SimpleITK读取医学图像 .nii 数据(2D显示)

【环境】win10 + python3.6 + SimpleITK
nii文件是NIFTI格式的文件,出现的原因是原来一种图像格式是ANALYZE 7.5 format,但是这个图像格式缺少一些信息,比如没有方向信息,病人的左右方位等,如果需要包括额外的信息,就需要一个额外的文件,比如ANALYZE7.5就需要一对<.hdr, .img>文件来保存图像的完整信息。因此,解决这个问题Data Format Working Group (DFWG) 将图像格式完整的定义为NIFTI(Neuroimaging Informatics Technology Initiative)格式

import SimpleITK as sitk
import skimage.io as io

def read_img(path):
    img = sitk.ReadImage(path)
    data = sitk.GetArrayFromImage(img)
    return data
#显示一个系列图
def show_img(data):
    for i in range(data.shape[0]):
        io.imshow(data[i,:,:], cmap = 'gray')
        print(i)
        io.show()
 
#单张显示
def show_img(ori_img):
    io.imshow(ori_img[100], cmap = 'gray')
    io.show()

#window下的文件夹路径    
path = 'D:\\datasets\\Naso_GTV\\1\\data.nii.gz'
data = read_img(path)
show_img(data)

SimpleITK读取医学图像 .nii 数据(2D显示)_第1张图片

img = sitk.ReadImage(path)
#查看图片深度
print(img.GetDepth())
#144 共144张图
#查看Size
print(img.GetSize())
#(512,512,144) 像素:512*512, 144张图片

更多的函数自己去发现
SimpleITK读取医学图像 .nii 数据(2D显示)_第2张图片

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