RDKit toolkit实战三：描述符计算及可视化

 

Descriptor Calculation   &   Visualization of Descriptors

 

Linux（CentOS 7_x64位）系统下安装RDkit(修正)点击打开链接

RDKit toolkit实战演练学习一下，参考网站点击打开链接

描述符计算在结构搜索比对以及QSAR中应用很广。

 

#!Python2.7
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Descriptors
from rdkit.Chem import AllChem
from rdkit.Chem.Draw import SimilarityMaps

m = Chem.MolFromSmiles('c1ccccc1C(=O)O')

Descriptors.TPSA(m)

m = Chem.MolFromSmiles('c1ccccc1C(=O)O')

AllChe