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lantary
博客原文宏基因组篇前言之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理,这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前,我们先来认识一下什么是宏基因组。以我的理解,宏基因组就是某环境中所有生物的基因组的合集,这个环境可以是下水道,河流等自然环境,也可以是人体内肠道,口腔等体环境。而宏基因组中的生物往往指的是微生物,如真菌,细菌,病毒,古细菌。我们这里主要以肠道微生物
- linux基础命令-管道符“|”
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linuxlinuxc#运维
管道符与命令结合应用:实现文本数据处理与分析在Linux操作系统中,管道符|是一个强大的工具,它允许将一个命令的输出直接传递给另一个命令的输入,实现不同命令之间的协同工作。结合管道符和各种命令,您可以在文本数据处理和分析方面做出令人惊叹的事情。本文将深入探讨使用管道符与一些常用命令结合的应用案例、原理以及实际操作。管道符的基本原理管道符|在Linux中的工作原理很简单。当您运行一个命令并在其后添加
- webGIS后端程序员学习路线
听忆.
日常开发学习
webGIS后端程序员学习路线1.GIS基础知识学习要点:学习资源:2.后端编程基础学习要点:学习资源:3.地理数据库(SpatialDatabase)学习要点:学习资源:4.空间数据处理与分析学习要点:学习资源:5.WebGIS服务器与Web服务学习要点:学习资源:6.缓存与优化学习要点:学习资源:7.前后端交互学习要点:学习资源:8.项目实战总结学习路线边走、边悟迟早会好WebGIS(WebG
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Spark高级应用使用Spark进行高级数据处理与分析引言在大数据时代,快速处理和分析海量数据是每个企业面临的重大挑战。ApacheSpark作为一种高效的分布式计算框架,凭借其高速、易用、通用和灵活的特点,已经成为大数据处理和分析的首选工具。本文将深入探讨如何使用Spark进行高级数据处理与分析,通过实际案例和代码示例,帮助你掌握Spark的高级应用技巧。提出问题如何进行高效的大规模数据处理?如
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AIGC大数据实验室是一个专注于人工智能生成内容(AIGC)和大数据相关技术研究、开发与应用的创新实验平台。AIGC主要研究方向包括:AIGC技术创新、大数据处理与分析、AIGC与大数据融合应用。AIGC技术创新:探索如何利用人工智能算法,如深度学习中的生成对抗网络(GAN)、变分自编码器(VAE)、基于Transformer架构的语言模型(如GPT系列)等,来高效地生成高质量的文本、图像、音频、
- 个性化推荐系统-离线召回模型验证
山水阳泉曲
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文章目录背景前端核心组件模拟操作用户历史行为后端导入依赖启动服务根据uid获取推荐列表相关推荐用户历史记录用户行为数据上报背景计划构建并优化一个覆盖前端与后端的个性化推荐系统中的离线召回模块。此模块旨在通过高效的数据处理与分析,预先筛选出用户可能感兴趣的内容或商品,为后续的实时推荐流程提供丰富且精准的候选集。为了确保实施效果与性能,我们将设计最简前端界面以直观展示召回结果,同时构建后端服务来处理大
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目录引言环境准备智能医疗监控系统基础代码实现:实现智能医疗监控系统4.1数据采集模块4.2数据处理与分析模块4.3通信与网络系统实现4.4用户界面与数据可视化应用场景:医疗监控与优化问题解决方案与优化收尾与总结1.引言智能医疗监控系统通过STM32嵌入式系统结合各种传感器、执行器和通信模块,实现对医疗数据的实时监控、自动处理和数据传输。本文将详细介绍如何在STM32系统中实现一个智能医疗监控系统,
- 高通量测序的数据处理与分析(二)-宏基因组2
lantary
博客原文宏基因组数据处理方法数据下载wget下载宏基因组的数据主要分布在两个数据库:1.NCBI的SRA数据库,2.ENA。近年来也有许多研究者将数据上传到中国的数据库:NGDC你可以直接通过网页下载数据,或者是通过各个网站提供的下载工具进行批量下载。也可以到sra-exporter这个网站上输入项目号获得样本的下载链接。用wget或者其他下载工具进行下载,示例的命令如下:wget-cftp://
- 基于新型存储的大数据存储管理
唐名威
基于新型存储的大数据存储管理金培权1,21.中国科学技术大学计算机科学与技术学院,安徽合肥2300272.中国科学院电磁空间信息重点实验室,安徽合肥230027摘要:如何高效地存储大数据并支持实时大数据处理与分析是大数据技术发展面临的首要问题。近年来,以相变存储器、闪存等为代表的新型存储为实现高效的大数据存储和管理提供了新思路。以相变存储器为代表的存储级主存技术为切入点,针对大数据存储与管理中的高
- 人类与AI的优势互补
科学禅道
人工智能的未来人工智能
1.人类与AI的互补优势人类与AI的互补优势为双方创造了深度合作的基础。具体而言:大数据处理与分析:AI拥有强大的数据处理能力,可以在短时间内对海量数据进行挖掘和学习,发现其中隐藏的规律、趋势和关联性,这对于商业智能、科研探索以及预测模型构建等领域具有重大价值。重复任务效率提升:在诸如制造业、物流、客户服务等行业中,AI可以替代人工执行重复性高但创造性低的工作,如生产线上的精密装配、客服中的常见问
- Python之PySpark简单应用
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pythonpython开发语言大数据
文章目录一、介绍1.准备工作2.创建SparkSession对象:3.读取数据:4.数据处理与分析:5.停止SparkSession:二、示例1.读取解析csv数据2.解析计算序列数据map\flatmap三、问题总结1.代码问题2.配置问题一、介绍PySpark是ApacheSpark的PythonAPI,它允许开发人员使用Python编写并运行分布式大数据处理应用程序。通过PySpark,开发
- 基于Python的微信聊天记录分析——数据处理与分析
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pythonwechat数据分析数据挖掘中文分词
本篇为《基于Python的微信聊天记录分析》系列的第二篇,主要讲解获取到聊天记录数据之后,在Python环境下对其进行数据处理、分析和可视化,涉及库的安装、相关操作的Python代码等内容。希望和大家多多交流,共同进步!一.数据处理数据分析的基础是“数据”,俗话说基础不牢,地动山摇!对于聊天记录分析这件事儿来说,数据处理是十分有必要的,我们需要将茫茫多的记录中的无意义或意义不明数据过滤,这样才有助
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在数字化时代的前沿,边缘计算作为一项颠覆性技术,正以其独特的分布式架构和强大的本地处理能力深刻改变着数据处理与分析的方式。然而,这一技术革新也带来了复杂的安全防护需求、网络稳定性问题,同时也为各行业带来了前所未有的实时响应能力和经济效率提升。一、挑战篇:数据安全与隐私保护与网络稳定性难题数据安全与隐私保护边缘计算环境中,数据在设备端生成并进行初步处理,这无疑增加了数据泄露的风险点。一方面,分布广泛
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在一些导出业务场景中,经常需要将数据导出存储到excel,而Excel作为一个重要的工具,在数据处理与分析上也起到了至关重要的作用。但是,Excel的操作繁琐、效率低下等问题也制约着我们的工作效率。为了解决这个问题,我们可以使用EasyExcel这个优秀的Java类库,来优化Excel数据的读写,并提高我们的工作效率。在本文中,我将向大家介绍如何使用EasyExcel的高效技巧,从而更好地搞定Ex
- 大数据导论(3)---大数据技术
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文章目录1.大数据技术概述2.数据采集与预处理2.1数据采集2.2预处理3.数据存储和管理3.1分布式基础架构Hadoop3.2分布式文件系统HDFS3.3分布式数据库HBase3.4非关系型数据库NoSQL4.数据可视化与保护1.大数据技术概述 大数据技术主要包括数据采集与预处理、数据存储、数据处理与分析、数据可视化、数据安全和隐私保护等几个层面的内容。技术层面功能数据采集与预处理利用ETL工具
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阡之尘埃
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跑起来总会有风
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大家好,小编来为大家解答以下问题,python数据处理案例步骤及其代码,python数据处理与分析教程,现在让我们一起来看看吧!数据预处理前言一、熟悉数据1.1数据表的基本信息查看1.2查看数据表的大小1.3数据格式的查看1.4查看具体的数据分布二、缺失值处理2.1缺失值检查2.2缺失值删除2.3缺失值替换/填充三、重复值处理3.1发现重复值四、异常值的检测和处理4.1检测异常值4.2处理异常值五
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༺❀ൢ挽筝❀ൢ༻
pandaspython开发语言
1、使用数据差分查看员工业绩波动情况对表中的数据切分出姓名、日期和交易额三列数据以姓名和日期进行分组求和后将计算得到的差分作为最后一列输出。importpandasaspd#读取超市营业额2.xlsx中的Sheet1的数据data=pd.read_excel("E:\\Python\\超市营业额2.xlsx","Sheet1")#从data中通过切片的方式获取数据,并以姓名和日期进行分组求和dat
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༺❀ൢ挽筝❀ൢ༻
pandaspython开发语言
1、查看单日交易额最小的3天的交易数据,并查看这3天是周几;importpandasaspdimporttimedata=pd.read_excel('E:/Python/超市营业额2.xlsx','Sheet1')day=data.loc[:,['日期','交易额']].groupby('日期',as_index=False).sum()day=day.nsmallest(3,'交易额')day
- Pandas数据分析02——各类文件的读取和导出
阡之尘埃
pandas数据分析pandas数据分析数据挖掘python
参考书目:《深入浅出Pandas:利用Python进行数据处理与分析》pandas真的很强大,几乎什么格式的数据都能读取,什么csv,excel,spss,stata,json,html......连剪贴板的数据都能读.....本章教大家怎么读取数据,虽然简单读取就一句话,但是参数和功能还是很多的,都了解一下。读取CSV文件csv文件最基础的数据文件,介绍的最详细,因为别的文件的很多参数和csv读
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博客原文宏基因组宿主去污染在上一篇文章中,详细的介绍了宏基因组如何下载以及如何使用fastp进行质控,本篇文章主要聚焦于如何对宿主污染进行去除。如何判断存在宿主污染的方法在上一篇文章中有提到,即GC含量严重偏离正态分布时我们就认为原始数据存在宿主污染,这里介绍的去除宿主污染的工具是bowtie2,同样的也有很多其他软件可以做到去污染,如bwa,kneaddata等软件。事实上,去除宿主污染的基本原
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掌握分布式并行编程框架MapReduce掌握基于内存的分布式计算框架Spark理解MapReduce的工作流程、Spark运行原理熟悉机器学习概念一.MapReduceHadoopMapReduce是一个软件框架,基于该框架能够容易地编写应用程序,这些应用程序能够运行在由上千个商用机器组成的大集群上,并以一种可靠的,具有容错能力的方式并行地处理上TB级别的海量数据集。这个定义里面有着这些关键词,一
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导论(基于Hadoop的MapReduce的优缺点)MapReduce是一个分布式运算程序的编程框架,是用户开发“基于Hadoop的数据分析应用”的核心框架MapReduce是一种用于处理大规模数据集的编程模型和计算框架。它将数据处理过程分为两个主要阶段:Map阶段和Reduce阶段。在Map阶段,数据被分割为多个小块,并由多个并行运行的Mapper进行处理。在Reduce阶段,Mapper的输出
- 【全程记录】一次数据分析和可视化的大作业(python)
焚发图强
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一、概述本帖记录了一次从头到尾的作业过程(从导入数据集,经过数据处理与分析,到可视化数据,再到最终总结。包括遇到的问题与解决办法),其中运用到的知识来源于学校老师和bilibili教学视频,其中教学视频如下:【【莫烦Python】MatplotlibPython画图教程】https://www.bilibili.com/video/BV1Jx411L7LU?vd_source=6cd5aa6c6b
- 【 某景点舆情分析:Python、Echarts、Flask、文本处理技术的应用】
爱欲无极
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某景点舆情分析:Python、Echarts、Flask、文本处理技术的应用前言技术栈数据获取与准备景点数据统计分析评论数据处理与分析词频统计分词与文本处理情感分析数据可视化Web应用搭建结语前言随着旅游行业的蓬勃发展,越来越多的人通过网络平台获取关于各类景点的信息。本文将介绍如何利用Python、Echarts、Flask以及文本处理技术对某景点的数据进行综合分析,包括景点数据的统计分析以及对评
- 【无标题】
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中服云主营产品物联网大数据人工智能
中服云物联网开发平台4.0版主要包含8大能力:数据采集与控制、基础物联组件集、快速开发工具集、数据集管理、数据处理与分析、平台配置管理、手机端小程序、二次开发接口。是集开发、运行支撑、快速组装应用、数据调试仿真于一体的数据自动获取、数据分析、数据展示平台。其是设备与业务系统深度融合纽带,是数智化转型必不可少的核心支撑平台。产品特色【1】微服务组件化系统松耦合结构【2】强大的数据计算和分析能力【3】
- Python 数据处理与分析之 Pandas 库
墨鸦_Cormorant
Pythonpythonpandas开发语言
介绍Pandas(PythonDataAnalysisLibrary)是一个流行的Python第三方库,是数据处理和数据分析中不可或缺的工具之一,用于数据处理和数据分析。它提供了高效的数据分析方法和灵活且高效的数据结构。相比于其他的数据处理库,pandas更适用于处理具有关系型数据或者带标签数据的情况,在时间序列分析方面也有着不错的表现。如果需要进行数据操作、清理、转换和分析,Pandas通常是一
- Python码上行动系列丛书(由北京大学出版社出版)
hacker707
pythonchatgpt
前言Python码上行动系列丛书火热来袭三册在手,Python全掌握!无论是初学者还是进阶玩家,我们都有你想要的!让ChatGPT带你轻松入门Python编程,享受编程带来的乐趣!Excel与Python的完美结合!让你在数据处理与分析方面更胜一筹!真正的零基础入门!无需任何编程经验,轻松上手Python编程!✨Python码上行动系列丛书:码上行动:用ChatGPT学会Python编程当当购买链
- ASM系列四 利用Method 组件动态注入方法逻辑
lijingyao8206
字节码技术jvmAOP动态代理ASM
这篇继续结合例子来深入了解下Method组件动态变更方法字节码的实现。通过前面一篇,知道ClassVisitor 的visitMethod()方法可以返回一个MethodVisitor的实例。那么我们也基本可以知道,同ClassVisitor改变类成员一样,MethodVIsistor如果需要改变方法成员,注入逻辑,也可以
- java编程思想 --内部类
百合不是茶
java内部类匿名内部类
内部类;了解外部类 并能与之通信 内部类写出来的代码更加整洁与优雅
1,内部类的创建 内部类是创建在类中的
package com.wj.InsideClass;
/*
* 内部类的创建
*/
public class CreateInsideClass {
public CreateInsideClass(
- web.xml报错
crabdave
web.xml
web.xml报错
The content of element type "web-app" must match "(icon?,display-
name?,description?,distributable?,context-param*,filter*,filter-mapping*,listener*,servlet*,s
- 泛型类的自定义
麦田的设计者
javaandroid泛型
为什么要定义泛型类,当类中要操作的引用数据类型不确定的时候。
采用泛型类,完成扩展。
例如有一个学生类
Student{
Student(){
System.out.println("I'm a student.....");
}
}
有一个老师类
- CSS清除浮动的4中方法
IT独行者
JavaScriptUIcss
清除浮动这个问题,做前端的应该再熟悉不过了,咱是个新人,所以还是记个笔记,做个积累,努力学习向大神靠近。CSS清除浮动的方法网上一搜,大概有N多种,用过几种,说下个人感受。
1、结尾处加空div标签 clear:both 1 2 3 4
.div
1
{
background
:
#000080
;
border
:
1px
s
- Cygwin使用windows的jdk 配置方法
_wy_
jdkwindowscygwin
1.[vim /etc/profile]
JAVA_HOME="/cgydrive/d/Java/jdk1.6.0_43" (windows下jdk路径为D:\Java\jdk1.6.0_43)
PATH="$JAVA_HOME/bin:${PATH}"
CLAS
- linux下安装maven
无量
mavenlinux安装
Linux下安装maven(转) 1.首先到Maven官网
下载安装文件,目前最新版本为3.0.3,下载文件为
apache-maven-3.0.3-bin.tar.gz,下载可以使用wget命令;
2.进入下载文件夹,找到下载的文件,运行如下命令解压
tar -xvf apache-maven-2.2.1-bin.tar.gz
解压后的文件夹
- tomcat的https 配置,syslog-ng配置
aichenglong
tomcathttp跳转到httpssyslong-ng配置syslog配置
1) tomcat配置https,以及http自动跳转到https的配置
1)TOMCAT_HOME目录下生成密钥(keytool是jdk中的命令)
keytool -genkey -alias tomcat -keyalg RSA -keypass changeit -storepass changeit
- 关于领号活动总结
alafqq
活动
关于某彩票活动的总结
具体需求,每个用户进活动页面,领取一个号码,1000中的一个;
活动要求
1,随机性,一定要有随机性;
2,最少中奖概率,如果注数为3200注,则最多中4注
3,效率问题,(不能每个人来都产生一个随机数,这样效率不高);
4,支持断电(仍然从下一个开始),重启服务;(存数据库有点大材小用,因此不能存放在数据库)
解决方案
1,事先产生随机数1000个,并打
- java数据结构 冒泡排序的遍历与排序
百合不是茶
java
java的冒泡排序是一种简单的排序规则
冒泡排序的原理:
比较两个相邻的数,首先将最大的排在第一个,第二次比较第二个 ,此后一样;
针对所有的元素重复以上的步骤,除了最后一个
例题;将int array[]
- JS检查输入框输入的是否是数字的一种校验方法
bijian1013
js
如下是JS检查输入框输入的是否是数字的一种校验方法:
<form method=post target="_blank">
数字:<input type="text" name=num onkeypress="checkNum(this.form)"><br>
</form>
- Test注解的两个属性:expected和timeout
bijian1013
javaJUnitexpectedtimeout
JUnit4:Test文档中的解释:
The Test annotation supports two optional parameters.
The first, expected, declares that a test method should throw an exception.
If it doesn't throw an exception or if it
- [Gson二]继承关系的POJO的反序列化
bit1129
POJO
父类
package inheritance.test2;
import java.util.Map;
public class Model {
private String field1;
private String field2;
private Map<String, String> infoMap
- 【Spark八十四】Spark零碎知识点记录
bit1129
spark
1. ShuffleMapTask的shuffle数据在什么地方记录到MapOutputTracker中的
ShuffleMapTask的runTask方法负责写数据到shuffle map文件中。当任务执行完成成功,DAGScheduler会收到通知,在DAGScheduler的handleTaskCompletion方法中完成记录到MapOutputTracker中
- WAS各种脚本作用大全
ronin47
WAS 脚本
http://www.ibm.com/developerworks/cn/websphere/library/samples/SampleScripts.html
无意中,在WAS官网上发现的各种脚本作用,感觉很有作用,先与各位分享一下
获取下载
这些示例 jacl 和 Jython 脚本可用于在 WebSphere Application Server 的不同版本中自
- java-12.求 1+2+3+..n不能使用乘除法、 for 、 while 、 if 、 else 、 switch 、 case 等关键字以及条件判断语句
bylijinnan
switch
借鉴网上的思路,用java实现:
public class NoIfWhile {
/**
* @param args
*
* find x=1+2+3+....n
*/
public static void main(String[] args) {
int n=10;
int re=find(n);
System.o
- Netty源码学习-ObjectEncoder和ObjectDecoder
bylijinnan
javanetty
Netty中传递对象的思路很直观:
Netty中数据的传递是基于ChannelBuffer(也就是byte[]);
那把对象序列化为字节流,就可以在Netty中传递对象了
相应的从ChannelBuffer恢复对象,就是反序列化的过程
Netty已经封装好ObjectEncoder和ObjectDecoder
先看ObjectEncoder
ObjectEncoder是往外发送
- spring 定时任务中cronExpression表达式含义
chicony
cronExpression
一个cron表达式有6个必选的元素和一个可选的元素,各个元素之间是以空格分隔的,从左至右,这些元素的含义如下表所示:
代表含义 是否必须 允许的取值范围 &nb
- Nutz配置Jndi
ctrain
JNDI
1、使用JNDI获取指定资源:
var ioc = {
dao : {
type :"org.nutz.dao.impl.NutDao",
args : [ {jndi :"jdbc/dataSource"} ]
}
}
以上方法,仅需要在容器中配置好数据源,注入到NutDao即可.
- 解决 /bin/sh^M: bad interpreter: No such file or directory
daizj
shell
在Linux中执行.sh脚本,异常/bin/sh^M: bad interpreter: No such file or directory。
分析:这是不同系统编码格式引起的:在windows系统中编辑的.sh文件可能有不可见字符,所以在Linux系统下执行会报以上异常信息。
解决:
1)在windows下转换:
利用一些编辑器如UltraEdit或EditPlus等工具
- [转]for 循环为何可恨?
dcj3sjt126com
程序员读书
Java的闭包(Closure)特征最近成为了一个热门话题。 一些精英正在起草一份议案,要在Java将来的版本中加入闭包特征。 然而,提议中的闭包语法以及语言上的这种扩充受到了众多Java程序员的猛烈抨击。
不久前,出版过数十本编程书籍的大作家Elliotte Rusty Harold发表了对Java中闭包的价值的质疑。 尤其是他问道“for 循环为何可恨?”[http://ju
- Android实用小技巧
dcj3sjt126com
android
1、去掉所有Activity界面的标题栏
修改AndroidManifest.xml 在application 标签中添加android:theme="@android:style/Theme.NoTitleBar"
2、去掉所有Activity界面的TitleBar 和StatusBar
修改AndroidManifes
- Oracle 复习笔记之序列
eksliang
Oracle 序列sequenceOracle sequence
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2098859
1.序列的作用
序列是用于生成唯一、连续序号的对象
一般用序列来充当数据库表的主键值
2.创建序列语法如下:
create sequence s_emp
start with 1 --开始值
increment by 1 --増长值
maxval
- 有“品”的程序员
gongmeitao
工作
完美程序员的10种品质
完美程序员的每种品质都有一个范围,这个范围取决于具体的问题和背景。没有能解决所有问题的
完美程序员(至少在我们这个星球上),并且对于特定问题,完美程序员应该具有以下品质:
1. 才智非凡- 能够理解问题、能够用清晰可读的代码翻译并表达想法、善于分析并且逻辑思维能力强
(范围:用简单方式解决复杂问题)
- 使用KeleyiSQLHelper类进行分页查询
hvt
sql.netC#asp.nethovertree
本文适用于sql server单主键表或者视图进行分页查询,支持多字段排序。KeleyiSQLHelper类的最新代码请到http://hovertree.codeplex.com/SourceControl/latest下载整个解决方案源代码查看。或者直接在线查看类的代码:http://hovertree.codeplex.com/SourceControl/latest#HoverTree.D
- SVG 教程 (三)圆形,椭圆,直线
天梯梦
svg
SVG <circle> SVG 圆形 - <circle>
<circle> 标签可用来创建一个圆:
下面是SVG代码:
<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" version="1.1">
<circle cx="100" c
- 链表栈
luyulong
java数据结构
public class Node {
private Object object;
private Node next;
public Node() {
this.next = null;
this.object = null;
}
public Object getObject() {
return object;
}
public
- 基础数据结构和算法十:2-3 search tree
sunwinner
Algorithm2-3 search tree
Binary search tree works well for a wide variety of applications, but they have poor worst-case performance. Now we introduce a type of binary search tree where costs are guaranteed to be loga
- spring配置定时任务
stunizhengjia
springtimer
最近因工作的需要,用到了spring的定时任务的功能,觉得spring还是很智能化的,只需要配置一下配置文件就可以了,在此记录一下,以便以后用到:
//------------------------定时任务调用的方法------------------------------
/**
* 存储过程定时器
*/
publi
- ITeye 8月技术图书有奖试读获奖名单公布
ITeye管理员
活动
ITeye携手博文视点举办的8月技术图书有奖试读活动已圆满结束,非常感谢广大用户对本次活动的关注与参与。
8月试读活动回顾:
http://webmaster.iteye.com/blog/2102830
本次技术图书试读活动的优秀奖获奖名单及相应作品如下(优秀文章有很多,但名额有限,没获奖并不代表不优秀):
《跨终端Web》
gleams:http