由于这一段时间从事目标检测相关工作,因而接触到yolov3,进行目标检测,具体原理大家可以参考大神的博客目标检测(九)--YOLO v1,v2,v3,我就不细讲了,直接进入正题,如何利用深度学习框架PyTorch对自己的数据进行训练以及最后的预测。
首先我们要对自己的数据进行标注,标注的工具LabelImg,如果是windows用户的话,可以直接下载可执行文件,labelImg的下载地址以及使用,可以参考博客windows下使用labelImg标注图像,使用的图示如下
得到标注后的xml文件
Desktop
BloodImage_00000.jpg
/Users/xxx/Desktop/BloodImage_00000.jpg
640
480
3
0
我们本次训练的数据集是进行细胞的检测,已经标注好的数据链接红细胞检测,主要分两部分图像和标注。
我们将labels在图像中标注可以得到
由于本次不采用官网的代码,使用PyTorch框架,这里我们采用github上https://github.com/ultralytics/yolov3,clone下来,目录如下
注:makeTxt.py和voc_label.py文件是后面添加到。
为了能够用clone下来的工程进行训练和预测,我们需要对数据进行处理,以适应相应的接口。
1.将细胞数据Annotations和JPEGImages放入data目录下,并新建文件ImageSets,labels,复制JPEGImages,重命名images,
2.运行根目录下makeTxt.py,将数据分成训练集,测试集和验证集,其中比例可以在代码设置,代码如下
import os
import random
trainval_percent = 0.1
train_percent = 0.9
xmlfilepath = 'data/Annotations'
txtsavepath = 'data/ImageSets'
total_xml = os.listdir(xmlfilepath)
num = len(total_xml)
list = range(num)
tv = int(num * trainval_percent)
tr = int(tv * train_percent)
trainval = random.sample(list, tv)
train = random.sample(trainval, tr)
ftrainval = open('data/ImageSets/trainval.txt', 'w')
ftest = open('data/ImageSets/test.txt', 'w')
ftrain = open('data/ImageSets/train.txt', 'w')
fval = open('data/ImageSets/val.txt', 'w')
for i in list:
name = total_xml[i][:-4] + '\n'
if i in trainval:
ftrainval.write(name)
if i in train:
ftest.write(name)
else:
fval.write(name)
else:
ftrain.write(name)
ftrainval.close()
ftrain.close()
fval.close()
ftest.close()
在ImageSets得到四个文件,其中我们主要关注的是train.txt,test.txt,val.txt,文件里主要存储图片名称。
3.运行根目录下voc_label.py,得到labels的具体内容以及data目录下的train.txt,test.txt,val.txt,这里的train.txt与之前的区别在于,不仅仅得到文件名,还有文件的具体路径。voc_label.py的代码如下
import xml.etree.ElementTree as ET
import pickle
import os
from os import listdir, getcwd
from os.path import join
sets = ['train', 'test','val']
classes = ["RBC"]#我们只是检测细胞,因此只有一个类别
def convert(size, box):
dw = 1. / size[0]
dh = 1. / size[1]
x = (box[0] + box[1]) / 2.0
y = (box[2] + box[3]) / 2.0
w = box[1] - box[0]
h = box[3] - box[2]
x = x * dw
w = w * dw
y = y * dh
h = h * dh
return (x, y, w, h)
def convert_annotation(image_id):
in_file = open('data/Annotations/%s.xml' % (image_id))
out_file = open('data/labels/%s.txt' % (image_id), 'w')
tree = ET.parse(in_file)
root = tree.getroot()
size = root.find('size')
w = int(size.find('width').text)
h = int(size.find('height').text)
for obj in root.iter('object'):
difficult = obj.find('difficult').text
cls = obj.find('name').text
if cls not in classes or int(difficult) == 1:
continue
cls_id = classes.index(cls)
xmlbox = obj.find('bndbox')
b = (float(xmlbox.find('xmin').text), float(xmlbox.find('xmax').text), float(xmlbox.find('ymin').text),
float(xmlbox.find('ymax').text))
bb = convert((w, h), b)
out_file.write(str(cls_id) + " " + " ".join([str(a) for a in bb]) + '\n')
wd = getcwd()
print(wd)
for image_set in sets:
if not os.path.exists('data/labels/'):
os.makedirs('data/labels/')
image_ids = open('data/ImageSets/%s.txt' % (image_set)).read().strip().split()
list_file = open('data/%s.txt' % (image_set), 'w')
for image_id in image_ids:
list_file.write('data/images/%s.jpg\n' % (image_id))
convert_annotation(image_id)
list_file.close()
labels文件下的具体labels信息
data目录下train.txt
1.在data目录下新建rbc.data,配置训练的数据,内容如下
classes=1
train=data/train.txt
valid=data/test.txt
names=data/rbc.names
backup=backup/
eval=coco
2.在data目录下新建rbc.names,配置预测的类别,内容如下
3.网络结构配置,在原工程下cfg目录下有很多的yolov3网络结构,我们本次采用的是yolov3-tiny.cfg
具体参数的意义可以参考博客YOLOV3实战4:Darknet中cfg文件说明和理解和yolo配置文件的参数说明和reorg层的理解!
因为我们只是估计了一个类,所以需要对cfg文件进行修改,yolov3-tiny.cfg
[net]
# Testing
batch=1
subdivisions=1
# Training
# batch=64
# subdivisions=2
width=416
height=416
channels=3
momentum=0.9
decay=0.0005
angle=0
saturation = 1.5
exposure = 1.5
hue=.1
learning_rate=0.001
burn_in=1000
max_batches = 500200
policy=steps
steps=400000,450000
scales=.1,.1
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=16
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[maxpool]
size=2
stride=2
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=32
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[maxpool]
size=2
stride=2
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=64
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[maxpool]
size=2
stride=2
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=128
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[maxpool]
size=2
stride=2
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=256
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[maxpool]
size=2
stride=2
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=512
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[maxpool]
size=2
stride=1
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=1024
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
###########
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=256
size=1
stride=1
pad=1
activation=leaky
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=512
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[convolutional]
size=1
stride=1
pad=1
filters=18
activation=linear
[yolo]
mask = 3,4,5
anchors = 10,14, 23,27, 37,58, 81,82, 135,169, 344,319
classes=1
num=6
jitter=.3
ignore_thresh = .7
truth_thresh = 1
random=1
[route]
layers = -4
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=128
size=1
stride=1
pad=1
activation=leaky
[upsample]
stride=2
[route]
layers = -1, 8
[convolutional]
batch_normalize=1
filters=256
size=3
stride=1
pad=1
activation=leaky
[convolutional]
size=1
stride=1
pad=1
filters=18 #3*(class + 4 + 1)
activation=linear
[yolo]
mask = 0,1,2
anchors = 10,14, 23,27, 37,58, 81,82, 135,169, 344,319
classes=1
num=6
jitter=.3
ignore_thresh = .7
truth_thresh = 1
random=1
注:修改的地方主要是filter,因为我们每一个网格就预测3个anchor结果,所以filter =3*(1 + 5)=18
4.获取官网已经训练好的网络参数yolov3-tiny.weights,下载链接https://pjreddie.com/media/files/yolov3-tiny.weights,导入weights目录下,由于需要进行fine-tune,所以需要对yolov3-tiny.weights进行改造,因而需要下载官网的代码https://github.com/pjreddie/darknet,运行一下脚本,并将得到的yolov3-tiny.conv.15导入weights目录下,脚本如下
./darknet partial cfg/yolov3-tiny.cfg yolov3-tiny.weights yolov3-tiny.conv.15 15
这里,我直接提供yolov3-tiny.conv.15下载地址。
如果是其他结构的网络,那么可以参考download_yolov3_weights.sh中的说明,里面有详细的介绍。
一切准备妥当,我们就可以开始训练了,训练脚本如下
python train.py --data-cfg data/rbc.data --cfg cfg/yolov3-tiny.cfg --epochs 10
得到训练好的模型best.pt
训练结果如下(这里只有10次迭代的结果)
我们将得到的模型进行预测,这里代预测的图片我们放在data/samples目录下
运行以下脚本
python detect.py --data-cfg data/rbc.data --cfg cfg/yolov3-tiny.cfg --weights weights/best.pt
得到的结果可以在output目录
可以看出来效果一般,主要我们的网络结构较简单,同时迭代的次数较少。
以上就是 利用PyTorch版本,通过YOLOV3训练自己的数据集的整个过程,我也是刚刚起步,希望大家一起学习加油。?