基因检测:DNA甲基化标志物预测胃癌

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美国胃肠病学院提交的一项研究新研究表明,在美国和韩国的队列中,基因检测多个甲基化DNA标志物可以准确地预测胃癌。

  “在这项研究中,我们通过基因检测鉴定了新的甲基化DNA标志物,随后在美国和南韩的患者队列中确认了最佳候选,”Bradley W.Anderson博士(梅奥诊所)在演讲中提到。

  来自美国35名患者和韩国50名患者的17份甲基化DNA标志物候选具有完整的腺癌,Anderson和同事们对其进行了评估,并与对照组进行比较。

美国组是与65名健康患者的正常胃黏膜上皮细胞对比;

50名韩国患者在首尔大学医院接受治疗,作为自身对照组。

  据Anderson所说,在基线时取邻近的正常粘膜做样本。

  对每一个标记物,应用逻辑回归分析计算曲线下面积(AUC)。来自显微组织的基因检测DNA是通过甲基化特异性聚合酶链式反应进行分析,通过β肌动蛋白对标志物水平标准化。

  研究人员发现,前10位的DNA标记包括ARHGEF4,ELMO1,ABCB1,CLEC11A,ST8SIA1,SFMBT2,CD1D,CYP26C1,ZNF569和C13ORF18。

  这10个标志物基因检测出美国组胃癌率为100%,南韩检测率为94%,其特异性为95%。

美国队列各标志物的AUCs分别为:

南韩队列各标记的AUCs分别为:

  “这些标志物准确性高,而且一些标记在两组的判别中相似,”Anderson说。

  特殊标志物,比如ELMO1在两个患者组都表现出高识别率。然而,其它标记,包括ARHGEF4,由于横跨正常组和患者组的背景,识别率更具多样。

  “在美国组和南韩组中,研究人员鉴定出对胃癌具有高敏感性和特异性的有益甲基化DNA标志物,Anderson总结说。“将这些候选甲基化DNA标志物批准用于早期胃癌,还需要进一步研究。”

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