和str_split比较复杂,因此采用separate函数,a2<-s
- R语言中重命名数据框(dataframe)的列名
程序设计创梦引领者
r语言python开发语言R语言
R语言中重命名数据框(dataframe)的列名在R语言中,重命名数据框(dataframe)的列名是一项常见的操作。通过修改列名,我们可以更好地理解和处理数据。R语言提供了多种方法来重命名数据框的列名,包括使用基本的向量赋值方法、dplyr包中的rename()函数和data.table包中的setnames()函数。本文将介绍这些方法,并提供相应的源代码示例。使用基本的向量赋值方法基本的向量赋
- 随机森林算法(Random Forest)的二分类问题
Amyniez
R语言1024程序员节随机森林分类机器学习算法经验分享人工智能
二分类问题1.数据导入2.RF模型构建2.1调参:mtry和ntree2.2运行模型3.模型测试4.绘制混淆矩阵5.绘制ROC曲线6.参考1.数据导入library(dplyr)#数据处理使用library(data.table)#数据读取使用library(randomForest)#RF模型使用library(caret)#调参和计算模型评价参数使用library(pROC)#绘图使用libr
- 长表和宽表的相互转化
m0_38093796
基础学习data.table
使用函数melt()和decast(),是reshape2包中函数的增强先考虑传统长宽表转化函数,1.默认函数a.融合data.table(宽表到长表)考虑如下data.table:>DT=fread("melt_default.csv")>DTfamily_idage_motherdob_child1dob_child2dob_child31:1301998/11/262000/1/29NA2:
- 字符串拆分
Kururu1799
字符串拆分原始数据第二列只想保留第一个解决方法(感谢我师妹)CCLE_data<-data.table::fread("CCLE_RNAseq_rsem_genes_tpm_20180929.txt.gz",data.table=F)transcript_id<-CCLE_data$transcript_idslibrary(tidyverse)transcript_id<-strsplit(tr
- R语言中fread怎么使用?
生信分析笔记
后端
R语言中fread怎么用?今天分享的笔记内容是数据读取神器fread,速度嘎嘎快。在R语言中,fread函数是data.table包中的一个功能强大的数据读取函数,可以用于快速读取大型数据文件,它比基本的read.table和read.csv函数更快,尤其在处理大型数据集时效果更为明显。使用方法首先,确保已经安装了data.table包。如果尚未安装,可以使用以下命令安装:install.pack
- R语言data.table包高效处理/提升大数据效率@灵魂走风的江湖
LEEBELOVED
R语言实用随笔R语言高效处理数据大数据R语言data.table包
目录1、data.table包中特殊符号.SD(通过.SDcols选择的变量作处理)、.SDcols(变量列选择)、.I(返回位置)、.N(计数)、.BY、J、CJ、SJ、:=2、分组计数(单一方法)比较:3、多分组情况下比较:4、if_else和fifelse函数比较:5、row_number、with_groups与order、by综合比较:6、字段拆分函数tstrsplit与str_spli
- dtplyr报错Error: package or namespace load failed for ‘dtplyr’: object ‘fcoalesce’ is not exported...
小洁忘了怎么分身
解决办法:重装data.table,重启Rstudio,依次加载data.table和dtplyr。原因:data.table添加了新函数,旧版本里面没有。
- R语言---使用runway进行机器学习模型性能的比较
MRI_lab
r语言机器学习开发语言
R语言—使用runway进行机器学习模型性能的比较#dataloadrm(list=ls())#librarylibrary(dcurves)library(gtsummary)library(tidyverse)library(mlr3verse)library(tidyverse)library(data.table)</
- 【GWAS】为TASSEL结果绘制曼哈顿图及QQ图
正踪大米饭儿
好久没写博文了,分享一个为TASSEL结果绘制曼哈顿图的代码:#加载需要的包library(data.table)#用于快速读取大文件library(CMplot)#用于绘制图形#读取数据Tassl.Res<-fread("mlm_output17.txt",header=T,sep="\t")Tassl.Res[1:5,1:8]#查看数据前5行,前8列。#提取Mean_LS性状的结果,由于Mak
- 怎么对数据框中的列划分区间
多克托刘
dt<-data.table(x=c(1:200),y=rnorm(200))dens<-density(dt$y)df<-data.frame(x=dens$x,y=dens$y)probs<-c(0.1,0.25,0.5,0.75,0.9)quantiles<-quantile(dt$y,prob=probs)df$quant<-factor(findInterval(df$x,quantil
- 2020-04-12 R学习--数据的读取及保存
javen_spring
R主要在于其强大的数据处理及结果可视化能力,但往往可视化前的数据处理占用了比较多的精力,以便用来纠错(debug)。R数据的读取文本文件读取read.table()或data.table::fread():读取文本文件read.table(file,header=FALSE,sep="",quote="\"'",dec=".",numerals=c("allow.loss","warn.loss"
- 个人博客文章合集
研究僧小蓝哥
最近很少在更新了,搭建了个个人博客,基本都是在那边更新。不定期更新链接:博客文章合集:data.table学习笔记ggplot2分面填充色与字体大小ggplot2画箭头ggplot2坡度图iTOL修饰进化树NMDS分析OPLS-DA在R语言中的实现PCA和PERMANOVA分析PCA在R语言中的实现PTI中的信号网络Python爬取知乎问题即将步入研究生,有什么忠告?所有回答后将数据写入Excel
- R语言学习笔记:文本分析
DANoob
文本分析使用的数据:yelp_subset.csvlibrary(data.table)data.all=fread('yelp_subset.csv',stringsAsFactors=FALSE)dim(data.all)data=data.all[1:100,]#取前一百行来分析目标:利用评论预测打分为了简化,把星级分为两类:1-3星为0,4-5星为1data$rating=c(0)#做出新
- R实战-大数据文件分割为多个Excel
lucier19981
一、原文件单个数据文件100多万行,达到400MB,传统Excel软件软件束手无策,打开慢、打开后数据丢失、打开后无法操作,这个时候R就派上用场了image.png二、R代码(一)载入R数据处理相关包library(rJava)library(xlsxjars)library(xlsx)library(readxl)library(data.table)library(dplyr)(二)导入大数据
- WGCNA
小醉橘子
rm(list=ls())library(WGCNA)library(data.table)library(stringr)library(openxlsx)allowWGCNAThreads()####step1数据预处理if(T){#readexpressiondataandpre-processingexprset00.8,将被合并MEDissThres=0.2abline(h=MEDiss
- 将列的元素按类别合并成一行
重新开始_xy
放了一个国庆,整个人玩得傻掉了,连这篇日记的名字都不知怎么写了数据:需求:根据name将相同name的score放入一行中,方便后续处理。想要的结果如下代码:library(data.table),library(stringr),library(dplyr)tb%group_by(name)%>%summarise(score=paste(score,collapse="\t"))运行代码之后如
- fread~对于循环索引的影响
EngineerChicken
目的:比较45列与分别与29:40列的差异倍数,保存至少9个差异数大于2倍的row思路:笨方法,使用fread读取数据,参数与先前一致。使用for循环方式一次比较列的差异。(等技术提高再进行修改)问题:当根据x,y索引的时候,报错提示:Errorin[.data.table(input_table,i,j):j(the2ndargumentinside[...])isasinglesymbolbu
- R语言data.table包进行数据分组聚合统计变换(Aggregating transforms)、计算dataframe数据的分组标准差(sd)
statistics.insight
R语言入门课数据挖掘r语言机器学习人工智能数据分析
R语言data.table包进行数据分组聚合统计变换(Aggregatingtransforms)、计算dataframe数据的分组标准差(sd)目录
- WGCNA-2实战
白云梦_7
以FemaleLiver-Data为例#设置工作目录setwd("D:/Desktop/WGCNA/FemaleLiver-Data/")#加载包library(WGCNA)library(data.table)library(stringr)library(openxlsx)allowWGCNAThreads()options(stringsAsFactors=FALSE)1.数据准备#读取表达
- 备份:使用随机森林方法用CollegeDistance数据集中的属性预测地区(region)
嚯口小茶
嚯茶随机森林人工智能机器学习
本次采用CollegeDistance数据集利用随机森林方法,用wage,distance,urban,income进行region的预测。数据集:CollegeDistance方法:随机森林#相关库导入library(data.table)library(C50)library(splitstackshape)library(rattle)library(rpart.plot)library(k
- 复现一篇高分(IF = 11.274)孟德尔随机化分析文章-day3
rapunzel0103
话不多说,直接上代码library(TwoSampleMR)library(data.table)#step1.readexposuredataexposure_dat0.05,thenchooseInversevarianceweighted(fixedeffects)methodmr_results_het0.05,因此选择Inversevarianceweighted(fixedeffect
- R语言~分页图的同一套分组变量各自排序
Oodelay
绘制分页图,同一套分组变量,各自排序。在网上找到了一个精致的解决方案。原方案在此以自己的数据为例示例数据以resp分页,以expl为分类变量,IncMSE为数值列这里需要用到工具包data.table将自己的数据转换为data.table的data.framedf=data.table(df)新建排序列,作为索引。这里以resp即分页列作为分组,对数值列IncMSE进行排序df[,ord:=spr
- TCGAbiolinks整理表达数据和临床数据
sayhello1025
TCGAr语言开发语言
新版TCGAbiolinks的整理表达数据和临床数据没有废话直接干##加载包rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)gc()library(TCGAbiolinks)library(scRNAseq)library(data.table)library(limma)library(dplyr)library(DT)表达数据下载,跟GDC官网一样的参数?GDC
- 韦恩图
一只小脑斧
R语言可视化(九):韦恩图绘制-(jianshu.com)R语言:VennDiagram绘制venn图-(jianshu.com))AW19@`V{NG1R6KUU{@8YQF.pnglibrary(data.table)cell1.5,]shangqing.fil1.5,]##############1.2cell.fil1.2,]shangqing.fil1.2,]##############
- 在R中读取csv格式大文件
hungrywindows
r语言
可以使用data.table包的函数fread()。以下为打开366M包括大量文本的效果。system.time(cleandf<-fread('.../data.csv',header=T,sep=','))usersystemelapsed2.7150.1292.309
- R语言用Keras长短期记忆LSTM神经网络分类分析问答文本数据
数据挖掘深度学习人工智能算法
原文链接:http://tecdat.cn/?p=26709介绍本文是在R中使用Keras的LSTM神经网络分类简单介绍。软件包library(tidyverse) #导入、清理、可视化 library(keras) # 用keras进行深度学习library(data.table) # 快速读取csv数据导入让我们看一下数据tst %>% head()初步查看让我们考虑几个用户可能提出的“不真诚
- 数据采集高并发的架构应用
3golden
.net
问题的出发点:
最近公司为了发展需要,要扩大对用户的信息采集,每个用户的采集量估计约2W。如果用户量增加的话,将会大量照成采集量成3W倍的增长,但是又要满足日常业务需要,特别是指令要及时得到响应的频率次数远大于预期。
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- 不停止 MySQL 服务增加从库的两种方式
brotherlamp
linuxlinux视频linux资料linux教程linux自学
现在生产环境MySQL数据库是一主一从,由于业务量访问不断增大,故再增加一台从库。前提是不能影响线上业务使用,也就是说不能重启MySQL服务,为了避免出现其他情况,选择在网站访问量低峰期时间段操作。
一般在线增加从库有两种方式,一种是通过mysqldump备份主库,恢复到从库,mysqldump是逻辑备份,数据量大时,备份速度会很慢,锁表的时间也会很长。另一种是通过xtrabacku
- Quartz——SimpleTrigger触发器
eksliang
SimpleTriggerTriggerUtilsquartz
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2208166 一.概述
SimpleTrigger触发器,当且仅需触发一次或者以固定时间间隔周期触发执行;
二.SimpleTrigger的构造函数
SimpleTrigger(String name, String group):通过该构造函数指定Trigger所属组和名称;
Simpl
- Informatica应用(1)
18289753290
sqlworkflowlookup组件Informatica
1.如果要在workflow中调用shell脚本有一个command组件,在里面设置shell的路径;调度wf可以右键出现schedule,现在用的是HP的tidal调度wf的执行。
2.designer里面的router类似于SSIS中的broadcast(多播组件);Reset_Workflow_Var:参数重置 (比如说我这个参数初始是1在workflow跑得过程中变成了3我要在结束时还要
- python 获取图片验证码中文字
酷的飞上天空
python
根据现成的开源项目 http://code.google.com/p/pytesser/改写
在window上用easy_install安装不上 看了下源码发现代码很少 于是就想自己改写一下
添加支持网络图片的直接解析
#coding:utf-8
#import sys
#reload(sys)
#sys.s
- AJAX
永夜-极光
Ajax
1.AJAX功能:动态更新页面,减少流量消耗,减轻服务器负担
2.代码结构:
<html>
<head>
<script type="text/javascript">
function loadXMLDoc()
{
.... AJAX script goes here ...
- 创业OR读研
随便小屋
创业
现在研一,有种想创业的想法,不知道该不该去实施。因为对于的我情况这两者是矛盾的,可能就是鱼与熊掌不能兼得。
研一的生活刚刚过去两个月,我们学校主要的是
- 需求做得好与坏直接关系着程序员生活质量
aijuans
IT 生活
这个故事还得从去年换工作的事情说起,由于自己不太喜欢第一家公司的环境我选择了换一份工作。去年九月份我入职现在的这家公司,专门从事金融业内软件的开发。十一月份我们整个项目组前往北京做现场开发,从此苦逼的日子开始了。
系统背景:五月份就有同事前往甲方了解需求一直到6月份,后续几个月也完
- 如何定义和区分高级软件开发工程师
aoyouzi
在软件开发领域,高级开发工程师通常是指那些编写代码超过 3 年的人。这些人可能会被放到领导的位置,但经常会产生非常糟糕的结果。Matt Briggs 是一名高级开发工程师兼 Scrum 管理员。他认为,单纯使用年限来划分开发人员存在问题,两个同样具有 10 年开发经验的开发人员可能大不相同。近日,他发表了一篇博文,根据开发者所能发挥的作用划分软件开发工程师的成长阶段。
初
- Servlet的请求与响应
百合不是茶
servletget提交java处理post提交
Servlet是tomcat中的一个重要组成,也是负责客户端和服务端的中介
1,Http的请求方式(get ,post);
客户端的请求一般都会都是Servlet来接受的,在接收之前怎么来确定是那种方式提交的,以及如何反馈,Servlet中有相应的方法, http的get方式 servlet就是都doGet(
- web.xml配置详解之listener
bijian1013
javaweb.xmllistener
一.定义
<listener>
<listen-class>com.myapp.MyListener</listen-class>
</listener>
二.作用 该元素用来注册一个监听器类。可以收到事件什么时候发生以及用什么作为响
- Web页面性能优化(yahoo技术)
Bill_chen
JavaScriptAjaxWebcssYahoo
1.尽可能的减少HTTP请求数 content
2.使用CDN server
3.添加Expires头(或者 Cache-control) server
4.Gzip 组件 server
5.把CSS样式放在页面的上方。 css
6.将脚本放在底部(包括内联的) javascript
7.避免在CSS中使用Expressions css
8.将javascript和css独立成外部文
- 【MongoDB学习笔记八】MongoDB游标、分页查询、查询结果排序
bit1129
mongodb
游标
游标,简单的说就是一个查询结果的指针。游标作为数据库的一个对象,使用它是包括
声明
打开
循环抓去一定数目的文档直到结果集中的所有文档已经抓取完
关闭游标
游标的基本用法,类似于JDBC的ResultSet(hasNext判断是否抓去完,next移动游标到下一条文档),在获取一个文档集时,可以提供一个类似JDBC的FetchSize
- ORA-12514 TNS 监听程序当前无法识别连接描述符中请求服务 的解决方法
白糖_
ORA-12514
今天通过Oracle SQL*Plus连接远端服务器的时候提示“监听程序当前无法识别连接描述符中请求服务”,遂在网上找到了解决方案:
①打开Oracle服务器安装目录\NETWORK\ADMIN\listener.ora文件,你会看到如下信息:
# listener.ora Network Configuration File: D:\database\Oracle\net
- Eclipse 问题 A resource exists with a different case
bozch
eclipse
在使用Eclipse进行开发的时候,出现了如下的问题:
Description Resource Path Location TypeThe project was not built due to "A resource exists with a different case: '/SeenTaoImp_zhV2/bin/seentao'.&
- 编程之美-小飞的电梯调度算法
bylijinnan
编程之美
public class AptElevator {
/**
* 编程之美 小飞 电梯调度算法
* 在繁忙的时间,每次电梯从一层往上走时,我们只允许电梯停在其中的某一层。
* 所有乘客都从一楼上电梯,到达某层楼后,电梯听下来,所有乘客再从这里爬楼梯到自己的目的层。
* 在一楼时,每个乘客选择自己的目的层,电梯则自动计算出应停的楼层。
* 问:电梯停在哪
- SQL注入相关概念
chenbowen00
sqlWeb安全
SQL Injection:就是通过把SQL命令插入到Web表单递交或输入域名或页面请求的查询字符串,最终达到欺骗服务器执行恶意的SQL命令。
具体来说,它是利用现有应用程序,将(恶意)的SQL命令注入到后台数据库引擎执行的能力,它可以通过在Web表单中输入(恶意)SQL语句得到一个存在安全漏洞的网站上的数据库,而不是按照设计者意图去执行SQL语句。
首先让我们了解什么时候可能发生SQ
- [光与电]光子信号战防御原理
comsci
原理
无论是在战场上,还是在后方,敌人都有可能用光子信号对人体进行控制和攻击,那么采取什么样的防御方法,最简单,最有效呢?
我们这里有几个山寨的办法,可能有些作用,大家如果有兴趣可以去实验一下
根据光
- oracle 11g新特性:Pending Statistics
daizj
oracledbms_stats
oracle 11g新特性:Pending Statistics 转
从11g开始,表与索引的统计信息收集完毕后,可以选择收集的统信息立即发布,也可以选择使新收集的统计信息处于pending状态,待确定处于pending状态的统计信息是安全的,再使处于pending状态的统计信息发布,这样就会避免一些因为收集统计信息立即发布而导致SQL执行计划走错的灾难。
在 11g 之前的版本中,D
- 快速理解RequireJs
dengkane
jqueryrequirejs
RequireJs已经流行很久了,我们在项目中也打算使用它。它提供了以下功能:
声明不同js文件之间的依赖
可以按需、并行、延时载入js库
可以让我们的代码以模块化的方式组织
初看起来并不复杂。 在html中引入requirejs
在HTML中,添加这样的 <script> 标签:
<script src="/path/to
- C语言学习四流程控制if条件选择、for循环和强制类型转换
dcj3sjt126com
c
# include <stdio.h>
int main(void)
{
int i, j;
scanf("%d %d", &i, &j);
if (i > j)
printf("i大于j\n");
else
printf("i小于j\n");
retu
- dictionary的使用要注意
dcj3sjt126com
IO
NSDictionary *dict = [NSDictionary dictionaryWithObjectsAndKeys:
user.user_id , @"id",
user.username , @"username",
- Android 中的资源访问(Resource)
finally_m
xmlandroidStringdrawablecolor
简单的说,Android中的资源是指非代码部分。例如,在我们的Android程序中要使用一些图片来设置界面,要使用一些音频文件来设置铃声,要使用一些动画来显示特效,要使用一些字符串来显示提示信息。那么,这些图片、音频、动画和字符串等叫做Android中的资源文件。
在Eclipse创建的工程中,我们可以看到res和assets两个文件夹,是用来保存资源文件的,在assets中保存的一般是原生
- Spring使用Cache、整合Ehcache
234390216
springcacheehcache@Cacheable
Spring使用Cache
从3.1开始,Spring引入了对Cache的支持。其使用方法和原理都类似于Spring对事务管理的支持。Spring Cache是作用在方法上的,其核心思想是这样的:当我们在调用一个缓存方法时会把该方法参数和返回结果作为一个键值对存放在缓存中,等到下次利用同样的
- 当druid遇上oracle blob(clob)
jackyrong
oracle
http://blog.csdn.net/renfufei/article/details/44887371
众所周知,Oracle有很多坑, 所以才有了去IOE。
在使用Druid做数据库连接池后,其实偶尔也会碰到小坑,这就是使用开源项目所必须去填平的。【如果使用不开源的产品,那就不是坑,而是陷阱了,你都不知道怎么去填坑】
用Druid连接池,通过JDBC往Oracle数据库的
- easyui datagrid pagination获得分页页码、总页数等信息
ldzyz007
var grid = $('#datagrid');
var options = grid.datagrid('getPager').data("pagination").options;
var curr = options.pageNumber;
var total = options.total;
var max =
- 浅析awk里的数组
nigelzeng
二维数组array数组awk
awk绝对是文本处理中的神器,它本身也是一门编程语言,还有许多功能本人没有使用到。这篇文章就单单针对awk里的数组来进行讨论,如何利用数组来帮助完成文本分析。
有这么一组数据:
abcd,91#31#2012-12-31 11:24:00
case_a,136#19#2012-12-31 11:24:00
case_a,136#23#2012-12-31 1
- 搭建 CentOS 6 服务器(6) - TigerVNC
rensanning
centos
安装GNOME桌面环境
# yum groupinstall "X Window System" "Desktop"
安装TigerVNC
# yum -y install tigervnc-server tigervnc
启动VNC服务
# /etc/init.d/vncserver restart
# vncser
- Spring 数据库连接整理
tomcat_oracle
springbeanjdbc
1、数据库连接jdbc.properties配置详解 jdbc.url=jdbc:hsqldb:hsql://localhost/xdb jdbc.username=sa jdbc.password= jdbc.driver=不同的数据库厂商驱动,此处不一一列举 接下来,详细配置代码如下:
Spring连接池  
- Dom4J解析使用xpath java.lang.NoClassDefFoundError: org/jaxen/JaxenException异常
xp9802
用Dom4J解析xml,以前没注意,今天使用dom4j包解析xml时在xpath使用处报错
异常栈:java.lang.NoClassDefFoundError: org/jaxen/JaxenException异常
导入包 jaxen-1.1-beta-6.jar 解决;
&nb