用 Matlab 计算并画出大量数据的CDF

   这篇 blog 将展示用 matlab 计算并画出大量数据的 CDF (累计分布函数)的两种方法。第一种是我自己于2012年写的,后来用的过程中发现有缺陷;后来2014年写另一篇paper时,搜寻到第二种简易又高效的方法。这里我给出它们各自的用例,包括画图用的数据与脚本,以及效果图。For your reference.

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     Section A. 第一种方法

     今天(2012-10-17)有一些数据需要处理,这些数据好不容易从文件中剥离了出来,然后自己写了一个function,计算并控制 plot 这些数据的 CDF 图。因为第一种方法用到的例子的数据文件太大,就没有贴上来。如果有想亲自试验一下这个过程的同学,请参照下文中第二个方法中的完整用例。

% ----------------------- 自实现 CDF 计算 function:  funcCDF.m

[plain] view plaincopy
  1. % para@1: CNT_pnts, the number of points to denote the CDF;  
  2. % para@2: Range_low, the lower bound of variable;  
  3. % para@3: Range_up, the upper bound of variable;  
  4. % para@4 : arr_Vals, array of the values to be processed.  
  5.   
  6. function [x, CDF_Vals] = funcCDF(CNT_pnts, Range_low, Range_up, arr_Vals)  
  7. data = sort( arr_Vals' ); % T', horizon arrays of T.  
  8. N = length(data);  
  9. stepLen = (Range_up-Range_low)/CNT_pnts;  
  10. Counter = zeros(1,CNT_pnts);  
  11. for i = 1:1:N  
  12.     for j = 1:1:CNT_pnts  
  13.         if ( data(1,i) <= (Range_low + j*stepLen) )  
  14.             Counter(1,j) = Counter(1,j) + 1;  
  15.         end  
  16.     end  
  17. end  
  18. CDF = Counter(1,:)./N;  
  19. CDF_Vals = CDF(1,:)';  
  20. x = (Range_low+stepLen):stepLen:Range_up;  
  21. % ---- end of func.  


% --------------------- 2 use cases:

[plain] view plaincopy
  1. CNT_pnts = 100;  
  2. deadline_N500r1 = 550;  
  3. deadline_N500r3 = 270;  
  4. deadline_N500r5 = 240;  
  5. PntVal_N500Tau100r1 = textread('N500Tau100r1.tr','%*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %.2f');  
  6. [x_r1,cdf_r1] = funcCDF(CNT_pnts, 0, deadline_N500r1, PntVal_N500Tau100r1);  
  7. plot(x_r1, cdf_r1, 'ob')  
  8. hold on  
  9.   
  10. PntVal_N500Tau100r3 = textread('N500Tau100r3.tr','%*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %.2f');  
  11. [x_r3,cdf_r3] = funcCDF(CNT_pnts, 0, deadline_N500r3, PntVal_N500Tau100r3);  
  12. plot(x_r3, cdf_r3, 'or')  
  13. hold on  
  14.   
  15. PntVal_N500Tau100r5 = textread('N500Tau100r5.tr','%*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %*s %.2f');  
  16. [x_r5,cdf_r5] = funcCDF(CNT_pnts, 0, deadline_N500r5, PntVal_N500Tau100r5);  
  17. plot(x_r5, cdf_r5, 'oc')  
  18. grid  


% --------------------- 3 效果图:

Fig.1 CDF_N200r3--Tau-60-80-100-100Pnts



Fig.2 CDF_N500Tau100--r-1-3-5-100Pnts



      当把参数 CNT_pnts = 100; 调为 CNT_pnts = 50; 后,显示在图中的点就会减少一半,shows as follow:

Fig.3 CDF_N500Tau100--r-1-3-5-50Pnts



Davy_H (2012-10-17)

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    Section B. 第二种方法

    今天(2014-10-15) 回过头来看这篇blog,前边贴的图太丑,而且其实第一种方法有不完美的地方,即数据少的时候,曲线有时不会从原点开始画。后来寻到更好的方法来画 CDF 图,为了对得起2000+的访问量,所以,今日我决定花些时间,把更好的例子分享出来。

    废话不多说:1)效果图;2)部分数据文件;3)画图的脚本。


1) ------------------ 




3) ------------------ Codes:

[python] view plaincopy
  1. clear;  
  2.   
  3. % --------------- A. Read the Data.  
  4. X_ = textread('_Trace_file.tr','%*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%f');  
  5. CNT_resolve_times = textread('_Trace_file.tr','%*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%*s %*s%d %*s%*s' );  
  6.   
  7.   
  8. % --------------- B. Count the the Costs.  
  9.   
  10. % --------- X_items is the "-Threshold"  
  11. X_items =[0.0,0.01,0.05,0.1,0.2,0.3];  
  12.   
  13. CNT_X = length(X_items);  
  14.   
  15. % --------- Define the range_x of the x_coordinate in the figure.  
  16. step = 1;  
  17. range_end = 50;  
  18. range_x = 0:step:range_end;  
  19.   
  20. figure  
  21.     % ---------- Format of figure:  
  22.     TextFontSize=18;  
  23.     LegendFontSize = 16;  
  24.     set(0,'DefaultAxesFontName','Times',...  
  25.         'DefaultLineLineWidth',2,...  
  26.         'DefaultLineMarkerSize',8);  
  27.     set(gca,'FontName','Times New Roman','FontSize',TextFontSize);  
  28.     set(gcf,'Units','inches','Position',[0 0 6.0 4.0]);  
  29.     % ---------- Format of figure:~   
  30.       
  31.   
  32. % ------ Plot lines  
  33. for i = 1:1:CNT_X  
  34.     Val_item = X_items(i);    
  35.     idx_it_Lazy = find( X_ == Val_item );  
  36.   
  37.     % --- 1 CNT_STimes  
  38.     CNT_Re_times_its = [];  
  39.     CNT_Re_times_its = CNT_resolve_times( idx_it_Lazy );  
  40.       
  41.     % --- 2 Plot CDF of CNT_Resloving_times, i.e., the "CNT_STimes" in the trace file.  
  42.     if (i==1) linePoint_type = '-sk'; step = 5; range_x = 0:step:range_end;  
  43.     elseif (i==2) linePoint_type = '-^r';  
  44.     elseif (i==3) linePoint_type = '-+b'; step = 1; range_x = 0:step:range_end;  
  45.     elseif (i==4) linePoint_type = '-c';  step = 1; range_x = 0:step:range_end;  
  46.     elseif (i==5) linePoint_type = '--g'; step = 1; range_x = 0:step:range_end;  
  47.     elseif (i==6) linePoint_type = '-.m'; step = 1; range_x = 0:step:range_end;  
  48.     end  
  49.       
  50.     %%% ====== Critical Code of CDF-Ploting :  
  51.     h_rtl = hist( CNT_Re_times_its, range_x );  
  52.     pr_approx_cdf = cumsum(h_rtl) / ( sum(h_rtl) );  
  53.     %%% ====== Critical Code of CDF-Ploting :~  
  54.       
  55.     handler = plot( range_x, pr_approx_cdf, linePoint_type );  
  56.     if      (i==4) h4 = handler;  
  57.     elseif  (i==5) h5 = handler;  
  58.     elseif  (i==6) h6 = handler;  
  59.     end  
  60.     hold on  
  61. end  
  62.   
  63. % --------- Set the other formats of the figure :  
  64.     grid off  
  65.     axis([0 range_end 0 1.0])  
  66.     ylabel('CDF')  
  67.     xlabel('Resolving times')  
  68.       
  69.     % --------- Plot the multi-legends :  
  70.     hg1=legend('{\it \chi_0}=0''{\it \chi_0}=0.01''{\it \chi_0}=0.05',  0);  
  71.     set(hg1,'FontSize',LegendFontSize);  
  72.   
  73.     ah1 = axes('position',get(gca,'position'), 'visible','off');    
  74.   
  75.     hg2 = legend(ah1, [h4,h5,h6],  '{\it \chi_0}=0.10','{\it \chi_0}=0.20','{\it \chi_0}=0.30',  0);  
  76.     set(hg2,'FontSize',LegendFontSize);  
  77.     % --------- Plot the multi-legends :~  
  78. % --------- Set the other formats of the figure :~  

    关键代码处,我已经做了注释,此处再强调一下:

    1. 画 CDF 的2句关键代码,其中的3个 functions 请自己查询。

    %%% ====== Critical operation of CDF-Ploting :
    h_rtl = hist ( CNT_Re_times_its, range_x );
    pr_approx_cdf = cumsum(h_rtl) / ( sum(h_rtl) );
    %%% ====== Critical operation of CDF-Ploting :~

  

    2. for 循环中的那一段 if else 语句,是为了设置各条曲线的点线型( linePoint type ) 与 各条线上的取样点的密度。  

    3. 此外,从这个脚本里,也可以额外获取画多个图例 (plot multiple legends) 的方法。

y = evrnd(0,3,100,1);

cdfplot(y);

hold on;

x = -20:0.1:10;

f = evcdf(x,0,3);

plot(x,f,'m');

legend('Empirical','Theoretical','Location','NW')

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