Q20与Q30是什么

在分析高通量测序数据的时候，我们会对Q20/Q30不陌生。那么Q20/Q30是什么意思呢？又是怎么来的呢？

Q20，Q30它们代表的是某一碱基质量值占全部碱基数的百分比，就类似于产品合格率，不同的质量标准会产生不同的合格率，标准越高，质量越好，达标的就越少；合格率越高，那么达标的数据就越多。一般而言，当Q30＞85%的时候，就说明数据质量合格。还有一个是GC含量，一般在50%——60%之间。

一个给定碱基的测序质量分值Q定义为下面的等式：

Q = -10log10(e)

其中，e为预计碱基检出不正确的概率。

Q分值较高表示出错的概率较小。

Q分值较低可能会导致相当大一部分的片段不可用，还可能导致假阳性的变异检出增加，以致得出不准确的结论。

测量分值与碱基检出精度的关系如下：

表1

好吧，这一期我们就先讲到这，下期再见。