中国人终于拥有自己的综合性基因组数据库!

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陈卫华,华中科技大学教授、博士生导师;奇云诺德联合创始人;生物数据整合专家、大数据分析专家。中科院基因组所博士。生物科班出身,后专攻生物信息学,已不下十年。入行来以第一作者发表文章数十篇,其中包括科学(Science)、分子系统生物学(Molecular Systems Biology)、自然通讯(Nature Communications)等顶级杂志。视科研为终生爱好,但又注重科学与普通人生活的接轨,理论与实践并重。个人爱好广泛,除生物学外,对心理、科技、人文也多有涉猎。自以为普通人成功的三大要素:不懈的努力、追求成功的信念和不甘平庸的执着。

6.5亿美元,纽约欲打造下一个生物技术中心

近日,纽约州州长Andrew M. Cuomo先生宣布了将启动一项开创性的6.5亿美元计划,旨在推动发展纽约成为一个新的世界级生命科学研究中心,以实现生命医学研究市场化,达到繁荣经济的目的。生命科学部门将广阔包纳生物技术、制药、生物医学技术、生命系统技术等领域,将大部分涉及研究、开发、技术转让和市场化各个阶段的研究组织和行业机构。

资讯来源:http://www.biodiscover.com/news/politics/651658.html

陈卫华点评

近几年生命医学领域的趋势,无论是转化医学的提出,还是精准医疗的流行,都指向了研究成果的快速转化和应用。而背后的推动力量则至少包括三个部分,比如基因突变在疾病风险作用的研究、测序成本的快速降低以及大规模处理生物医学数据和快速从中撮取知识的能力。

这样一个以转化为目标的研究中心的建立,无疑是顺应趋势、思路正确、前景可期的。

仰卧起坐引发的背痛或与基因相关

一直以来很多人都认为,仰卧起坐是有效的腹肌锻炼方法。在中小学体质测定时,仰卧起坐也是测定内容之一。最新研究表明,仰卧起坐可能会引起下腰痛、颈部拉伤、下腹部器官损伤,甚至腰椎损伤。我国台湾还出现了因做仰卧起坐造成瘫痪的报道。

资讯来源:http://news.bioon.com/article/6695693.html

测序仪国产化:助力我国基因科技绝处逢生

基因测序仪对于基因产业的重要性,如同发动机之于汽车行业,芯片之于电子通信行业。我国基因测序仪的国产化,不仅打破了外企的市场垄断,实现了我国基因科技布局产业上游的突破,也从根本上保障了我国遗传资源的安全。

资讯来源:http://www.rmzxb.com.cn/c/2016-12-14/1214796.shtml

陈卫华点评

华大于2013年收购美国测序仪公司CG,其重要性不亚于当年乐凯对中国胶片市场的贡献。没有乐凯,我们可能需要花费几倍的金钱去柯达胶卷。然而,和胶卷终将被数字相机取代一样,买来的技术终究会被淘汰。没有自己的研发,在测序技术上我们终究还是落后者,中国的遗传资源安全(如果有这种东西存在的话)还是一句空话。

我国将拥有独立自主的综合性基因组数据库

终于,我国将拥有独立自主的综合性基因组数据库。近日,记者从中国科学院北京基因组研究所获悉,该所一篇题为《北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化》的论文,已于近日被国际学术期刊《核酸研究》在线发表。这是国内首次以数据中心为模式,整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着我国生命与健康大数据中心建设取得实质性进展。

资讯来源:http://news.sina.com.cn/c/2016-12-19/doc-ifxytkcf8105647.shtml

陈卫华点评

从国外回来,最不爽的事情就是从公共数据库下载数据慢的要死,好像一下子回到了拨号上网时代,向公共数据库提交数据也是如此。北京基因组研究所生命与健康大数据中心的出现,很好的从根本上解决了这一问题。小伙伴们这篇文章的发表,会提高他们在国内外的影响力,确立他们的“合法地位”,让更多的杂志承认向他们提交的数据。恭喜他们!

基因检测终于将放疗也带入了精准医疗时代

一群来自莫菲特癌症中心(Moffitt Cancer Center)的科学家在《柳叶刀 肿瘤学》杂志上发表了研究,他们开发了一种新的基因组学模型,可以让放疗也变得“个性化”。

对于这个研究成果,莫菲特癌症中心放射肿瘤学部门的主任Louis B. Harrison给予了很高的评价。他认为,GARD模型是首次将基因检测与放疗剂量联系在一起,为研究人员和医生提供了一种安全可行的方法将放射肿瘤学“变得精准”。

资讯来源:https://mp.weixin.qq.com/s/Nu9kS4gwLIqGMEWdhMgoWQ

陈卫华点评

精准医疗喊到现在,最为人诟病的一点是不能让大部分人受益。放化疗是目前唯一一个广谱、有效的肿瘤治疗手段,但它的副作用也是很可怕的。精准医疗与肿瘤放射治疗结合,以合适的放射剂量达到最佳的效果,是患者的福音,也是精准医疗惠及大众的一大步。

人类开启太空活体生物基因测序全新时代

NASA微生物学家萨拉·卡斯特罗-华莱士说:"下一步我们将把整个测序过程搬到太空,不再带样本到太空,而是直接在太空准备样本,然后进行基因测序。宇航员将不仅能对已知的生物测序,还能在太空完成取样、准备样本和测序整个过程,最终识别出未知的外星生命。"

资讯来源:http://www.stdaily.com/cxzg80/rdjj33/2016-12/20/content_487148.shtml

陈卫华点评

如果太空中也有碳基生命,也使用ATGC传递遗传信息的话,这倒是个好主意。

FDA批准首个基于二代测序(NGS)的伴随诊断试剂盒

2016年12月19日,美国食品和药物管理局(FDA)批准了Foundation Medicine公司的Foundation Focus CDxBRCA产品,成为市场上第一个基于二代测序的伴随诊断试剂盒。该产品被批准用于鉴定携带BRCA突变的晚期卵巢癌患者,这些患者更易对Clovis Oncology公司生产的PARP抑制剂Rubraca(rucaparib)有反应。与此同时,FDA加速批准了Rubraca这一新药,该药物适用于已经用两种或更多种化疗治疗并且携带有害的BRCA1和BRCA2基因突变的晚期卵巢癌患者。

资讯来源:http://www.biodiscover.com/news/product/651757.html

陈卫华点评

精准医疗惠及大众的时代真的是来了啊!

基因测序市场风云再起:罗氏终止与PacBio合作开发测序系统

根据罗氏公司向美国证券交易委员会提交的文件,它已经终止了与Pacific Biosciences的开发、商业化和许可协议。终止将在2017年2月10日生效。在一项声明中,PacBio的CEO Mike Hunkapiller表示,尽管公司对罗氏决定终止协议感到失望,但是“我们对这个市场已经很熟悉,罗氏的决定不会明显改变我们近期的业务扩张计划,以满足临床市场”。

资讯来源:http://www.eepw.com.cn/article/201612/341923.htm

拓普基因完成超亿元A轮融资 经纬中国领投

日前,拓普基因科技(广州)有限责任公司(简称“拓普基因”)宣布成功完成由经纬中国领投超亿元人民币 A 轮融资,将全力打造肿瘤精准医学生态圈。本轮融资完成后拓普基因将充分挖掘基因大数据的潜能,建立中国人群肿瘤药物的应用及诊断大数据。以肿瘤为核心,确定第一个五年发展阶段暨2020年前,将战略领域扩大到女性肿瘤。

资讯来源:http://kuaixun.stcn.com/2016/1221/12987662.shtml#_cj

基因建库突破性进展,助力我国精准医疗大有可为

近日,BD在P4 China 2016国际精准医疗大会上推出全球第一款通量灵活、全自动一体化的文库制备仪BD CLiCTM 系统,极大缩短了批量处理样本的时间,全面突破了目前基因建库面临的技术难点,为高通量基因测序提供整体解决方案。

资讯来源:http://www.biodiscover.com/news/industry/651682.html

科学家开发生物信息学新工具评估癌基因预测方法准确性

题为“Evaluating the evaluation of cancer driver genes”的文章最近发表在国际学术期刊PNAS上。研究人员表示由于遗传学研究方法在开发抗癌策略方面有潜在价值,因此对这些方法进行评估有非常重要的意义。该文章的其中一位作者Bert Vogelstein这样说道:“发现促进癌症的基因突变通常都很有挑战性,但是对于指引抗癌策略的开发是至关重要的。这篇文章建立了新的方法来评估目前用来发现促癌突变的一些技术,对于该领域在未来的进一步发展可能有推动作用。”

资讯来源:http://news.bioon.com/article/6695802.html

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