在afni, suma和freesurfer中自定义colorbar

在写文章的过程中大脑的激活图，ROI的颜色等需要和文章的整体风格以及数据展示的颜色相匹配，这时候需要使用自定义的color。

由于最近使用到了suma，所以这里根据以suma为例，展示如何自定义colorbar。在suma中使用自定义的colorbar，用到的是afni命令生成的cmaps文件，步骤如下：

afni的命令：MakeColorMap

根据命令行的步骤：

1. 写一个color的txt文件，如blueRed.txt：

#integer label String Label      R G B A

0                    Small_Face        0  0  1  1

1                    red                      1  0  0   1

inter label用0开始的整数表示，整个color bar需要等分成多少种颜色，就设置多少个数值；

RGB的颜色可以是0-1，也可以是0-255，A的值不用管，可能是透明度之类的；

注意：这里很容易出错的是，inter label的值需要从0开始，如果从1开始，那最下面的color就是空白；

2. 执行afni的命令：

MakeColorMap -usercolutfile blueRed.txt -suma_cmap blueRed

执行结果会在当前目录下生成cmaps文件：blueRed.niml.cmap

3. 打开suma根据需要导入自定义的cmaps文件：

cmaps