Tophat2 error

RNA-seq 数据检测融合基因,在 tophat-fusion 这一步报错:

./SeqAn-1.4.2/seqan/basic/basic_exception.h:236 FAILED! (Uncaught exception of type St12out_of_range: basic_string::substr)
第一次运行的是 tophat 报这个错,然后换用 tophat2 重新运行,还是报这个错。

google 之后发现 biostar 有人给出了解决办法,很简单,用tophat2.1.0这个版本就好了!我检查了一下自己的 tophat2 是 2.1.1 的,重新下载 tophat2.1.0 然后安装重跑,浪费了我半天时间的 bug 就解决了。

为什么 tophat1 和 tophat2.1.1 都在这里出问题,而唯独 tophat2.1.0 顺利跑完了……

作者:wangpeng905
链接:https://www.jianshu.com/p/5f6bfcfb5d8a
來源:
著作权归作者所有,任何形式的转载都请联系作者获得授权并注明出处。

你可能感兴趣的:(Tophat2 error)