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daisy境界的彼方
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- seurat提取表达矩阵_10X scRNA免疫治疗学习笔记-3-走Seurat标准流程
幸福的小酒瓶
seurat提取表达矩阵
刘小泽写于19.10.15笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索10XGenomics技术相关的分析课程链接在:http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=55第二单元第7讲:走Seurat标准流程【文章结构总-分-总,结尾有完整的代码,熟悉者前面可以跳过,去看后面8min完成的代码】前言前面介绍了自己利用cellrangerc
- HannahLin的ScalersTalk第四轮新概念朗读持续力训练Day 143 20190227
HannahLin
Lesson24-1AskeletoninthecupboardWeoftenreadinnovelshowaseeminglyrespectablepersonorfamilyhassometerriblesecretwhichhasbeenconcealedfromstrangersforyears.TheEnglishlanguagepossessesavividsayingtodescri
- 【Bigtop】Ambari2.8.0编译及安装
Meepoljd
大数据运维开发大数据hadoopambari
Ambari2.8.0编译及安装Ambari2.8.0编译及安装编译Ambari编译Ambari-metrics搭建Ambari镜像准备Ambari2.8.0编译及安装编译Ambari安装必要工具:yum-yinstallgcc-c++gitpsutilspython-develrpm-build克隆仓库并切换到2.8.0-rc1分支gitcheckoutrelease-2.8.0-rc1必须安装
- 依据 坐标(经度-longitude、纬度-latitude)和范围(rangeRadius) 获取 符合条件的 坐标
叁金Coder
技术研讨工具类问题解决javamysql经纬度检索
使用Java+MySQL实现依据坐标(经度-longitude、纬度-latitude)和范围(rangeRadius)获取符合条件的坐标。1、纯MySQL实现(存在效率瓶颈)SELECT*FROM'location'WHERE(ACOS(SIN((23.146436*3.1415)/180)*SIN((latitude*3.1415)/180)--纬度字段+COS((23.146436*3.14
- Ambari安装部署教程
Aries_Chen_CSDN
大数据hadoopambari
前言之前尝试过使用Ambri安装HDFS集群,整个搭建的流程应该是记录的比较详细的,重新把资料整理了一下发布到博客,希望可以帮到有需要的人吧。环境准备以下操作使用root用户执行:1.关闭防火墙chkconfigiptablesoffserviceiptablesstopchkconfig--listiptables2.关闭SElinuxvi/etc/sysconfig/selinux将SELIN
- cellranger count使用
谢京合
1、如果你是直接拿到的R1/R2的fastq文件,那么就直接上cellrangercount。氮素,如果你是I1/R1/R2的数据,那就麻烦还要跑个cellrangermkfastq。因为我自己拿到的是R1/R2的fastq文件(如图),所以抱歉啦就直接从cellrangercount开始讲起啦。嘻嘻嘻~~~image.png这里有个问题(划重点):图中所示,我的名字是CC5-1_S1XXXX。但
- 玩转Ambari之二----基于ubuntu的源码编译和安装
Heavbird
大数据HadoopAmbari
网上关于ambari安装的有很多,有直接从现成的源直接下载安装的,也有自己构建本地源安装的,还有不少自己从apache网站下载源码编译安装的。前两者相对简单,依赖小,期间遇到问题也少,顺利的话,可能什么问题都碰不到就完成了。后者会遇到各种不同的问题。apache网上公布的最新版本是2.5.2,鉴于网上能搜到的基于源码安装帖子的版本都较老,并且很多都是基于centos的,基于Ubuntu的很少。我们
- ubuntu16.04安装 ambari 2.7.3的环境准备工作
lbl251
0、登录官网先看下资料https://docs.cloudera.com/HDPDocuments/Ambari-2.7.3.0/bk_ambari-installation/content/setup_options.html1、准备好安装包(ambari安装包)(要用root用户最好)https://docs.hortonworks.com/HDPDocuments/Ambari-2.7.3.
- 一款人性化的终端用户界面工具
stubborn vegeta
开原大镖客shelluiterminallinuxshell
Acollectionofhumanfriendlyterminaluserinterface.截图历史文件预览注意:findfile依赖fzf.filebrowser依赖ranger/lf/…安装gitclonehttps://github.com/StubbornVegeta/StartUp~/.config/cd~/.config/StartUp./install.sh用法.$HOME/.c
- Ambari——编译——解决解决windows和linux下phantomjs链接超时问题
空了虾摸索
Ambariambari-排错ambariwindowslinux
您的支持是我继续创作与分享的动力源泉!!!您的支持是我继续创作与分享的动力源泉!!!您的支持是我继续创作与分享的动力源泉!!!错误日志:[INFO]CopyingextractedfolderC:\Users\LENOVO\AppData\Local\Temp\phantomjs\phantomjs-2.1.1-windows.zip-extract-1786692611821\phantomjs
- The heart doesn't move, and it doesn't hurt.心不动,则不痛
三品姐姐
叁品姐姐每天分享一段爱情感悟,幸福可以很简单,点击右上角关注哦。孤独是一场无人送药的重感冒Lonelinessisaheavycoldwithnomedicine.回得了的地方,回不了的时光WhereIcangetback,Ican'tgetbacktothepast.你是我等不到的路人YouareastrangerIcan'twaitfor.期待,是所有心痛的根源。心不动,则不痛Expectat
- 大数据开源框架技术汇总
浪尖聊大数据-浪尖
数据仓库hiveflume分布式scipymakefilecrmlighttpd
主要基于对现阶段一些常用的大数据开源框架技术的整理,只是一些简单的介绍,并不是详细技术梳理。可能会有疏漏,发现再整理。参考的太多,就不一一列出来了。这只是作为一个梳理,对以后选型或者扩展的做个参考。目录系统平台(Hadoop、CDH、HDP)监控管理(CM、Hue、Ambari、Dr.Elephant、Ganglia、Zabbix、Eagle)文件系统(HDFS、GPFS、Ceph、Gluster
- 【日更挑战】2022-05-27比赛日NOTES(季后赛)
扁圆柱体
日更挑战当前排名:第415天,第987名,排名较昨日前进1名。比赛日,官网给出每场比赛的Notes(极个别场次没有),翻译如下Rangers(1)vs.Hurricanes(3)Zibanejad连续4场得分(3球,1助攻),连续3场进球。他的6个季后赛进球中有3个都是强打进球;Fox成为自2014年RyanMcDonagh(13次)以来,第一位单次季后赛得到10个助攻的游骑兵后卫;Panarin
- 多可怕的恐怖片我都看过,这么甜的第一次见
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这个夏天,什么和暑假最配?当然是西瓜,空调和《怪奇物语》。2016年暑假,网飞推出了这部带有恐怖元素的奇幻剧集,讲了几个小屁孩一路升级打怪,收获亲情、友情和爱情的故事。时隔一年多,万众期待的它终于在今年暑假档回归了!豪爽的网飞一次性放出8集,从第一季就开始追的肉叔自然不会错过,周末在家啃着瓜一口气看完全集。按捺不住激动的心情,今天就来跟大家唠唠它——怪奇物语第三季StrangerThingsSea
- 开源大数据集群部署(十)Ranger usersync部署
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- 【IOS】Type ‘ChartDataSet‘ does not conform to protocol ‘RangeReplaceableCollection‘
Easonhe
IOSios
问题IOS开发Charts集成时编译报错解决方法在ChartDataSet的中增加replaceSubrange的实现publicfuncreplaceSubrange(_subrange:Swift.Range,withnewElements:C)whereC:Collection,ChartDataEntry==C.Element{}解决!
- 大数据分析学习第十五课 自建云服务器集群离线安装Ambari2.7.5和HDP3.1.5(一)
猫头鹰数据分析
大数据JavaHivehadoopambari大数据centoshdfs
之前了解了很多关于大数据平台一站式部署管理的工具,比如ApacheAmbari和CDH,目前最新的CDH已经没有了社区版,也就是说以后使用新版本的ClouderaManager和CDH都是要收费的,这对于很多小公司来说,可能无法承受。转向Ambari是他们的一个可选项。Ambari是Apache的一个顶级开源项目,开源是其最大的优势,开源也意味着Ambari可以灵活地进行扩展,集成更多的数据组件,
- kerberos 生成新用户和 keytab 文件
骑着蜗牛向前跑
大数据kerberos新用户keytab文件添加
操作很简单登录认证中心kadmin.local增加用户kadmin.local:addprinc-pw******test1生成keytab文件kadmin.local:ktadd-k/root/test1.keytab-norandkeytest1退出认证中心上下文。测试kinit-kt/root/test1.keytabtest1如果想让Ranger捕获到test1用户,需要将该用户添加到li
- MySQL 时间类型 DATE、DATETIME和TIMESTAMP
wyn_做自己
今日份鸡汤:发生了,接受。接下来,面对。勇敢面对也是成长~1、DATE、DATETIME和TIMESTAMP表达的时间范围TypeRangeRemarkDATE'1000-01-01'to'9999-12-31'只有日期部分,没有时间部分DATETIME'1000-01-0100:00:00'to'9999-12-3123:59:59'时间格式为YYYY-MM-DDhh:mm:ss,默认精确到秒T
- iOS tableviewcell 上UItextfield 设置输入长度和最大值
New_卡迪熊
最近有做到一个功能,在UItextfield设置输入长度和最大值。先添加UItextfield代理,再添加代理方法如下:-(BOOL)textField:(UITextField*)textFieldshouldChangeCharactersInRange:(NSRange)rangereplacementString:(NSString*)string{NSString*newString=[
- Ambari注册节点时报错:EOF occurred in violation of protocol (_ssl.c:579)
kongxx
问题原因Ambari在注册节点的时候,ambari-agent报错EOFoccurredinviolationofprotocol(_ssl.c:579)解决办法修改/etc/ambari-agent/conf/ambari-agent.ini文件,在[security]配置部分添加[security]...force_https_protocol=PROTOCOL_TLSv1_2
- R、python读取空间转录组的8种方式
生信小博士
python服务器linux
“空间转录组测序主要包括5个步骤,我们着重下游分析部分:空转数据分析和可视化。本篇主分享如何使用python和R读取空转数据,主要使用scanpystlearnseurat包”引言在正式开始之前,我们先看看cellranger流程跑完之后,空间转录组结果的数据组成,主要是两部分:1.表达矩阵文件夹2.空转图片文件夹1.表达矩阵文件夹2.表达矩阵文件夹另外:如果你对单细胞数据读取比较感兴趣,可以看我
- CSS基础---新手入门级详解
(((φ(◎ロ◎;)φ)))牵丝戏安
css前端
CSS:层叠样式表CSS(CascadingStyleSheets,层叠样式表),是一种用来为结构化文档添加样式(字体、间距和颜色)的计算机语言,css扩展名为.css。实例:CSS实例body{background-color:aquamarine;}h1{color:orangered;text-align:center;}p{font-family:"TimesNewRoman";font-
- 开源大数据集群部署(九)Ranger审计日志集成(solr)
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作者:櫰木1、下载solr安装包并解压包tar-xzvfsolr-8.11.2.gzcdsolr-8.11.2执行安装脚本./bin/install_solr_service.sh/opt/solr-8.11.2.tgz安装后,会在/etc/default/下生成solr.in.sh文件。2、在rangeradmin下生成solr相关配置cd/opt/ranger-2.3.0-admin/cont
- 从10X单细胞bam文件中提取某一个细胞类型的bam
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我们之前简单做了一下cellranger的上游分析单细胞上游软件cellranger从头说,得到的结果文件如下:如果我们要做下游分析,那么三个文件matrix.mtx,barcodes.tsv和genes.tsv存在于out/filtered_feature_bc_matrix文件夹下我们之前也简单介绍了一下这三个文件的构造单细胞表达矩阵文件转换,那么我们在下游分析中,细胞分群以后,我们会得到一些
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大家好!近期疫情又紧张了,愿我们每个人都保护好自己,也是在为祖国做贡献。让我们放好心态,快乐生活在每个当下。开心过好每一天!感恩遇见!❤️❤️❤️36、Povertyisstrangertoindustry.勤劳之人不受穷。poverty英[ˈpɒvəti]这里元音字母‘o’发短元音[ɒ],读音类似于语文的‘āo熬’;字母组合‘er’发短元音[ə],读音类似于语文的‘ē婀’;末尾的‘y’发短元音[
- 今年第一篇CSDN
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一.前言无需多言,今年第一篇教大家点实用的二.利用Python制作对联importturtle#定义画春联及背景的方法defdrawChunLianBg(startX=0,startY=0,lenX=100,lenY=100):#设置边框色和背景填充色turtle.color('Yellow','OrangeRed')#抬笔,定位起点turtle.pu()turtle.goto(startX,st
- Hello World
涵小涵在温村
Thisisamakeupdiaryforyesterday.WenttowhiterockandIonabeachparkwithRevisha.AndthenhadagatheringthingwithXuesong,Yaqian,Chenxi,andJason.Itiskindaweirdthatonestrangerwemetatthepartyjustjumpedintoourgroup
- [黑洞与暗粒子]没有光的世界
comsci
无论是相对论还是其它现代物理学,都显然有个缺陷,那就是必须有光才能够计算
但是,我相信,在我们的世界和宇宙平面中,肯定存在没有光的世界....
那么,在没有光的世界,光子和其它粒子的规律无法被应用和考察,那么以光速为核心的
&nbs
- jQuery Lazy Load 图片延迟加载
aijuans
jquery
基于 jQuery 的图片延迟加载插件,在用户滚动页面到图片之后才进行加载。
对于有较多的图片的网页,使用图片延迟加载,能有效的提高页面加载速度。
版本:
jQuery v1.4.4+
jQuery Lazy Load v1.7.2
注意事项:
需要真正实现图片延迟加载,必须将真实图片地址写在 data-original 属性中。若 src
- 使用Jodd的优点
Kai_Ge
jodd
1. 简化和统一 controller ,抛弃 extends SimpleFormController ,统一使用 implements Controller 的方式。
2. 简化 JSP 页面的 bind, 不需要一个字段一个字段的绑定。
3. 对 bean 没有任何要求,可以使用任意的 bean 做为 formBean。
使用方法简介
- jpa Query转hibernate Query
120153216
Hibernate
public List<Map> getMapList(String hql,
Map map) {
org.hibernate.Query jpaQuery = entityManager.createQuery(hql);
if (null != map) {
for (String parameter : map.keySet()) {
jp
- Django_Python3添加MySQL/MariaDB支持
2002wmj
mariaDB
现状
首先,
[email protected] 中默认的引擎为 django.db.backends.mysql 。但是在Python3中如果这样写的话,会发现 django.db.backends.mysql 依赖 MySQLdb[5] ,而 MySQLdb 又不兼容 Python3 于是要找一种新的方式来继续使用MySQL。 MySQL官方的方案
首先据MySQL文档[3]说,自从MySQL
- 在SQLSERVER中查找消耗IO最多的SQL
357029540
SQL Server
返回做IO数目最多的50条语句以及它们的执行计划。
select top 50
(total_logical_reads/execution_count) as avg_logical_reads,
(total_logical_writes/execution_count) as avg_logical_writes,
(tot
- spring UnChecked 异常 官方定义!
7454103
spring
如果你接触过spring的 事物管理!那么你必须明白 spring的 非捕获异常! 即 unchecked 异常! 因为 spring 默认这类异常事物自动回滚!!
public static boolean isCheckedException(Throwable ex)
{
return !(ex instanceof RuntimeExcep
- mongoDB 入门指南、示例
adminjun
javamongodb操作
一、准备工作
1、 下载mongoDB
下载地址:http://www.mongodb.org/downloads
选择合适你的版本
相关文档:http://www.mongodb.org/display/DOCS/Tutorial
2、 安装mongoDB
A、 不解压模式:
将下载下来的mongoDB-xxx.zip打开,找到bin目录,运行mongod.exe就可以启动服务,默
- CUDA 5 Release Candidate Now Available
aijuans
CUDA
The CUDA 5 Release Candidate is now available at http://developer.nvidia.com/<wbr></wbr>cuda/cuda-pre-production. Now applicable to a broader set of algorithms, CUDA 5 has advanced fe
- Essential Studio for WinRT网格控件测评
Axiba
JavaScripthtml5
Essential Studio for WinRT界面控件包含了商业平板应用程序开发中所需的所有控件,如市场上运行速度最快的grid 和chart、地图、RDL报表查看器、丰富的文本查看器及图表等等。同时,该控件还包含了一组独特的库,用于从WinRT应用程序中生成Excel、Word以及PDF格式的文件。此文将对其另外一个强大的控件——网格控件进行专门的测评详述。
网格控件功能
1、
- java 获取windows系统安装的证书或证书链
bewithme
windows
有时需要获取windows系统安装的证书或证书链,比如说你要通过证书来创建java的密钥库 。
有关证书链的解释可以查看此处 。
public static void main(String[] args) {
SunMSCAPI providerMSCAPI = new SunMSCAPI();
S
- NoSQL数据库之Redis数据库管理(set类型和zset类型)
bijian1013
redis数据库NoSQL
4.sets类型
Set是集合,它是string类型的无序集合。set是通过hash table实现的,添加、删除和查找的复杂度都是O(1)。对集合我们可以取并集、交集、差集。通过这些操作我们可以实现sns中的好友推荐和blog的tag功能。
sadd:向名称为key的set中添加元
- 异常捕获何时用Exception,何时用Throwable
bingyingao
用Exception的情况
try {
//可能发生空指针、数组溢出等异常
} catch (Exception e) {
 
- 【Kafka四】Kakfa伪分布式安装
bit1129
kafka
在http://bit1129.iteye.com/blog/2174791一文中,实现了单Kafka服务器的安装,在Kafka中,每个Kafka服务器称为一个broker。本文简单介绍下,在单机环境下Kafka的伪分布式安装和测试验证 1. 安装步骤
Kafka伪分布式安装的思路跟Zookeeper的伪分布式安装思路完全一样,不过比Zookeeper稍微简单些(不
- Project Euler
bookjovi
haskell
Project Euler是个数学问题求解网站,网站设计的很有意思,有很多problem,在未提交正确答案前不能查看problem的overview,也不能查看关于problem的discussion thread,只能看到现在problem已经被多少人解决了,人数越多往往代表问题越容易。
看看problem 1吧:
Add all the natural num
- Java-Collections Framework学习与总结-ArrayDeque
BrokenDreams
Collections
表、栈和队列是三种基本的数据结构,前面总结的ArrayList和LinkedList可以作为任意一种数据结构来使用,当然由于实现方式的不同,操作的效率也会不同。
这篇要看一下java.util.ArrayDeque。从命名上看
- 读《研磨设计模式》-代码笔记-装饰模式-Decorator
bylijinnan
java设计模式
声明: 本文只为方便我个人查阅和理解,详细的分析以及源代码请移步 原作者的博客http://chjavach.iteye.com/
import java.io.BufferedOutputStream;
import java.io.DataOutputStream;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.Fi
- Maven学习(一)
chenyu19891124
Maven私服
学习一门技术和工具总得花费一段时间,5月底6月初自己学习了一些工具,maven+Hudson+nexus的搭建,对于maven以前只是听说,顺便再自己的电脑上搭建了一个maven环境,但是完全不了解maven这一强大的构建工具,还有ant也是一个构建工具,但ant就没有maven那么的简单方便,其实简单点说maven是一个运用命令行就能完成构建,测试,打包,发布一系列功
- [原创]JWFD工作流引擎设计----节点匹配搜索算法(用于初步解决条件异步汇聚问题) 补充
comsci
算法工作PHP搜索引擎嵌入式
本文主要介绍在JWFD工作流引擎设计中遇到的一个实际问题的解决方案,请参考我的博文"带条件选择的并行汇聚路由问题"中图例A2描述的情况(http://comsci.iteye.com/blog/339756),我现在把我对图例A2的一个解决方案公布出来,请大家多指点
节点匹配搜索算法(用于解决标准对称流程图条件汇聚点运行控制参数的算法)
需要解决的问题:已知分支
- Linux中用shell获取昨天、明天或多天前的日期
daizj
linuxshell上几年昨天获取上几个月
在Linux中可以通过date命令获取昨天、明天、上个月、下个月、上一年和下一年
# 获取昨天
date -d 'yesterday' # 或 date -d 'last day'
# 获取明天
date -d 'tomorrow' # 或 date -d 'next day'
# 获取上个月
date -d 'last month'
#
- 我所理解的云计算
dongwei_6688
云计算
在刚开始接触到一个概念时,人们往往都会去探寻这个概念的含义,以达到对其有一个感性的认知,在Wikipedia上关于“云计算”是这么定义的,它说:
Cloud computing is a phrase used to describe a variety of computing co
- YII CMenu配置
dcj3sjt126com
yii
Adding id and class names to CMenu
We use the id and htmlOptions to accomplish this. Watch.
//in your view
$this->widget('zii.widgets.CMenu', array(
'id'=>'myMenu',
'items'=>$this-&g
- 设计模式之静态代理与动态代理
come_for_dream
设计模式
静态代理与动态代理
代理模式是java开发中用到的相对比较多的设计模式,其中的思想就是主业务和相关业务分离。所谓的代理设计就是指由一个代理主题来操作真实主题,真实主题执行具体的业务操作,而代理主题负责其他相关业务的处理。比如我们在进行删除操作的时候需要检验一下用户是否登陆,我们可以删除看成主业务,而把检验用户是否登陆看成其相关业务
- 【转】理解Javascript 系列
gcc2ge
JavaScript
理解Javascript_13_执行模型详解
摘要: 在《理解Javascript_12_执行模型浅析》一文中,我们初步的了解了执行上下文与作用域的概念,那么这一篇将深入分析执行上下文的构建过程,了解执行上下文、函数对象、作用域三者之间的关系。函数执行环境简单的代码:当调用say方法时,第一步是创建其执行环境,在创建执行环境的过程中,会按照定义的先后顺序完成一系列操作:1.首先会创建一个
- Subsets II
hcx2013
set
Given a collection of integers that might contain duplicates, nums, return all possible subsets.
Note:
Elements in a subset must be in non-descending order.
The solution set must not conta
- Spring4.1新特性——Spring缓存框架增强
jinnianshilongnian
spring4
目录
Spring4.1新特性——综述
Spring4.1新特性——Spring核心部分及其他
Spring4.1新特性——Spring缓存框架增强
Spring4.1新特性——异步调用和事件机制的异常处理
Spring4.1新特性——数据库集成测试脚本初始化
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Spring4.1新特性——页面自动化测试框架Spring MVC T
- shell嵌套expect执行命令
liyonghui160com
一直都想把expect的操作写到bash脚本里,这样就不用我再写两个脚本来执行了,搞了一下午终于有点小成就,给大家看看吧.
系统:centos 5.x
1.先安装expect
yum -y install expect
2.脚本内容:
cat auto_svn.sh
#!/bin/bash
- Linux实用命令整理
pda158
linux
0. 基本命令 linux 基本命令整理
1. 压缩 解压 tar -zcvf a.tar.gz a #把a压缩成a.tar.gz tar -zxvf a.tar.gz #把a.tar.gz解压成a
2. vim小结 2.1 vim替换 :m,ns/word_1/word_2/gc  
- 独立开发人员通向成功的29个小贴士
shoothao
独立开发
概述:本文收集了关于独立开发人员通向成功需要注意的一些东西,对于具体的每个贴士的注解有兴趣的朋友可以查看下面标注的原文地址。
明白你从事独立开发的原因和目的。
保持坚持制定计划的好习惯。
万事开头难,第一份订单是关键。
培养多元化业务技能。
提供卓越的服务和品质。
谨小慎微。
营销是必备技能。
学会组织,有条理的工作才是最有效率的。
“独立
- JAVA中堆栈和内存分配原理
uule
java
1、栈、堆
1.寄存器:最快的存储区, 由编译器根据需求进行分配,我们在程序中无法控制.2. 栈:存放基本类型的变量数据和对象的引用,但对象本身不存放在栈中,而是存放在堆(new 出来的对象)或者常量池中(字符串常量对象存放在常量池中。)3. 堆:存放所有new出来的对象。4. 静态域:存放静态成员(static定义的)5. 常量池:存放字符串常量和基本类型常量(public static f