N5. 贝叶斯 猪 杂交优势

1. Silio L. Heterosis for litter size and growth in crosses of four strains of Iberian pig. Livest. Sci. 2012;147:1–8.

杂交育种能将亲本的遗传优势及杂交优势传递给F1代。遗传优势及杂交优势是林木杂交育种系统中选择效率的主要遗传组成。杂交优势取决于育种群体中基因频率差异(Falconer, 1981) 。相对于植物育种，动物育种中很少采用双列交配设计，而是主要集中于发掘生产力最高的遗传组合(Comerford et al., 1988; Orengoet al., 2009)。多数家畜群体的遗传异质性是杂交育种参数估计的另一个困难，因为杂交育种群之间的子代分布是不平衡的。Komender and Hoeschele (1989)给出了动物模型的优势，考虑所有个体间遗传关系来避免不平衡杂交实验分析中的不平衡估计 。
之前的研究证实不同的parities 之间遗传控制有部分不同(Ferna ´ndezet al., 2008)。因此，杂交优势和亲本效应在连续的parities中也可能不同，需要利用多性状动物模型。

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双性状动物模型：

模型中随机效应方差-协方差矩阵：

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多性状动物模型：

模型中随机效应方差-协方差矩阵：

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分层贝叶斯解释下，联合后验分布可以解释成似然函数乘以这些参数的先验分布。

利用吉布斯采样算法得到每个变量的后验分布的边际(Geman and Geman, 1984; Wang et al., 1994)。这个方法提供了所有参数的边际后验分布。推断集中于边际后验分布的均值和标准离差以及参数的后验概率区间。通过双链法评估模型收敛(Garcı ´a Corte ´s et al., 1998), ，从斜率的加性方差的不同初始值双取样。