Janton Wang
Janton Wang

BLAST（基本局部比对工具）
nucletide blast blastn 短序列标准搜索
megablast 相似序列（单物种）之间比对
discontiguous megablast 跨物种序列比对
protein blast blasp 标准搜索
psi-blast 使用blastp搜索结果构建位置特异性得分矩阵（PSSM）
phi-blast 发现具有相同表达模型且相似的蛋白质序列
blastx 核酸序列转换成蛋白质序列搜索
tblastn 蛋白质序列转换成核酸序列搜索
tblastx 核酸序列转换成蛋白质序列，在将核酸数据库转换成的蛋白质数据库中搜索

对GenBank中人类VANGL2基因的mRNA进行比对搜索。

输入：
RefSeq检索号NM_020335
Job Title：任务名称
Database：核酸数据库检索
Optimize for：程序选择，简单的blastn即可
Expect threshold：期望值，越小越严格

BLAST（基本局部比对工具）_第1张图片
等待：BLAST（基本局部比对工具）_第2张图片
结果：

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