WRF，WPS,WRF-Chem安装及编译步骤及bug总结（2）

（1）中详细讲了安装和运行./geogrid.exe的过程和有关bug。

 ./ungrid.exe   ./metgrid.exe   .就相对简单了。

 

在运行WRF时遇到问题：

（1）在WRFV3/test/em_real  下运行 ./real.exe  时 报错：bash：没有找到文件或目录

但是ls后发现有./real.exe   

网上给的解决办法是再下载个32位的什么东西，但是没用。其实原因是：之前运行过WRF了，需要 ./clean -a 指令清除之前的过程， 然后重新编译./configure    ./compile，结果就出来了。

（2）在运行wrf时，要注意先确定WRFV3文件下main文件中四个.exe文件是否存在。如果不存在，需要先编译 ./configure.exe.编译之前得export netcdf的位置。

（3）编译WRF之前，需要对NETCDF进行链接，不然后面会让fix。  

语句为：

export NETCDF=（你的netcdf路径）

我的是/usr/local/wrf/LIBRARIES/netcdf

如果没有提前export，那就按照人家的指示fix：分别写出netcdf  library和include的绝对路径。

（4）如果修改过namelist中的gwt-opt=0, 需要重新./real.exe，然后./wrf.exe

改完之后如果直接运行.wrf.exe，就会报bug：

这时，需要：

重新链接，./real.exe  ./wrf.exe

 

安装WRF-Chem问题：

 

下载flex和yacc及其安装顺序问题:

（1）安装flex   make 的时候报错：找不到yacc   网上教程说安装bison，但是教程中说，

方法如下：

先安装yacc：

which yacc

——  没有路径 说明没有安装好的yacc版本

在下载的路径下

gzip -d byacc.1.9.tar.Z

mkdir /usr/local/yacc创建目录

将压缩包放到创建的目录下：tar -xf byacc.1.9.tar -C /usr/local/yacc

进入路径：cd /usr/local/yacc/

make 命令

完成后 gedit ~/.bashrc

输入：

#for chem

export PATH=/usr/local/yacc:$PATH

export YACC='/usr/local/yacc/yacc -d'

保存 关闭  返回命令行：

source ~/.bashrc

然后再

which yacc 

发现结果是：

 

Which flex

   没有结果  意思是没有安装好的flex

进入到下载目录  

创建 mkdir /usr/local/flex

mv flex.tar.gz /usr/local/flex

cd /usr/local/flex

cd flex-2.5.3

./configure --prefix=/usr/local/flex

Make

make install

然后

gedit ~/.bashrc 

添加：

export PATH=/usr/local/flex/bin:$PATH

export FLEX=/usr/local/flex/bin/flex

export FLEX_LIB_DIR=/usr/local/flex/lib

最后保存 退出  返回命令行

source ~/.bashrc 使其生效

Which yacc

Which flex

结果为：

这样就说明flex和yacc安装成功！

 

下载WRFV-Chem-3.9.1，

进入到下载路径，

Tar -xzf WRFV3-Chem-3.9.1.TAR.gz -C /usr/local/wrf/WRFV3

Cd /usr/local/wrf/WRFV3

./clean -a

此时，gedit ~/.bashrc

添加语句：

Export WRF_CHEM=1

Export WRF_KPP=0

然后 source ~/.bashrc

 

./configure

选择34  1

然后./compile em_real

 

（2）WRF-Chem的下载地址：WRF-Chem3.8.1 https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/src/WRFV3-Chem-3.8.1.TAR.gz

（3）第一次编译wrf成功，./clean -a 之后再./configure后让输入NETCDF的路径;  或者

报错：module_state_description.F  没有这个文件或目录 之类的错误：

解决办法为：

gedit ~/.bashrc 

检查最后面有没有环境配置的语句，如果没有，添加：

#for netcdf
export NETCDF=/usr/local/netcdf
export PATH=$PATH:$NETCDF/bin
export NETCDF_LIB=$NETCDF/lib
export NETCDF_INC=$NETCDF/include
export MANPATH=$NETCDF/share/man
export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1

然后记得：

source ~/.bashrc

如果还不行，可能是out of memory 的问题，考虑扩充swap。教程为：

https://www.jianshu.com/p/7d00ead50e3d

(4) 运行Chem  KPP=0时可以成功，但是KPP=1不能成功，报错为：

经查：不是WRFV下 Config_new.pl或configure.wrf 未修改的问题。

 

而且其实报错的log里面还会出现  module_state_description.F 的问题，但是都被ignored 了

如何改，还在尝试中。。。。

 

小Tips：

（1）如果使用的是虚拟机，在每个进展之后“拍摄快照”，这样后面如果做不成，也可以一键返回之前好的状态。

（2）及时记录自己的步骤，防止反复犯错，浪费时间

未完待续......