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深入理解PyTorch中的MessagePassing图神经网络(GraphNeuralNetworks,简称GNNs)在近年来已成为处理图形数据的一种强大工具,广泛应用于社交网络分析、蛋白质结构预测、知识图谱增强等多个领域。PyTorchGeometric(PyG)是基于PyTorch的一个库,专为图神经网络的研究和实现而设计。在PyG中,MessagePassing类是实现图神经网络层的核心组
- Task04:数据完整存储与内存的数据集类+结点预测与边预测任务实践
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数据完整存储与内存的数据集类一、InMemoryDataset基类简介在PyG中,通过继承InMemoryDataset类来自定义一个数据可全部存储到内存的数据集类。classInMemoryDataset(root:Optional[str]=None,transform:Optional[Callable]=None,pre_transform:Optional[Callable]=None,
- Datawhale组队学习GNN-task04 数据完整存储与内存的数据集类+节点预测与边预测任务实践
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- 【深度学习】pytorch 与 PyG 安装(pip安装)
何为xl
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【深度学习】pytorch与PyG安装(pip安装)一、PyTorch安装和配置(一)、安装CUDA(二)、安装torch、torchvision、torchaudio三个组件(1)下载镜像文件(2)创建一个新的虚拟环境(3)加载.whl文件并测试安装是否成功二、PyG安装(一)安装torch_scatter、torch_sparse、torch_cluster、torch_spline_conv
- 在Conda中搭建PyTorch+DGL+PyG时需要仔细查看的几个关于版本的网页
蛐蛐蛐
condapytorch人工智能
这方面的问题我总结过很多次了,例如:基于Conda的PyTorchGeometric报“段错误(核心已转储)”的解决方法_段错误,核心已转储yolov5-CSDN博客但是现在还是能遇到问题,例如今天在一个新的Ubuntu上复现别人论文里的实验,就还是出现了问题。因为这个repo用到了DGL(我也是用DGL和PyG比较多),报了一些诸如:cannotimportname'Mapping'from'c
- jupyter出现问题ModuleNotFoundError: No module named ‘exceptiongroup‘
我的心永远是冰冰哒
jupyterpythonwindows
今天使用pyg的jupyter环境发现这个环境没法用,所以只能把这个kernel给重删了然后再装,操作记录如下查看kerneljupyterkernelspeclist注意不是jupyterkernel--list需要加关键字spec,删除kerneljupyterkernelspecremovepyg当重新安装这个kernel时可能会出错python-mipykernelinstall--nam
- 使用Python的pygame库实现下雪的效果
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使用Python的pygame库实现下雪的效果关于Python中pygame游戏模块的安装使用可见https://blog.csdn.net/cnds123/article/details/119514520先给出效果图:源码如下:importpygameimportrandom#初始化pygamepygame.init()#设置屏幕尺寸width,height=800,600screen=pyg
- 一条命令解决安装torch_scatter torch_sparse torch_cluster torch_spline
_Lyang_
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在相应环境下输入pipinstallpyg_libtorch_scattertorch_sparsetorch_clustertorch_spline_conv-fhttps://data.pyg.org/whl/torch-2.0.0+cu118.html该命令安装了pyg_lib包以及一些与PyTorch相关的包(torch_scatter、torch_sparse、torch_cluster
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上次讲了如何给节点分类,这次我们来看如何用GNN完成图分类任务,也就是Graph-level的任务。【GNN1】PyG实现图神经网络,完成节点分类任务,人话、保姆级教程-CSDN博客图分类就是以图为单位的分类,举个例子:每个学校都有社交关系网,图分类就是通过这个社交网络判别这个学校是小学、初中、高中还是大学。实现方法就是通过利用图的结构信息,对图进行嵌入(embed),也就是用向量来表示这个图,使
- 一个Pygame的Hello World示例程序
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创建一个标题为HelloWorld的窗口,窗口中间显示有Pygame的Logo的python代码importsysimportpygamedefmain():pygame.init()screen=pygame.display.set_mode((800,400))pygame.display.set_caption("HelloWorld")logo=pygame.image.load("pyg
- 【GNN 1】PyG实现图神经网络,完成节点分类任务,人话、保姆级教程
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我们来做一个节点分类的任务,选择的数据集是KarateClub,Karate是空手道的意思,所以这就是一个空手道俱乐部的数据。简而言之,这个数据集,包含34个节点,156条无向无权边,结点总共分为4类,此外,每个节点还有34个特征,也就是说还有34个指标来描述空手道俱乐部的每个成员。欸?特征数怎么和节点数一样,没错,就是one-hot编码。下图是论文原图,颜色表示了类别。数据集的详细说明这个数据集
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第1章背景介绍11.1为什么要重视PowerShell11.2本书适用读者31.3如何使用本书31.4搭建自己的实验环境41.5安装WindowsPowerShell51.6在线资源71.7赶紧使用PowerShell吧7第2章初识PowerShell82.1选择你的“武器”82.2重新认识代码输入132.3常见误区152.4如何查看当前版本152.5动手实验162.6进一步学习16第3章使用帮助
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图的基本概念学习GNN之前需要掌握图的基本概念,这些概念基本都在数据结构这门课中涉及,需要再简单过一遍。1.有向图、无向图、有权图、无权图2.节点的度degree(出、入)3.节点邻接节点表示为N()4.子图和连通分量(连通分量属于子图的一种,但是联通分量中任意节点之间都存在路径且所有边的节点都存在与连通分量中)5.节点s→t之间的最短路径表示两结点中所有路径集合中取长度最短的路径6.连通图的直径
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学习php中使用composer下载安装firebase/php-jwt以及调用方法1、安装firebase/php-jwt2、封装jwt类1、安装firebase/php-jwtcomposerrequirefirebase/php-jwt安装好以后出现以下文件:2、封装jwt类根据所使用的php框架,在指定目录创建Token.php'pyg',//签发人(官方字段:非必需)'exp'=>tim
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涉及到下面几个包安装的时候经常会出现问题,这里我使用先下载然后再安装的办法:pipinstalltorch_clusterpipinstalltorch_scatterpipinstalltorch_sparse1、选择你对应的torch版本:https://data.pyg.org/whl/2、点进去然后,选择对应的版本就选择他们一一对应的的包下载即可,然后再pipinstallXXX.whl安
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详解PyG中的ToSLIC变换PyG是一个基于PyTorch的图神经网络库,提供了丰富的数据处理、图转换和图模型的功能。本文将介绍PyG中的一个图转换函数ToSLIC,它可以将一张图片转换为一个超像素图,并生成相应的数据对象。前言PyG是一个开源的Python库,用于深度学习任务中的图神经网络(GNN)建模和训练。该库包括多个GNN模型和与图相关的数据结构和算法。在本篇文章中,我将介绍PyG中的T
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目录1.图的表示2.图卷积网络(GCN)的搭建3.图注意力网络(GAT)的搭建4.PyG基础:图数据的操作1.torch_geometric的安装2.图数据的属性3.基准图数据库及基本操作4.图数据的可视化5.实验总结1.图的表示在开始讨论特定的图神经网络操作之前,我们首先来考虑如何表示图。在数学上,图G定义为一组节点/顶点V和一组边/链接E:G=(V,E)的二元组。每条边链接两个顶点,如下图所示
- mac M2 pytorch_geometric安装
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我目前的环境是macM2,我在base环境中安装了pytorch_geometric,仅仅做测试用的,不做真正跑代码的测试首先我的base环境的设置如下:pipinstallpyg_libtorch_scattertorch_sparsetorch_clustertorch_spline_conv-fhttps://data.pyg.org/whl/torch-2.1.0+cpu.htmlpipi
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#图神经网络GNN神经网络pytorch深度学习
文章说明:1)参考资料:PYG的文档。文档超链。2)博主水平不高,如有错误还望批评指正。文章目录一.图的数据处理二.常见的基准数据集三.小批量的计算方式四.数据变换五.后记一.图的数据处理导入对应的库fromtorch_geometric.dataimportDataimporttorch创建图数据的第一种方式,简单易懂不过多的赘述edge_index=torch.tensor([[0,1,1,2
- 普通邻接矩阵转换成edge_index的COO稀疏矩阵形式,格式为[2, num_messages]
weixin_46269351
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普通邻接矩阵转换成edge_index的COO稀疏矩阵形式,格式为[2,num_edges]。平时我们接触的邻接矩阵adj的形式要么是稠密矩阵(原始二维矩阵),但是在使用PyG框架的时候会发现格式不对,需要形式为[2,edges]的coo_matrix。首先,把adj转为普通的coo_matrix矩阵:adj=sp.coo_matrix(adj)(0,633)1(0,1862)1(0,2582)1
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搜这个转化实在难找,在此记录一下!**pyG的edge_index转COO同质图**importtorch_geometrictorch_geometric.utils.to_scipy_sparse_matrix(data.edge_index)异质图importnumpyasnp#假如异质图size:N*Mfromscipy.sparseimportcoo_matrixrow=(hetedat
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PyG的edgeindex形式是[(node1,node2),(node1,node3)...][(node_1,node_2),(node_1,node_3)...][(node1,node2),(node1,node3)...]这种edgepair。naive直接for循环,吧edgeindex里面的位置填充1:importtorchdefedge_index_to_adjacency_mat
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今天我伏笔了吗
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首先,简单回顾了图论方面的知识,其中拉普拉斯矩阵是图卷积节点嵌入的基本原理。其次,搭建了环境。最后,学习了PYG中Data和dataset的使用。data.Data类用来表示图数据集,有很多方便的函数和属性。dataset模块里面则包含了很多现成的数据集供使用。作业:classNewData(torch_geometric.data.Data):def__init__(self,node_org=
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PyGMessagePassing机制源码分析Google在2017发表的论文NeuralMessagePassingforQuantumChemistry中提到的MessagePassingNeuralNetworks机制成为了后来图机器学习计算的标准范式实现。而PyG提供了信息传递(邻居聚合)操作的框架模型。其中,□\square□表示可微、排列不变的函数,比如说sum、mean、maxγ\g
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Afresco o
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本文为pyg官网的中文翻译(官方原版链接https://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/),并加入了一些其他网上大佬和自己的理解。如有翻译理解不当之处还请各位多多指出,非常感谢!3.1CreatingMessagePassingNetworks将卷积算子推广到不规则域通常表示为邻域聚合或消息传递方案。用表示第(k-1)层中节点i的特征,表示节点
- log4j对象改变日志级别
3213213333332132
javalog4jlevellog4j对象名称日志级别
log4j对象改变日志级别可批量的改变所有级别,或是根据条件改变日志级别。
log4j配置文件:
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PHPtimezoneyii2
时区这东西,在开发的时候,你说重要吧,也还好,毕竟没它也能正常运行,你说不重要吧,那就纠结了。特别是linux系统,都TMD差上几小时,你能不痛苦吗?win还好一点。有一些常规方法,是大家目前都在采用的1、php.ini中的设置,这个就不谈了,2、程序中公用文件里设置,date_default_timezone_set一下时区3、或者。。。自己写时间处理函数,在遇到时间的时候,用这个函数处理(比较
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持续集成
持续集成是什么?我们为什么需要持续集成?持续集成带来的好处是什么?什么样的项目需要持续集成?... 持续集成(Continuous integration ,简称CI),所谓集成可以理解为将互相依赖的工程或模块合并成一个能单独运行
- 数据结构哈希表(hash)总结
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数据结构
1.什么是hash
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Hash,一般翻译做“散列”,也有直接音译为“哈希”的,就是把任意长度的输入,通过散列算法,变换成固定长度的输出,该输出就是散列值。这种转换是一种压缩映射,也就是,散列值的空间通常远小于输入的空间,不同的输入可能会散列成相同的输出,所以不可能从散列值来唯一的确定输入值。简单的说就是一种将任意长度的消息压缩到某一固定长度的消息摘要的函数。
- 乱七八糟
程序员是怎么炼成的
eclipse中的jvm字节码查看插件地址:
http://andrei.gmxhome.de/eclipse/
安装该地址的outline 插件 后重启,打开window下的view下的bytecode视图
http://andrei.gmxhome.de/eclipse/
jvm博客:
http://yunshen0909.iteye.com/blog/2
- 职场人伤害了“上司” 怎样弥补
aijuans
职场
由于工作中的失误,或者平时不注意自己的言行“伤害”、“得罪”了自己的上司,怎么办呢?
在职业生涯中这种问题尽量不要发生。下面提供了一些解决问题的建议:
一、利用一些轻松的场合表示对他的尊重
即使是开明的上司也很注重自己的权威,都希望得到下属的尊重,所以当你与上司冲突后,最好让不愉快成为过去,你不妨在一些轻松的场合,比如会餐、联谊活动等,向上司问个好,敬下酒,表示你对对方的尊重,
- 深入浅出url编码
antonyup_2006
应用服务器浏览器servletweblogicIE
出处:http://blog.csdn.net/yzhz 杨争
http://blog.csdn.net/yzhz/archive/2007/07/03/1676796.aspx
一、问题:
编码问题是JAVA初学者在web开发过程中经常会遇到问题,网上也有大量相关的
- 建表后创建表的约束关系和增加表的字段
百合不是茶
标的约束关系增加表的字段
下面所有的操作都是在表建立后操作的,主要目的就是熟悉sql的约束,约束语句的万能公式
1,增加字段(student表中增加 姓名字段)
alter table 增加字段的表名 add 增加的字段名 增加字段的数据类型
alter table student add name varchar2(10);
&nb
- Uploadify 3.2 参数属性、事件、方法函数详解
bijian1013
JavaScriptuploadify
一.属性
属性名称
默认值
说明
auto
true
设置为true当选择文件后就直接上传了,为false需要点击上传按钮才上传。
buttonClass
”
按钮样式
buttonCursor
‘hand’
鼠标指针悬停在按钮上的样子
buttonImage
null
浏览按钮的图片的路
- 精通Oracle10编程SQL(16)使用LOB对象
bijian1013
oracle数据库plsql
/*
*使用LOB对象
*/
--LOB(Large Object)是专门用于处理大对象的一种数据类型,其所存放的数据长度可以达到4G字节
--CLOB/NCLOB用于存储大批量字符数据,BLOB用于存储大批量二进制数据,而BFILE则存储着指向OS文件的指针
/*
*综合实例
*/
--建立表空间
--#指定区尺寸为128k,如不指定,区尺寸默认为64k
CR
- 【Resin一】Resin服务器部署web应用
bit1129
resin
工作中,在Resin服务器上部署web应用,通常有如下三种方式:
配置多个web-app
配置多个http id
为每个应用配置一个propeties、xml以及sh脚本文件
配置多个web-app
在resin.xml中,可以为一个host配置多个web-app
<cluster id="app&q
- red5简介及基础知识
白糖_
基础
简介
Red5的主要功能和Macromedia公司的FMS类似,提供基于Flash的流媒体服务的一款基于Java的开源流媒体服务器。它由Java语言编写,使用RTMP作为流媒体传输协议,这与FMS完全兼容。它具有流化FLV、MP3文件,实时录制客户端流为FLV文件,共享对象,实时视频播放、Remoting等功能。用Red5替换FMS后,客户端不用更改可正
- angular.fromJson
boyitech
AngularJSAngularJS 官方APIAngularJS API
angular.fromJson 描述: 把Json字符串转为对象 使用方法: angular.fromJson(json); 参数详解: Param Type Details json
string
JSON 字符串 返回值: 对象, 数组, 字符串 或者是一个数字 示例:
<!DOCTYPE HTML>
<h
- java-颠倒一个句子中的词的顺序。比如: I am a student颠倒后变成:student a am I
bylijinnan
java
public class ReverseWords {
/**
* 题目:颠倒一个句子中的词的顺序。比如: I am a student颠倒后变成:student a am I.词以空格分隔。
* 要求:
* 1.实现速度最快,移动最少
* 2.不能使用String的方法如split,indexOf等等。
* 解答:两次翻转。
*/
publ
- web实时通讯
Chen.H
Web浏览器socket脚本
关于web实时通讯,做一些监控软件。
由web服务器组件从消息服务器订阅实时数据,并建立消息服务器到所述web服务器之间的连接,web浏览器利用从所述web服务器下载到web页面的客户端代理与web服务器组件之间的socket连接,建立web浏览器与web服务器之间的持久连接;利用所述客户端代理与web浏览器页面之间的信息交互实现页面本地更新,建立一条从消息服务器到web浏览器页面之间的消息通路
- [基因与生物]远古生物的基因可以嫁接到现代生物基因组中吗?
comsci
生物
大家仅仅把我说的事情当作一个IT行业的笑话来听吧..没有其它更多的意思
如果我们把大自然看成是一位伟大的程序员,专门为地球上的生态系统编制基因代码,并创造出各种不同的生物来,那么6500万年前的程序员开发的代码,是否兼容现代派的程序员的代码和架构呢?
- oracle 外部表
daizj
oracle外部表external tables
oracle外部表是只允许只读访问,不能进行DML操作,不能创建索引,可以对外部表进行的查询,连接,排序,创建视图和创建同义词操作。
you can select, join, or sort external table data. You can also create views and synonyms for external tables. Ho
- aop相关的概念及配置
daysinsun
AOP
切面(Aspect):
通常在目标方法执行前后需要执行的方法(如事务、日志、权限),这些方法我们封装到一个类里面,这个类就叫切面。
连接点(joinpoint)
spring里面的连接点指需要切入的方法,通常这个joinpoint可以作为一个参数传入到切面的方法里面(非常有用的一个东西)。
通知(Advice)
通知就是切面里面方法的具体实现,分为前置、后置、最终、异常环
- 初一上学期难记忆单词背诵第二课
dcj3sjt126com
englishword
middle 中间的,中级的
well 喔,那么;好吧
phone 电话,电话机
policeman 警察
ask 问
take 拿到;带到
address 地址
glad 高兴的,乐意的
why 为什么
China 中国
family 家庭
grandmother (外)祖母
grandfather (外)祖父
wife 妻子
husband 丈夫
da
- Linux日志分析常用命令
dcj3sjt126com
linuxlog
1.查看文件内容
cat
-n 显示行号 2.分页显示
more
Enter 显示下一行
空格 显示下一页
F 显示下一屏
B 显示上一屏
less
/get 查询"get"字符串并高亮显示 3.显示文件尾
tail
-f 不退出持续显示
-n 显示文件最后n行 4.显示头文件
head
-n 显示文件开始n行 5.内容排序
sort
-n 按照
- JSONP 原理分析
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JavaScriptjsonpjsonp 跨域
转自 http://www.nowamagic.net/librarys/veda/detail/224
JavaScript是一种在Web开发中经常使用的前端动态脚本技术。在JavaScript中,有一个很重要的安全性限制,被称为“Same-Origin Policy”(同源策略)。这一策略对于JavaScript代码能够访问的页面内容做了很重要的限制,即JavaScript只能访问与包含它的
- 使用connect by进行级联查询
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oracle查询父子Connect by级联
使用connect by进行级联查询
connect by可以用于级联查询,常用于对具有树状结构的记录查询某一节点的所有子孙节点或所有祖辈节点。
来看一个示例,现假设我们拥有一个菜单表t_menu,其中只有三个字段:
- 一个不错的能将HTML表格导出为excel,pdf等的jquery插件
jackyrong
jquery插件
发现一个老外写的不错的jquery插件,可以实现将HTML
表格导出为excel,pdf等格式,
地址在:
https://github.com/kayalshri/
下面看个例子,实现导出表格到excel,pdf
<html>
<head>
<title>Export html table to excel an
- UI设计中我们为什么需要设计动效
lampcy
UIUI设计
关于Unity3D中的Shader的知识
首先先解释下Unity3D的Shader,Unity里面的Shaders是使用一种叫ShaderLab的语言编写的,它同微软的FX文件或者NVIDIA的CgFX有些类似。传统意义上的vertex shader和pixel shader还是使用标准的Cg/HLSL 编程语言编写的。因此Unity文档里面的Shader,都是指用ShaderLab编写的代码,
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nannan408
htmljspcache
禁止页面使用缓存~
------------------------------------------------
jsp:页面no cache:
response.setHeader("Pragma","No-cache");
response.setHeader("Cache-Control","no-cach
- 以代码的方式管理quartz定时任务的暂停、重启、删除、添加等
Everyday都不同
定时任务管理spring-quartz
【前言】在项目的管理功能中,对定时任务的管理有时会很常见。因为我们不能指望只在配置文件中配置好定时任务就行了,因为如果要控制定时任务的 “暂停” 呢?暂停之后又要在某个时间点 “重启” 该定时任务呢?或者说直接 “删除” 该定时任务呢?要改变某定时任务的触发时间呢? “添加” 一个定时任务对于系统的使用者而言,是不太现实的,因为一个定时任务的处理逻辑他是不
- EXT实例
tntxia
ext
(1) 增加一个按钮
JSP:
<%@ page language="java" import="java.util.*" pageEncoding="UTF-8"%>
<%
String path = request.getContextPath();
Stri
- 数学学习在计算机研究领域的作用和重要性
xjnine
Math
最近一直有师弟师妹和朋友问我数学和研究的关系,研一要去学什么数学课。毕竟在清华,衡量一个研究生最重要的指标之一就是paper,而没有数学,是肯定上不了世界顶级的期刊和会议的,这在计算机学界尤其重要!你会发现,不论哪个领域有价值的东西,都一定离不开数学!在这样一个信息时代,当google已经让世界没有秘密的时候,一种卓越的数学思维,绝对可以成为你的核心竞争力. 无奈本人实在见地