长白猪和梅花猪结肠内微生物及微生物代谢差异研究

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文章简介

微生物组的热度已经持续几年了，目前热度依旧不减，感觉肠道微生物是一个可以影响机体任何地方的东西，有人称它为第二大脑，有关它的研究也是出了不少CNS，好了，不再感慨了，反正也不是小编发的，哈哈~~~本次小编介绍的文章题名为“长白猪和梅花猪结肠内微生物及微生物代谢差异研究”。

背景

长白猪是引进的外国猪种，是瘦肉型猪种，梅花猪是中国本地猪，具有脂肪沉积多等特点，作者估计也就想探究肠道微生物对脂肪沉积的影响吧。

试验动物

以7头长白断奶猪和7头梅花断奶猪为试验对象，在相同的情况下饲喂30天，然后屠宰，收集结肠内容物进行16S测序和代谢物的广筛和后期的靶向筛选，收集结肠粘膜进行PCR定量分析。

试验设计

试验设计

结果

• 代谢组数据的PCA和OPLS-DA分析；发现相同品种的代谢物数据聚到一起，说明不同品种的样本重复性较好；非靶向代谢物筛选鉴定了401种差异代谢物，在MS/MS 数据库注释到71种具体的代谢物。

  
  
  

  样品聚类及差异代谢物筛选

• 代谢物注释；注释到了7个版块，其主要有氨基酸、脂肪酸代谢等途径，部分注释结果解释：
  

  代谢物富集分析

• 发现短链脂肪酸、胆汁酸在两个品种中差异较大，对丰度差异较大代谢物靶向代谢分析，发现长白猪结肠中短链脂肪酸和次级胆汁酸含量显著高于梅花猪，而梅花猪种初级胆汁酸含量高于长白猪。且如预期一样，长白猪平均日增重高于梅花猪。

  
  
  

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• 并对肠道粘膜中的短链脂肪酸转运蛋白基因以及受体基因就行差异分析

  
  
  

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• 最后对微生物进行差异分析以及代谢组和微生物组的关联分析：

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链球菌、CF231、布氏菌、衣原体和奈瑟菌与胆汁酸、短链脂肪酸和脂类代谢物为正相关关系，类杆菌、霍尔德曼氏菌属和YRC22与胆汁酸、短链脂肪酸和脂类代谢物为正相关为负相关关系。

小结

主要是比较了两个品种猪的结肠微生物以及代谢物差异，以及关键代谢物与宿主基因的表达的关系，肠道微生物差异可能与两个猪的脂肪沉积有关。