【单细胞转录组】人类T细胞亚群分析Marker基因汇总

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文献:Global characterization of T cells in non-small-cell lung cancer by single-cell sequencing

T 细胞(全部):CD3+

Naive T cell:

CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK

Tef(效应T细胞):
  1. 辅助T细胞(Helper T):CD3+CD4+CD8-T细胞

    • Th1: CD3+CD4+CD30-, IL-12R, CXCR3, T-bet, STAT4, STAT1,IFNγ, IL-2,, IL-18、—
    • Th2:CD3+CD4+CD30+, CCR4,IL-2, IL-4
    • Th9: CD3, CD4, PU.1, IL-9, IL-10
    • Th17: CD3, CD4, IL23-R, CCR6, IL-1R, CD161, STAT3
    • Th22: CD3, CD4, CCR10
    • Tfh: CD3, CD4, CCR5, SLAM, OX40L, CD40L(CD154), ICOS, IL-21R, PD1, STAT3, IL-21
  2. Treg(调节T细胞):CD4+CD25+Foxp3+ ,CD127+, CD152+,TGFβ, IL-10, IL-12, STAT5+ (ps:只通过CD4+CD25+双阳性来定义的Treg细胞并不完全准确)

    • TR1(IL-10):CD3, CD4
    • Natural Treg: CD3,CD4, CD25, CTLA4, GITR, FOXP3, STAT5, FOXO1, FOXO3, IL-35, IL-10
    • Inducible Treg: CD3,CD4, CD25, CTLA4, GITR, FOXP3, STAT5, FOXO1, FOXO3, SMAD2, SMAD3, SMAD4, IL-10
  3. 细胞毒性T细胞 Cytotoxic T(杀伤性T细胞):CD3+CD4-CD8+T细胞

    • Tc1(IFN-γ):CD3+CD8+CD30-
    • Tc2(IL-4、IL-5、IL-10):CD3+CD8+CD30-
  4. Tex(耗竭T细胞Exhausted T):CD3+,CD8+,PD1, TIM3, 1B11, LAG3, BLIMP1

  5. 无能/失能T(Anergic T):CD3, BTLA, GRAIL, CBL-B, ITCH, NEDD4

  6. 记忆T(Memory T):

    • 中央记忆T: CD3, CCR7+, CD44, CD62L+, CD3, IL-7R(CD127), IL-15R, MBD2
    • 效应记忆T: CD3, CCR7-, CD62L-, CD44, IL-7R(CD127), IL-15R, BLIMP1
  7. NKT: SLAMF1, SLAMF6, TGFBR, VA24, JA18

  8. γδ T:CD3,IFNγ, IL-17A, IL-17F, IL-22

  9. CD8αα T :CD3,CD8αα, B220,IL-10, TGFβ

  • 另外根据S100A4、CCR7、IL32和ISG15,明确分离3个CD4 T细胞群体(幼稚型、记忆型、ifn激活型)

肿瘤中的浸润CD8 T细胞

细胞毒性T细胞 Cytotoxic T(杀伤性T细胞)、Tex(耗竭T细胞Exhausted T)

若有遗漏和错漏之处,烦请大家纠正~

参考文章

  • 【流式中文网】通过16个表面标记区分各类辅助T细胞、常见细胞毒T细胞功能亚群和MAIT细胞
  • 【知乎】一文读懂T细胞都有那些分类
  • T 细胞免疫分型
  • 【基因慧】独家专访中国学者《Nature》子刊发布最大规模肺癌T细胞单细胞免疫图谱
  • Different Subsets of T Cells, Memory, Effector Functions, and CAR-T Immunotherapy
  • 【abcam】T cells: the usual subsets
  • The broadest portfolio for your T cell research

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