MongoDB内存使用分析和优化

MongoDB内存占用点

Mongod 进程启动后,除了跟普通进程一样,加载 binary、依赖的各种library 到内存,其作为一个DBMS,还需要负责客户端连接管理,请求处理,数据库元数据、存储引擎等很多工作,这些工作都涉及内存的分配与释放,默认情况下,MongoDB 使用 Google tcmalloc 作为内存分配器,内存占用的主要是「存储引擎」与 「客户端连接及请求的处理」。

存储引擎

MongoDB 3.2 及以后,默认使用 WiredTiger 存储引擎,可通过 cacheSizeGB 选项配置 WiredTiger 引擎使用内存的上限,一般建议配置在系统可用内存的60%左右(默认配置)。

举个例子,如果 cacheSizeGB 配置为 10GB,可以认为 WiredTiger 引擎通过tcmalloc分配的内存总量不会超过10GB。为了控制内存的使用,WiredTiger 在内存使用接近一定阈值就会开始做淘汰,避免内存使用满了阻塞用户请求。

目前有4个可配置的参数来支持 wiredtiger 存储引擎的 eviction 策略(一般不需要修改),其含义是:

参数 默认值 含义
eviction_target 80 当 cache used 超过 eviction_target,后台evict线程开始淘汰 CLEAN PAGE
eviction_trigger 95 当 cache used 超过 eviction_trigger,用户线程也开始淘汰 CLEAN PAGE
eviction_dirty_target 5 当 cache dirty 超过 eviction_dirty_target,后台evict线程开始淘汰 DIRTY PAGE
eviction_dirty_trigger 20 当 cache dirty 超过 eviction_dirty_trigger, 用户线程也开始淘汰 DIRTY PAGE

在这个规则下,一个正常运行的 MongoDB 实例,cache used 一般会在 0.8 * cacheSizeGB 及以下,偶尔超出问题不大;如果出现 used>=95% 或者 dirty>=20%,并一直持续,说明内存淘汰压力很大,用户的请求线程会阻塞参与page淘汰,请求延时就会增加,这时可以考虑「扩大内存」或者 「换更快的磁盘提升IO能力」。

TCP 连接及请求处理

MongoDB Driver 会跟 mongod 进程建立 tcp 连接,并在连接上发送数据库请求,接受应答,tcp 协议栈除了为连接维护socket元数据,每个连接会有一个read buffer及write buffer,用户收发网络包,buffer的大小通过如下sysctl系统参数配置,分别是buffer的最小值、默认值以及最大值,详细解读可以google。

net.ipv4.tcp_wmem = 8192  65536  16777216
net.ipv4.tcp_rmem = 8192  87380  16777216

redhat7(redhat6上并没有导出这么详细的信息) 上通过 ss -m 可以查看每个连接的buffer的信息,如下是一个示例,读写 buffer 分别占了 2357478bytes、2626560bytes,即均在2MB左右;500个类似的连接就会占用掉 1GB 的内存;buffer 占到多大,取决于连接上发送/应答的数据包的大小、网络质量等,如果请求应答包都很小,这个buffer也不会涨到很大;如果包比较大,这个buffer就更容易涨的很大。

tcp    ESTAB      0      0                       127.0.0.1:51601                                 127.0.0.1:personal-agent
   skmem:(r0,rb2357478,t0,tb2626560,f0,w0,o0,bl0)

除了协议栈上的内存开销,针对每个连接,Mongod 会起一个单独的线程,专门负责处理这条连接上的请求,mongod 为处理连接请求的线程配置了最大1MB的线程栈,通常实际使用在几十KB左右,通过 proc 文件系统看到这些线程栈的实际开销。 除了处理请求的线程,mongod 还有一系列的后台线程,比如主备同步、定期刷新 Journal、TTL、evict 等线程,默认每个线程最大ulimit -s(一般10MB)的线程栈,由于这批线程数量比较固定,占的内存也比较可控。

# cat /proc/$pid/smaps

7f563a6b2000-7f563b0b2000 rw-p 00000000 00:00 0
Size:              10240 kB
Rss:                  12 kB
Pss:                  12 kB
Shared_Clean:          0 kB
Shared_Dirty:          0 kB
Private_Clean:         0 kB
Private_Dirty:        12 kB
Referenced:           12 kB
Anonymous:            12 kB
AnonHugePages:         0 kB
Swap:                  0 kB
KernelPageSize:        4 kB
MMUPageSize:           4 kB

线程在处理请求时,需要分配临时buffer存储接受到的数据包,为请求建立上下文(OperationContext),存储中间的处理结果(如排序、aggration等)以及最终的应答结果等。

当有大量请求并发时,可能会观察到 mongod 使用内存上涨,等请求降下来后又慢慢释放的行为,这个主要是 tcmalloc 内存管理策略导致的,tcmalloc 为性能考虑,每个线程会有自己的 local free page cache,还有 central free page cache;内存申请时,按 local thread free page cache ==> central free page cache 查找可用内存,找不到可用内存时才会从堆上申请;当释放内存时,也会归还到 cache 里,tcmalloc 后台慢慢再归还给 OS, 默认情况下,tcmalloc 最多会 cache min(1GB,1/8 * system_memory) 的内存, 通过 setParameter.tcmallocMaxTotalThreadCacheBytesParameter 参数可以配置这个值,不过一般不建议修改,尽量在访问层面做调优)

tcmalloc cache的管理策略,MongoDB 层暴露了几个参数来调整,一般不需要调整,如果能清楚的理解tcmalloc原理及参数含义,可做针对性的调优;MongoDB tcmalloc 的内存状态可以通过 db.serverStatus().tcmalloc 查看,具体含义可以看 tcmalloc 的文档。重点可以关注下 total_free_bytes,这个值告诉你有多少内存是 tcmalloc 自己缓存着,没有归还给 OS 的。

mymongo:PRIMARY> db.serverStatus().tcmalloc
{
    "generic" : {
        "current_allocated_bytes" : NumberLong("2545084352"),
        "heap_size" : NumberLong("2687029248")
    },
    "tcmalloc" : {
        "pageheap_free_bytes" : 34529280,
        "pageheap_unmapped_bytes" : 21135360,
        "max_total_thread_cache_bytes" : NumberLong(1073741824),
        "current_total_thread_cache_bytes" : 1057800,
        "total_free_bytes" : 86280256,
        "central_cache_free_bytes" : 84363448,
        "transfer_cache_free_bytes" : 859008,
        "thread_cache_free_bytes" : 1057800,
        "aggressive_memory_decommit" : 0,
        ...
    }
}

内存使用优化

合理配置 WiredTiger cacheSizeGB

  • 如果一个机器上只部署 Mongod,mongod 可以使用所有可用内存,则是用默认配置即可。
  • 如果机器上多个mongod混部,或者mongod跟其他的一些进程一起部署,则需要根据分给mongod的内存配额来配置 cacheSizeGB,按配额的60%左右配置即可。

控制并发连接数

TCP连接对 mongod 的内存开销上面已经详细分析了,很多同学对并发有一定误解,认为「并发连接数越高,数据库的QPS就越高」,实际上在大部分数据库的网络模型里,连接数过高都会使得后端内存压力变大、上下文切换开销变大,从而导致性能下降。

MongoDB driver 在连接 mongod 时,会维护一个连接池(通常默认100),当有大量的客户端同时访问同一个mongod时,就需要考虑减小每个客户端连接池的大小。mongod 可以通过配置 net.maxIncomingConnections 配置项来限制最大的并发连接数量,防止数据库压力过载。

配置 SWAP

官方文档上的建议配置一下swap,避免mongod因为内存使用太多而OOM。

开启 SWAP 与否各有优劣,SWAP开启,在内存压力大的时候,会利用SWAP磁盘空间来缓解内存压力,此时整个数据库服务会变慢,但具体变慢到什么程度是不可控的。不开启SWAP,当整体内存超过机器内存上线时就会触发OOM killer把进程干掉,实际上是在告诉你,可能需要扩展一下内存资源或是优化对数据库的访问了。

是否开启SWAP,实际上是在「好死」与「赖活着」的选择,个人觉得,对于一些重要的业务场景来说,首先应该为数据库规划足够的内存,当内存不足时,「及时调整扩容」比「不可控的慢」更好。

其他

  • 尽量减少内存排序的场景,内存排序一般需要更多的临时内存
  • 主备节点配置差距不要过大,备节点会维护一个buffer(默认最大256MB)用于存储拉取到oplog,后台从buffer里取oplog不断重放,当备同步慢的时候,这个buffer会持续使用最大内存。
  • 控制集合及索引的数量,减少databse管理元数据的内存开销;集合、索引太多,元数据内存开销是一方面的影响,更多的会影响启动加载的效率、以及运行时的性能。

参考:https://yq.aliyun.com/articles/685044?spm=a2c4e.11153940.blogrightarea60553.9.2a0e2e23YE5Bln

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