pythonic生物人
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年终总结（2020年原创目录合集）：日拱一卒，不期速成！

  • 首先，祝所有看到这篇文字的小伙伴新年快乐！！
  • 在过去的2020年，自己最大的收获就是养成了持续学习的习惯，认识了很多优秀的小伙伴。这一年自己写了好多篇，不敢说篇篇精华，但敢说篇篇都在用心，本文集结成目录（包含生物信息学精进篇、统计学精进篇、Pyton可视化篇、Python数据科学篇、R可视化篇、R基础篇、Perl基础篇）。
  • 2021年将系统精进：统计学、监督机器学习算法等在肿瘤生物信息学上的运用。
    年终总结（2020年原创目录合集）：日拱一卒，不期速成！_第1张图片

生物信息学精进篇

Omics精进10|bwa aln|mem|bwasw怎么选

Omics精进09|mRNA生信分析常规流程

Omics精进08|mRNA测序文库构建

Omics精进07|转录组之mRNA|miRNA|lncRNA|circRNA测序简介

Omics精进06|Gene panel检测报告解读

Omics精进05|临床Gene Panel检测-实验&&生物信息学分析（带UMI标签）

Omics精进04|临床Gene Panel检测-实验&&生物信息学分析

Omics精进03|一文彻底搞明白Germline Mutation和Somatic Mutation

Omics精进02|临床Gene Panel设计

Omics精进01|临床WGS/WES/Gene Panel/Single gene异同

NGS数据格式梳理02-SAM/BAM格式最详细解读

NGS数据格式梳理01-FASTQ和FASTA格式详解

NGS测序原理梳理03-边合成边测序

NGS测序原理梳理02-簇生成

NGS测序基础梳理01-文库构建

统计学精进篇

征服统计学06|统计模型、抽样分布是什么？

征服统计学05|总体or估算总体均值、方差、标准差是什么？

征服统计学04|什么是统计学中的总体参数？

征服统计学03|什么是中心极限定理？

征服统计学02|什么是正态分布？

征服统计学01|什么是统计分布？

Python可视化篇

  • 系统梳理了Python中Matplotlib、Seaborn、plotnine及pygal几个可视化package的使用；系统梳理了Python中可视化颜色的使用。

Matplotlib、Seaborn

Python可视化44|画个“圣诞树”

Python可视化|Matplotlib40-LaTeX in Matplotlib和python

Python可视化|Matplotlib39-Matplotlib 1.4W+字教程（珍藏版）

Python可视化|Matplotlib38-Matplotlib官方Cheat sheet（上篇）

Python可视化35|matplotlib&seaborn-一些有用的图

Python可视化34|matplotlib-多子图绘制(为所欲为版)

Python可视化33|matplotlib-rcParams及绘图风格(style)设置详解

Python可视化32|matplotlib-断裂坐标轴(broken_axis)|图例(legend)详解

Python可视化31|matplotlib-图添加文本(text)及注释(annotate)

Python可视化30|matplotlib-辅助线(axhline|vlines|axvspa|axhspan)

Python可视化29|matplotlib-饼图（pie）

Python可视化28|matplotlib绘制韦恩图（2-6组数据）

Python可视化27|seaborn绘制线型回归图曲线

Python可视化26|seaborn绘制分面图（seaborn.FacetGrid）

Python可视化25|seaborn绘制矩阵图

Python可视化24|seaborn绘制多变量分布图（jointplot|JointGrid）

Python可视化23|seaborn.distplot单变量分布图(直方图|核密度图)

Python可视化22|Seaborn.catplot(下)-boxenplot|barplot|countplot图

Python可视化21|Seaborn.catplot(上)-小提琴图等四类图

Python可视化20|Seaborn散点图&&折线图

Python可视化19|seborn图形外观设置

Python可视化17seborn-箱图boxplot

Python可视化matplotlib&seborn16-相关性heatmap

Python可视化matplotlib&seborn15-聚类热图clustermap

Python可视化matplotlib&seborn14-热图heatmap

Python可视化|matplotlib13-直方图（histogram）详解

Python可视化|matplotlib12-垂直|水平|堆积条形图详解

Python可视化|matplotlib11-绘制折线图matplotlib.pyplot.plot

Python可视化|matplotlib10-绘制散点图scatter

Python可视化|matplotlib04-绘图风格（plt.style）大全

Python可视化|matplotlib03-一文掌握marker和linestyle使用

python可视化|matplotlib02-matplotlib.pyplot坐标轴|刻度值|刻度|标题设置

python可视化|matplotlib01-绘图方式|图形结构

plotnine

Python可视化43|plotnine≈Python版ggplot2

pygal

Python可视化|pygal37-pygal用法及示例

颜色使用

Python可视化18|seborn-seaborn调色盘（六）

Python|R可视化|09-提取图片颜色绘图（五-颜色使用完结篇）

Python可视化|08-Palettable库中颜色条Colormap（四）

Python可视化|matplotlib07-自带颜色条Colormap（三）

Python可视化|matplotlib06-外部单颜色（二）

Python可视化|matplotlib05-内置单颜色（一）

Python数据科学篇

  • 系统梳理了Python3基础、NumPy、Pandas、Jupyter Notebook、及Anaconda的使用。

Anaconda

利用Anaconda在Windows及Linux下搭建Python环境【手把手版】
Conda|Python包和版本管理利器

Jupyter Notebook

玩转Jupyter Notebook5-配置python|R|Julia|Stata

玩转Jupyter Notebook4-【换个皮肤】吧！

玩转Jupyter Notebook3-(“魔法”命令篇)

玩转Jupyter Notebook2-(插件篇：16实用插件)

玩转Jupyter Notebook-(入门篇)

Numpy、Pandas

NumPy的过去现在和未来！

python数据分析包|Pandas-04pandas学习资料大放送

python数据分析包|Pandas&NumPy小抄（Cheat_Sheet）

python数据分析包|Pandas-03pandas读写表格数据

python数据分析包|Pandas-02之缺失值（NA）处理

python数据分析包|Pandas-01之DataFrame&Series

python数据分析包|NumPy-02

python数据分析包|NumPy-01

Python3基础

python3基础12详解模块和包（库）|构建|使用

python3基础11异常处理|文件读取|文件写入

python3基础10面向“对象”编程

python3基础09列表推导式|迭代器|生成器|匿名函数

python3基础08函数（python内置）

python3基础07函数（自定义）

python3基础06流程控制语句

python3基础05布尔类型和比较运算符

python3基础04字典（dict）和集合（set）

python3基础03列表（list）和元组（tuple）

python3基础02数值和字符串（二）

python3基础01数值和字符串（一）

R可视化篇

系统的梳理了ggplot2的图层图形语法、一些R可视化包

R可视化23|Christmas tree

R可视化22|换妆利器-ggpattern

R可视化21|30个统计图绘制原理+使用场景+code

R可视化20|最基础元素详解(Modern Statistical Graphics)

R可视化19|ggplot2绘制常用30+个靓图(附R code)

R可视化18|ggstatsplot几行code终结SCI级图表统计+画图 (下)

R可视化17|ggstatsplot几行code终结SCI级图表统计+画图 (上)

R可视化16|《ggplot2：数据分析与图形艺术》最新版（第三版）笔记合集

R可视化15|27种常见物种解剖图轻松绘制

R可视化14|ggthemr、gsci、tvthemes助您绘制靓丽美图

R可视化13|ggplot2-图层图形语法 (5)

R可视化12|ggplot2-图层图形语法 (4)

R可视化11|ggplot2-图层图形语法 (3)

R可视化10|ggplot2-图层图形语法 (2)

R可视化09|ggplot2-图层图形语法 (1)

R可视化08|ggplot2图层-标度图层（scale layer）-图例篇

R可视化07|ggplot2图层-标度图层（scale layer）-颜色盘篇

R可视化06|ggplot2图层-标度图层（scale layer）-坐标轴篇

R可视化05|ggplot2图层-注释图层（Annotation layer）

R可视化04|ggplot2图层-统计变换图层（stat layer）

R可视化03|ggplot2图层-几何对象图层（geom layer）

R可视化02|ggplot2-ggplot2快速绘图

R可视化01|ggplot2-ggplot2简介

R基础篇

R语言基础（一）

R语言基础(2)-向量|矩阵|数组|数据框|数据IO|实用函数

R语言基础(3)-变量|运算符|变量简单操作

R语言基础(4)-数学&统计&概率&字符串处理函数|自定义函数|流程控制语句

Perl与生物信息篇

​Perl学习01之标量数据

Perl学习02数组和哈希使用

Perl学习03之流程控制结构

Perl学习04之IO及文件读写

Perl学习05之正则表达式

Perl学习06之一行式操作

Perl学习07之自增（++）自减（–）

Perl学习08之子程序

Perl学习09之文件目录操作

Perl学习10之perl模块详解（一）

Perl学习11之perl模块详解（二）

Perl学习12之defined undef使用

Perl学习13之路径获取模块：Cwd、FindBin和File::Basename

Perl学习14之$0,ARGV,use warnings,use stricts使用

Perl学习15之perl读excel表格

Perl学习16之读文件，存入哈希，输出到文件

Perl学习17之生信简单运用

Perl学习18之生信简单运用（二）

Perl学习19之生信简单运用（三）

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按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他