夏大希
夏大希

2021-01-05重测序数据call SNP 流程

bwa+samtools+picardtools+GATK call SNP 流程
如何利用重测序进行SNP分析？
用GATK进行二代测序数据 SNP Calling 流程：（二）bwa比对和HaplotypeCaller 变异检测
变异分析
GATK官网
GATK流程
如何下载生物数据（三）：GATK数据下载
shell脚本实现基因重测序和变异位点检测（附源代码）
重测序分析（附PCA与发育树构建）
从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第3节 数据质控
从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第1节 测序技术
从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第2节 FASTA和FASTQ
从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第3节 数据质控
从零开始完整学习全基因组测序数据分析: Trimmomatic、SOAPnuke、sickle和seqtk的比较

从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第4节构建WGS主流程
从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第5节 理解并操作BAM文件
如何使用Pysam处理BAM

GATK4.0和全基因组数据分析实践（上）
GATK4.0和全基因组数据分析实践（下）
GATK4全基因组数据分析最佳实践 ，我以这篇文章为标志，终结当前WGS系列数据分析的流程主体问题 | 完全代码

GATK4 流程分析- 从fastq到vcf
基因组重测序SNP_calling

全基因组重测序数据分析
全基因组测序数据获取后应该怎么分析？
入门篇

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按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他