大家有没有听说过“三行代码行天下”这句话
真的有这么强吗?
没错,你没有听错
python在数据处理建模这方面确实段位很高
那么,python中的最重要的装备之一就是“sklearn”
下面我们就来看看sklearn是如何来实现决策树中的分类树的
本文目录:
1
概述
1.1 sklearn
中的决策树
2 DecisionTreeClassififier
与红酒数据集
2.1
重要参数
2.1.1 criterion
2.1.2 random_state & splitter
2.1.3
剪枝参数
2.1.4
目标权重参数
2.2
重要属性和接口
1 概述
决策树(
Decision Tree
)是一种非参数的有监督学习方法,它能够从一系列有特征和标签的数据中总结出决策规 则
并用树状图的结构来呈现这些规则,以解决分类和回归问题。决策树算法容易理解,适用各种数据,在解决各 种问题时都有良好表现
尤其是以树模型为核心的各种集成算法,在各个行业和领域都有广泛的应用。
如果对决策树原理还不了解的,请看作者博客文章《机器学习-万字长文介绍决策树之原理(一)
》
1.1 sklearn中的决策树
在sklearn模块中决策树是
sklearn.tree
sklearn
中决策树的类都在
”tree“
这个模块之下。这个模块总共包含五个类:
在开始敲代码之前,我们先看看sklearn建模的基本流程:
如果按照上图的流程,分类树的建模流程就是:
from sklearn import tree #导入需要的模块
clf = tree.DecisionTreeClassifier() #实例化
clf = clf.fit(X_train,y_train) #用训练集数据训练模型
result = clf.score(X_test,y_test) #导入测试集,从接口中调用需要的信息
是不是只用了三行呢?!
下面我们用一个具体的例子来讲解分类树
2 DecisionTreeClassififier与红酒数据集
我们先看看分类树的参数:
是不是傻眼了?这么多,看到都脑阔疼。
没关系,接下来我们挑选其中重要的参数配合实际的例子来讲清楚。
2.1 重要参数
2.1.1 criterion
为了要将表格转化为一棵树,决策树需要找出最佳节点和最佳的分枝方法,对分类树来说,衡量这个
“
最佳
”
的指标 叫做“
不纯度
”
。
通常来说,不纯度越低,决策树对训练集的拟合越好。现在使用的决策树算法在分枝方法上的核心 大多是围绕在对某个不纯度相关指标的最优化上。
不纯度基于节点来计算,树中的每个节点都会有一个不纯度,并且子节点的不纯度一定是低于父节点的,也就是 说,在同一棵决策树上,叶子节点的不纯度一定是最低的。
Criterion
这个参数正是用来决定不纯度的计算方法的。
sklearn
提供了两种选择:
1
)输入
”entropy“
,使用
信息熵
(
Entropy
)
2
)输入
”gini“
,使用
基尼系数
(
Gini Impurity
)
其中
t
代表给定的节点,
i
代表标签的任意分类, 代表标签分类i
在节点
t
上所占的比例。
注意,当使用信息熵 时,sklearn
实际计算的是基于信息熵的信息增益
(Information Gain)
,即父节点的信息熵和子节点的信息熵之差。
比起基尼系数,信息熵对不纯度更加敏感,对不纯度的惩罚最强。
但是
在实际使用中,信息熵和基尼系数的效果基
本相同。
信息熵的计算比基尼系数缓慢一些,因为基尼系数的计算不涉及对数。
另外,因为信息熵对不纯度更加敏感,所以信息熵作为指标时,决策树的生长会更加“
精细
”
因此对于高维数据或者噪音很多的数据,信息熵很容易 过拟合,基尼系数在这种情况下效果往往比较好。
当模型拟合程度不足的时候,即当模型在训练集和测试集上都表 现不太好的时候,使用信息熵。当然,这些不是绝对的。
到这里,决策树的基本流程其实可以简单概括如下:
下面我们真的要开始上代码了,一般大多数讲决策树的教程都会用鸢尾花(iris)数据集
但是用这个数据集不太好,原因是有一个参数不能够用这个数据集很清楚的介绍,下面我们会讲到
所以本文用的是红酒数据集
首先,要确保你的计算机上有机器学习的环境,如果没有,请看作者文章《机器学习-环境配置(windows版)》
然后我们打开cmd,输入指令:
jupyter lab
新建一个".ipynb"文件准备敲代码
第一步:导入所需要的包
from sklearn import tree
from sklearn.datasets import load_wine
from sklearn.model_selection import train_test_split
第二步:查看数据
我们先来看看这个红酒数据集到底是什么样子的
wine = load_wine()
wine.data.shape
解释一下:这是说这个数据集有178行,13列
wine.target
解释一下:这是说这个数据集中的标签有三种,0,1和2,也就是这些红酒被分成了三类。
import pandas as pd
pd.concat([pd.DataFrame(wine.data),pd.DataFrame(wine.target)],axis=1)#第一个参数是将两个DataFrame合并,axis默认为0,是纵向合并,为1是横向合并
解释一下:这里是将红酒属性数据集和标签列进行了横向链接(也叫合并,学过数据库的都知道)
wine.feature_names
解释一下:这是红酒的属性名字
wine.target_names
解释一下:这是标签名字,也就是分类的名字
Xtrain,Xtest,Ytrain,Ytest=train_test_split(wine.data,wine.target,test_size=0.3)
解释一下:这里是说将数据集分为训练集和测试集,其中70%为训练集,30%为测试集。
Xtrain.shape
解释一下:训练集有124个样本,13个属性
Xtest.shape
解释一下:训练集有54个样本,13个属性
Ytrain
这是说训练集的目标属性,有三种,为0,1,2
第三步:建立模型(三行代码行天下)
clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy")
clf = clf.fit(Xtrain,Ytrain)
score = clf.score(Xtest,Ytest)#返回预测的准确accuracy
score
解释一下:模型得分0.9259,还算不错。
第四步:画出这棵树
feature_name = ['酒精','苹果酸','灰','灰的碱性','镁','总酚','类黄酮','非黄烷类酚类','花青素','颜 色强度','色调','od280/od315稀释葡萄酒','脯氨酸']
import graphviz
dot_data = tree.export_graphviz(clf,out_file = None,feature_names= feature_name,class_names=["琴酒","雪莉","贝尔摩德"],filled=True,rounded=True)
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
解释一下:上图就是决策树选出的一些属性,利用这些属性建立的分类树。
那么我们能不能将每个属性的重要性打印出来呢?回答是可以的
#特征重要性
clf.feature_importances_
[*zip(feature_name,clf.feature_importances_)]
是不是不够直观,是因为我们还是无法知道哪个属性对应的重要性的数值。
[*zip(feature_name,clf.feature_importances_)]
是不是直观多了呢
到这里,你是不是一位我们的工作完成了呢?
当然没有,这只是开始呢,我们还有更重要的工作要做。
多次运行上述建模代码,你会发现score的值每次都不一样。
那么它为什么会不稳定呢?是不是对所有数据集都这样呢?
这是因为决策树模型的的计算步骤中,
不纯度是基于节点来计算的,也就是说,决策树在建树时,是靠优化节点来追求一棵优化的树
但最优 的节点能够保证最优的树吗?
这是个问题,但是集成算法解决了这个问题
sklearn
表示,既然一棵树不能保证最优,那就建更 多的不同的树,然后从中取最好的。
怎样从一组数据集中建不同的树?
在每次分枝时,不从使用全部特征,而是随 机选取一部分特征,从中选取不纯度相关指标最优的作为分枝用的节点。
这样,每次生成的树也就不同了。
2.1.2 random_state & splitter
clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy",random_state=30)
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
score = clf.score(Xtest, Ytest) #返回预测的准确度
score
解释一下:这里的score会固定在0.925,不论你运行多少遍,它都不会变,因为每次都是选择的最优的树。
random_state
用来设置分枝中的随机模式的参数,默认
None
在高维度时随机性会表现更明显,低维度的数据 (比如鸢尾花数据集),随机性几乎不会显现。
对于鸢尾花数据集,输入任意整数,会一直长出同一棵树,让模型稳定下来。因为这个数据集属性太少,数据的质量也太高了。
这也就回答了为什么本文没选用鸢尾花数据集。
splitter
也是用来控制决策树中的随机选项的,有两种输入值
输入
”best"
,决策树在分枝时虽然随机,但是还是会 优先选择更重要的特征进行分枝(重要性可以通过属性feature_importances_
查看)
输入
“random"
,决策树在 分枝时会更加随机,树会因为含有更多的不必要信息而更深更大,并因这些不必要信息而降低对训练集的拟合。
这 也是防止过拟合的一种方式。当你预测到你的模型会过拟合,用这两个参数来帮助你降低树建成之后过拟合的可能 性。
当然,树一旦建成,我们依然是使用剪枝参数来防止过拟合。
我们来实验一下:
clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy",random_state=30 ,splitter="random")
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
score = clf.score(Xtest, Ytest)
score
解释一下:我们得到的分数是0.944
我们将图画出来看看
import graphviz
dot_data = tree.export_graphviz(clf,feature_names= feature_name,class_names=["琴酒","雪莉","贝尔摩德"],filled=True,rounded=True )
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
解释一下:怎么样,是不是我们得到的树更加大更加啊深呢!
2.1.3 剪枝参数
在不加限制的情况下,一棵决策树会生长到衡量不纯度的指标最优,或者没有更多的特征可用为止。
这样的决策树 往往会过拟合,这就是说,
它会在训练集上表现很好,在测试集上却表现糟糕
。
我们收集的样本数据不可能和整体 的状况完全一致,因此当一棵决策树对训练数据有了过于优秀的解释性
它找出的规则必然包含了训练样本中的噪 声,并使它对未知数据的拟合程度不足。
不相信?我们来看看 我们现在模型:
#我们的树对训练集的拟合程度如何?
score_train = clf.score(Xtrain, Ytrain)
score_train
解释一下:看看,是不是我们的模型对训练集效果太好了啊,这很容易造成过拟合。
那怎么来解决这个问题呢?
当我们养一盆植物的时候,当这个植物比较潦草的时候,我们怎么办呢?是不是要剪枝啊!
为了让决策树有更好的泛化性,我们要对决策树进行剪枝。
剪枝策略对决策树的影响巨大,正确的剪枝策略是优化 决策树算法的核心。
sklearn
为我们提供了不同的剪枝策略:
max_depth :
限制树的最大深度,超过设定深度的树枝全部剪掉 这是用得最广泛的剪枝参数,在高维度低样本量时非常有效。
决策树多生长一层,对样本量的需求会增加一倍,所 以限制树深度能够有效地限制过拟合。
在集成算法中也非常实用。实际使用时,建议从=3
开始尝试,看看拟合的效 果再决定是否增加设定深度。
min_samples_leaf & min_samples_split :
min_samples_leaf
限定,一个节点在分枝后的每个子节点都必须包含至少
min_samples_leaf
个训练样本,否则分 枝就不会发生
或者,分枝会朝着满足每个子节点都包含min_samples_leaf
个样本的方向去发生 一般搭配max_depth
使用
在回归树中有神奇的效果,可以让模型变得更加平滑。
这个参数的数量设置得太小会引 起过拟合,设置得太大就会阻止模型学习数据。
一般来说,建议从=5
开始使用。如果叶节点中含有的样本量变化很 大,建议输入浮点数作为样本量的百分比来使用。
同时,这个参数可以保证每个叶子的最小尺寸,可以在回归问题 中避免低方差,过拟合的叶子节点出现。对于类别不多的分类问题,取1
通常就是最佳选择。
min_samples_split
限定,一个节点必须要包含至少
min_samples_split
个训练样本,这个节点才允许被分枝,否则分枝就不会发生。
我们来看个例子吧:
clf=tree.DecisionTreeClassifier(criterion="entropy",random_state=30,splitter="random",max_depth=3,min_samples_leaf=5,min_samples_split=5)
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
dot_data = tree.export_graphviz(clf,feature_names= feature_name,class_names=["琴酒","雪莉","贝尔摩德"],filled=True,rounded=True)
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
解释一下:max_depth=3,min_samples_leaf=5,min_samples_split=5,观察上面的图,你会发现,深度不超过3,分支后的每个结点的samples都不少于5,每个被分的结点的samples都不低于5。
那么我们来看看效果怎么样
score = clf.score(Xtest, Ytest)
score
解释一下:树变得更简洁了,但是模型得分依旧不错。
max_features & min_impurity_decrease :
一般
max_depth
使用,用作树的
”
精修
“ max_features限制分枝时考虑的特征个数,超过限制个数的特征都会被舍弃。
和
max_depth
异曲同工, max_features是用来限制高维度数据的过拟合的剪枝参数
但其方法比较暴力,是直接限制可以使用的特征数量 而强行使决策树停下的参数
在不知道决策树中的各个特征的重要性的情况下,强行设定这个参数可能会导致模型学习不足。
如果希望通过降维的方式防止过拟合,建议使用PCA
,
ICA
或者特征选择模块中的降维算法。
min_impurity_decrease限制信息增益的大小,信息增益小于设定数值的分枝不会发生。
这是在
0.19
版本中更新的功能,在0.19
版本之前时使用
min_impurity_split
。
确认最优的剪枝参数:
那具体怎么来确定每个参数填写什么值呢?
这时候,我们就要使用确定超参数的曲线来进行判断了,继续使用我们 已经训练好的决策树模型clf
。
超参数的学习曲线,是一条以超参数的取值为横坐标,模型的度量指标为纵坐标的曲线,它是用来衡量不同超参数取值下模型的表现的线。
在我们建好的决策树里,我们的模型度量指标就是score
。
import matplotlib.pyplot as plt
test = []
for i in range(10):
clf = tree.DecisionTreeClassifier(max_depth=i+1,criterion="entropy",random_state=30,splitter="random")
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
score = clf.score(Xtest, Ytest)
test.append(score)
plt.plot(range(1,11),test,color="red",label="max_depth")
plt.legend()
plt.show()
解释一下:横坐标为max_depth取值,纵坐标为score,从图中我们可以看到,当max_depth取3的时候,模型得分最高。
那么,剪枝参数一定能够提升模型在测试集上的表现吗?
调参没有绝对的答案,一切都是看数据本身,嘿嘿
这么多参数,我们要一个个画学习曲线吗?那不累死了?
这个问题我会在后续的文章中回答。
无论如何,剪枝参数的默认值会让树无尽地生长
这些树在某些数据集上可能非常巨大,对内存的消耗也非常巨 大。
所以如果你手中的数据集非常巨大,你已经预测到无论如何你都是要剪枝的
那提前设定这些参数来控制树的 复杂性和大小会比较好。
2.1.4 目标权重参数
class_weight & min_weight_fraction_leaf:
完成样本标签平衡的参数。样本不平衡是指在一组数据集中,标签的一类天生占有很大的比例。
比如说,在银行要 判断“
一个办了信用卡的人是否会违约
”
,就是是
vs
否(
1%
:
99%
)的比例。
这种分类状况下,即便模型什么也不 做,全把结果预测成“
否
”
,正确率也能有
99%
。
因此我们要使用
class_weight
参数对样本标签进行一定的均衡,给少量的标签更多的权重,让模型更偏向少数类,向捕获少数类的方向建模。
该参数默认None
,此模式表示自动给与数据集中的所有标签相同的权重。
有了权重之后,样本量就不再是单纯地记录数目,而是受输入的权重影响了
因此这时候剪枝,就需要搭配
min_ weight_fraction_leaf这个基于权重的剪枝参数来使用。
另请注意,基于权重的剪枝参数(例如
min_weight_ fraction_leaf)将比不知道样本权重的标准(比如
min_samples_leaf
)更少偏向主导类。
如果样本是加权的,则使用基于权重的预修剪标准来更容易优化树结构,这确保叶节点至少包含样本权重的总和的一小部分。
2.2 重要属性和接口
属性是在模型训练之后,能够调用查看的模型的各种性质。
对决策树来说,最重要的是
feature_importances_
,能 够查看各个特征对模型的重要性。
sklearn
中许多算法的接口都是相似的,比如说我们之前已经用到的
fifit
和
score
,几乎对每个算法都可以使用。
除了这两个接口之外,决策树最常用的接口还有apply
和
predict
。
apply
中输入测试集返回每个测试样本所在的叶子节 点的索引,predict
输入测试集返回每个测试样本的标签。
返回的内容一目了然并且非常容易,大家感兴趣可以自己 下去试试看。
在这里不得不提的是,
所有接口中要求输入X_train和X_test的部分,输入的特征矩阵必须至少是一个二维矩阵。 sklearn不接受任何一维矩阵作为特征矩阵被输入
。
如果你的数据的确只有一个特征,那必须用
reshape(-1,1)
来给 矩阵增维;
如果你的数据只有一个特征和一个样本,使用reshape(1,-1)
来给你的数据增维。
#apply返回每个测试样本所在的叶子节点的索引
clf.apply(Xtest)
解释一下:我们拿到了每个样本所在的叶子节点的索引
#predict返回每个测试样本的分类/回归结果
clf.predict(Xtest)
解释一下:我们拿到了每个样本的分类结果。
至此,我们已经学完了分类树
DecisionTreeClassififier
和用决策树绘图(
export_graphviz
)的所有基础。
我们讲解了决策树的基本流程,分类树的八个参数,一个属性,四个接口,以及绘图所用的代码。
八个参数:
Criterion
,两个随机性相关的参数(
random_state
,
splitter
),五个剪枝参数(
max_depth, min_samples_split,
min_samples_leaf
,
max_feature
,
min_impurity_decrease
)
一个属性:
feature_importances_
四个接口:
fifit
,
score
,
apply
,
predict
接下来,在不断的实验中,在各种数据集上进行实战,一定会变得更加熟练!
本文参考教程:菜菜的sk-learn课程
如有写的不合适,亦或是不精确的地方,望读者多包涵
如果大家对上述内容有任何不理解的地方,可以留言,和毛同学共同讨论,一起进步!
整理于2020年12月1日