hadoop本地库与系统版本不一致

hadoop本地库与系统版本不一致引起的错误解决方法


(suse11上部署hadoop2.6遇到的问题,网上搜的资料,待验证)


集群中设置支持gzip lzo压缩后,在对压缩文件进行读取或者对输入文件压缩的时候要使用到hadoop的本地库,本地库的默认位置在


$HADOOP_HOME/lib/native/Linux-amd64-64   (64位操作系统)


$HADOOP_HOME/lib/native/Linux-i386-32   (32位操作系统)




文件夹中的libhadoop.so文件,就是hadoop的本地库。


如果本地库不存在,或者本地库与当前操作系统的版本不一致的时候,会报下面的错误:


WARN util.NativeCodeLoader: Unable to load native-hadoop library for your platform… using builtin-java classes where applicable


增加调试信息设置


$ export HADOOP_ROOT_LOGGER=DEBUG,console
$ hadoop fs -text /test/data/origz/access.log.gz


 org.apache.hadoop.util.NativeCodeLoader: Unable to load native-hadoop library for your platform... using builtin-java classes where applicable


error libhadoop.so  /lib64/libc.so.6 required (libc 2.6)    /usr/local/hadoop/lib/native/Linux-amd64-64  


说明系统中的glibc的版本和libhadoop.so需要的版本不一致导致


查看系统的libc版本  


# ll /lib64/libc.so.6


lrwxrwxrwx 1 root root 11 Apr 24 16:49 /lib64/libc.so.6 -> libc-2.5.so


系统中的版本为2.5


将系统中的glibc升级为2.9


下载glibc
wget  http://ftp.gnu.org/gnu/glibc/glibc-2.9.tar.bz2


下载glibc-linuxthreads
wget http://ftp.gnu.org/gnu/glibc/glibc-linuxthreads-2.5.tar.bz2


解压
$tar -jxvf glibc-2.9.tar.bz2
$cd glibc-2.9
$tar -jxvf ../glibc-linuxthreads-2.5.tar.bz2
$cd ..
$export CFLAGS="-g -O2"
$./glibc-2.9/configure --prefix=/usr --disable-profile --enable-add-ons --with-headers=/usr/include --with-binutils=/usr/bin
$make
#make install


安装编译过程中需要注意三点:
1、要将glibc-linuxthreads解压到glibc目录下。
2、不能在glibc当前目录下运行configure。
3、加上优化开关,export CFLAGS="-g -O2",否则会出现错误




安装完后,可以查看ls -l /lib/libc.so.6已升级


lrwxrwxrwx 1 root root 11 Apr 24 16:49 /lib64/libc.so.6 -> libc-2.9.so


测试本地库是否升级




$ export HADOOP_ROOT_LOGGER=DEBUG,console
$ hadoop fs -text /test/data/origz/access.log.gz


12/04/25 08:54:47 INFO lzo.LzoCodec: Successfully loaded & initialized native-lzo library [hadoop-lzo rev 6bb1b7f8b9044d8df9b4d2b6641db7658aab3cf8]
12/04/25 08:54:47 DEBUG util.NativeCodeLoader: Trying to load the custom-built native-hadoop library...
12/04/25 08:54:47 INFO util.NativeCodeLoader: Loaded the native-hadoop library
12/04/25 08:54:47 INFO zlib.ZlibFactory: Successfully loaded & initialized native-zlib library
12/04/25 08:54:47 DEBUG fs.FSInputChecker: DFSClient readChunk got seqno 0 offsetInBlock 0 lastPacketInBlock false packetLen 132100
可以看到将glibc升级后不再报错,已经成功加载本地库


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另外一例:错误都是一样,可以从中学到解决问题的方法


用官方的Hadoop 2.1.0-beta安装后,每次hadoop命令进去都会抛出这样一个Warning

WARN util.NativeCodeLoader: Unable to load native-hadoop library for your platform... using builtin-java classes where applicable

设置logger级别,看下具体原因


export HADOOP_ROOT_LOGGER=DEBUG,console​
  1. 13/08/29 13:59:38 DEBUG util.NativeCodeLoader: Trying to load the custom-built native-hadoop library...  
  2. 13/08/29 13:59:38 DEBUG util.NativeCodeLoader: Failed to load native-hadoop with error: java.lang.UnsatisfiedLinkError: /usr/local/hadoop/hadoop-2.1.0-beta/lib/native/libhadoop.so.1.0.0: /usr/local/hadoop/hadoop-2.1.0-beta/lib/native/libhadoop.so.1.0.0: wrong ELF class: ELFCLASS32 (Possible cause: architecture word width mismatch)  
  3. 13/08/29 13:59:38 DEBUG util.NativeCodeLoader: java.library.path=/usr/local/hadoop/hadoop-2.1.0-beta/lib/native/Linux-amd64-64:/usr/local/hadoop/hadoop-2.1.0-beta/lib/native  
  4. 13/08/29 13:59:38 WARN util.NativeCodeLoader: Unable to load native-hadoop library for your platform... using builtin-java classes where applicable  
复制代码
wrong ELFCLASS32,难道是加载的so文件系统版本不对

执行命令file libhadoop.so.1.0.0
libhadoop.so.1.0.0: ELF 32-bit LSB shared object, Intel 80386, version 1 (SYSV), dynamically linked, not stripped
果然是80386,是32位的系统版本,而我的hadoop环境是64位OS
原来直接从apache镜像中下载的编译好的Hadoop版本native library都是32版本的,如果要支持64位版本,必须自己重新编译,这就有点坑爹了,要知道几乎所有的生产环境都是64位的OS

YARN官方对于native library的一段话验证了这一点
“The pre-built 32-bit i386-Linux native hadoop library is available as part of the hadoop distribution and is located in the lib/native directory​”

重新checkout source code
svn checkout  http://svn.apache.org/repos/asf/ ... release-2.1.0-beta/
加上编译native的选项,编译时会根据当前的操作系统架构来生产相应的native库
mvn package -Pdist,native -DskipTests -Dtar
再去native文件下查看所有的file type,已经都是64位版的了,替换线上文件,WARNING消除
  1. file *  
  2. libhadoop.a:        current ar archive  
  3. libhadooppipes.a:   current ar archive  
  4. libhadoop.so:       symbolic link to `libhadoop.so.1.0.0'  
  5. libhadoop.so.1.0.0: ELF 64-bit LSB shared object, x86-64, version 1 (GNU/Linux), dynamically linked, not stripped  
  6. libhadooputils.a:   current ar archive  
  7. libhdfs.a:          current ar archive  
  8. libhdfs.so:         symbolic link to `libhdfs.so.0.0.0'  
  9. libhdfs.so.0.0.0:   ELF 64-bit LSB shared object, x86-64, version 1 (GNU/Linux), dynamically linked, not stripped  
复制代码

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