PYTHON h5py库包安装及读写

一、h5py库包安装

1. 在线安装

基本方法：

cmd安装：pip install h5py
pycharm环境：file-->setting-->PROJECT-->Project interpreter-->**+**-->搜索需要的库包-->installing

然而，本人在线安装该库包时报错，猜测可能原因是依赖环境下载问题，于是下载相应库包并手动安装：

2. 离线安装

2.1 登录PYPI网站下载所需库包

网址：https://pypi.org/
搜索h5py库包和相应的依赖库包six库包，下载对应python版本及个人计算机的库包

ATTENTION：在python中安装h5py库包需要的依赖条件：six库包，我们要同时下载该库包，先安装之

2.2 cmd安装下载的whl文件

以windows 64位系统+python3.6环境为例：
下载了h5py-2.10.0-cp36-cp36m-win_amd64.whl和six-1.14.0-py2.py3-none-any.whl二库包

1. 打开cmd窗口，转到下载的库包位置：cd D:\\支持环境软件\python包
2. 先安装依赖环境，输入命令pip install six-1.14.0-py2.py3-none-any.whl
3. 安装h5py库包，输入命令pip install h5py-2.10.0-cp36-cp36m-win_amd64.whl

OK！

二、h5py基本操作

1. HDF/h5文件基本构成

可以将h5文件理解成文件夹系统，group就是文件夹，dataset就是文件。
group里面可以存储group以及dataset。

2. 写——利用h5py库包创建h5文件及其group和dataset

import numpy as np
import h5py

2.1 创建一个h5文件，文件指针是f

f = h5py.File('HDF5_FILE.h5','a')

创建模式：

r	Readonly, file must exist，仅读，文件必须已经存在
r+	Read/write, file must exist，读写，文件必须已经存在
w	Create file, truncate if exists，新建文件，如果存在则覆盖
w- or x	Create file, fail if exists，新建文件，如果存在则新建失败
a	Read/write if exists, create otherwise (default)，如果文件存在则读写，如果不存在则覆盖

2.2 对创建的h5文件创建其group和dataset：

假设我要创建3个group：Information、Data_group、Data_parameter
g1 = f.create_group("Information")
g2 = f.create_group("Data_group")
g3 = f.create_group("Data_parameter")

在Information组里面创建数据集:

a. 数据为numpy格式：
Inf_Data = np.array([[67.5,1],[350,4],[6.70,4.9],[10,58.4],[12000,97]])
d1 = g1.create_dataset('Spectrum_Resolution', data=SpeReData)

添加attribute:

d1.attrs['col1'] = 'Center Length'
d1.attrs['unit'] = 'm'

b. 数据为str数组：
dt = h5py.special_dtype(vlen=str) # 计划创建的数据格式是str
data = np.array([['slavery'],['kmi']])
d1 = g1.create_dataset('Slavery', data.shape, dtype=dt)
d1[:] = data

3. 读——获取h5文件各group和dataset信息

稍后发布

4. 批量读写

5. 整体代码