又是一只小菜鸟
又是一只小菜鸟

eQTL

归纳几篇eQTL相关文章。

1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html

首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL就是控制数量性状表达位点，即能控制数量性状基因（如身高基因）表达水平高低的那些基因的位点。

数量性状基因座：控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行定位，与连续变化的数量性状表型有密切关系

表达数量性状基因座（expression Quantitative Trait Loci,eQTL）是对上述概念的进一步深化，它指的是染色体上一些能特定调控mRNA和蛋白质表达水平的区域，其mRNA/蛋白质的表达水平量与数量性状成比例关系。eQTL可分为顺式作用eQTL和反式作用eQTL，顺式作用eQTL就是某个基因的eQTL定位到该基因所在的基因组区域，表明可能是该基因本身的差别引起的mRNA水平变化；反式作用eQTL是指某个基因的eQTL定位到其他基因组区域，表明其他基因的差别控制该基因mRNA水平的差异。

eQTL就是把基因表达作为一种性状,研究遗传突变与基因表达的相关性: 就好像研究遗传突变与身高的相关性一样

早年可以通过同时做一个个体的SNP芯片和cDNA芯片, 在全基因组尺度研究突变与表达的相关性, 这种研究需要较多个体(例如1000个); 现在随着深度测序的出现,很多人开始用RNA-Seq在较少量个体中研究allele-specific expression,本质上就是eQTL.

简单地说, 遗传学研究经常发现一些致病或易感突变, 这些突变怎样导致表型有时候不太直观; 所以用某个基因的差异表达作为过渡: 突变A-->B基因表达变化-->表型;

GTEx的前世今生

转自https://baijiahao.baidu.com/sid=1582163111276275189&wfr=spider&for=pc

然而，事情却没有那么简单，从基因的改变到疾病等现象的出现，中间缺失了重要的一环，那就是基因的表达。也许在测序中，我们可以看到某一个基因上某一个位置的变化（比如说SNP单核苷酸变化），但是这种变化并不一定会影响mRNA的产生或者蛋白的改变。也就有可能不会影响到疾病或其他生物学过程。于是科学家想到了另一个指标——mRNA的序列数据。因为只有被表转译到mRNA上的基因，才可能进一步表达为蛋白（图1）。

eQTL_第1张图片

图1：eQTL是沟通基因改变与疾病的桥梁

但是要怎么搞清DNA改变是怎么影响mRNA的出现呢？这一过程被称为Expression quantitative trait loci（eQTL） 分析，目的在于得到单个DNA突变与单个基因表达量之间的相关性。与单个基因mRNA表达量相关的DNA突变，就被称为eQTL。

简单来讲，（并不简单，小编注）我们首先通过全基因组测序获得每个个体的DNA全序，然后以同种族的其他个体作为参照，标记出该个体所有的DNA变异位点， 称为SNP位点。同时，我们通过全基因组mRNA表达量测序得到该个体的特定组织样本中的基因表达量。以全部DNA变异位点为自变量，轮流以每种mRNA表达量为因变量，用大量的个体数据做样本进行线性回归，就可以得到每一个SNP位点和每一个mRNA表达量之间的关系。

GTEx是第一个收集了多个人体器官mRNA测序的数据库，并提供了跨器官的eQTL研究平台。

当前使用的GTEx v6p版本的原始数据来自于449名生前健康的遗体捐献者的44个不同的器官。图2是不同器官里面样本数的直观展示。由这个图可以看出，这一数据库中涉及的数据覆盖面非常广，数据量大，具有重要的应用潜力。

eQTL_第2张图片

图2：GTEx 样品取材来源图示。灰色字体为 cis-eQTL 数／trans-eQTL数 （样本

3.GTEx如何一天发四篇Nature

GTEx 为挖掘器官特异的基因组数据提供了一个非常好的平台。这是目前唯一一个可以提供这些内容的数据库工具。有了这些，科学家就可以尝试回答很多问题：比如基因相互作用的网络在不同器官里会有怎么样不同的表现？不同组织中基因突变对于基因表达有哪些影响？特定染色体在不同的器官中作用有哪些？等等。也就有了其他的三篇文章。

这充分展现了该平台的强大威力！

4.核心作者专访

生息提问1：我们知道，对于大数据的分析而言，数据的质量控制与分析是非常重要的，能否详细的介绍一下你们的数据质量控制与分析过程和原理？

答：有很多文章提出，在不同的测序环境下得到的不同样本的数据存在batch effect。已知的batch effect包括测序的批次，样本的性别、年龄、祖先，以及gene的GC content等。这些因素可能同时对SNP genotype 以及gene mRNA 表达量造成影响，也就是confounder。我们不希望得到的eQTL是由于祖先的不同，或者由于性别差异，所以这些因素都被作为confounder从mRNA 表达量中通过线性回归去除。然而我们还是无法得知所有batch effect，由于我们的目的是寻找对单个基因有影响的突变，一个简单的想法是去除对mRNA 表达有广泛影响的因素， 也就是回归去除主成分。PEER就是一个可以直接用mRNA数据估计广泛因子并去除的工具。这个步骤看似简单，其实是整个分析过程中至关重要的一步，因为这个步骤直接决定了mRNA校正后的表达量。

得到校正后的数据之后，就可以对所有基因的mRNA表达量和全基因组测序得到的SNP genotype进行线性回归，即eQTL 分析。在基因组数据分析中，存在一个普遍的问题，就是基因／DNA变异的数量是样本数量的几百甚至几万倍，而同时进行的回归分析的次数就更是远超样本数量，很容易出现假阳性结果，因此我们需要对系数的p值做Bonferroni校正或者BH校正来消除多重检验的影响。

根据SNP位点（即单个DNA突变的位点）到gene的距离，eQTL 可以分为两类：cis-eQTL 和 trans-eQTL。cis-eQTL是指近距离相关的eQTL, trans-eQTL则是包括了远距离相关的eQTL。这两类eQTL对应 cis-regulation以及 trans-regulation。由于trans-eQTL的计算涉及到更大量的多重检验，因此我们采取了更严格的数据质量控制。

生息提问2：GTEx 数据是如何被用于器官特异性分析的？

答：数据收集完成后，考虑到不同器官样本里面存在重复的个体，研究人员做了meta-analysis来去除重复个体的影响，在此基础上进行了聚类分析。原文中的图2展示了用cis-eQTL 和 trans-eQTL做聚类分析的结果。可以清楚地看到，相近的器官在聚类结果中更接近。同时，cis-eQTL 比 trans-eQTL提供了更明显的分类。

一个很自然的问题就是：在不同器官里的 eQTL 有什么不同的性质？是什么因素导致一部分eQTL只存在于某些器官，而另一些则在大多数器官中存在？研究人员标记了SNP所在区域的生物学功能（promoter/enhancer/cis regulatory region），并比较了相对应器官的富集性以及不对应器官的富集性，论文中图3a，3b展示了cis-eQTL 在对应器官里更有可能在CRE中富集，图3e 则更为直接地表现了不同功能性序列的eQTL 相关性强度。

生息提问3：从找到DNA变异与mRNA表达的关联，到真正理解产生这些关联的背后机制，这中间还有多远？

答：eQTL 分析是单个SNP和单个基因表达的相关性分析，和GWAS相似，得到的结果可以为机制研究提供思路和方向。假设我们对某个基因感兴趣，想知道是什么DNA序列调控了这个基因的表达，我们可以去eQTL的list中搜索和这个基因有显著相关性的DNA序列。但是这些序列并不是直接导致基因表达变化的，主要由于两个原因：1. 染色体上靠的比较近的序列一般会同时被一代一代传下去，因此这块区域里的SNP都有固定的排列，这块区域被称为LD block。在一个LD block里面，验测出相关性的SNP可能与真正有因果性的SNP有很强的相关性，但是由于多重检验，真正有因果性的SNP可能并没有得到显著结果。2. 存在相关性并不等于直接相关，由于eQTL分析是单个基因只对单个SNP做线性回归，并没有控制其他SNP的序列，也就是说，可能这个相关性来自于另一个和基因以及这个SNP都相关的SNP。

这时候就需要其他的额外信息来帮助我们判断，哪些SNP更可能是有因果性的那个。有许多研究致力于结合其他的基因组信息，使用监督性学习或无监督学习，从存在相关性的一组SNP里面来识别真正有因果性的那个。当然，最后的因果性确认还需要严谨的生物实验来证明。

2.https://mp.weixin.qq.com/s/X6oiHtKBMBPFqncgL3Enxw

本篇给出了eQTL概况，以及三个关于eQTL的数据库，分别为Braineac,GTEx,Blood eQTL Browser


eQTL_第3张图片

Braineac(The Brain eQTLAlmanac)由UK Brain Expression Consortium创建，他们采集134名欧洲捐献者的多个脑区的基因型与基因表达量，进行eQTL分析，建立该数据库。

http://www.braineac.org/

GTEx(The Genotype TissueExpression Project)到目前为止共收集了544名捐献者全身各个组织的基因型与基因的表达量，利用GTEx可以研究各个组织中的eQTL。

https://www.gtexportal.org/home/

Blood eQTL Browser收集了来自七个中心的共5311名被试的血液组织中的基因型及基因表达量，进行(eQTL) meta分析，并在另外的四个中心的2775被试中重复验证，他们的研究与前两个数据库相比，发现了大量的trans-eQTL。

http://genenetwork.nl/bloodeqtlbrowser/

3.又找到eQTL利用软件出结果的流程的推文，我就是资料整合专家

https://mp.weixin.qq.com/s/FaNhRYSyjLlC1hMnZJkvdA

https://mp.weixin.qq.com/s/83axhA3GgZjw4trmwhMyYw

https://www.jianshu.com/p/6e6d54d7483e

https://mp.weixin.qq.com/s/X6oiHtKBMBPFqncgL3Enxw

第三个好棒，写的超全面，也有链接到其官网数据。

4.可做的各种结合分析：

eQTL_第4张图片

你可能感兴趣的:(eQTL)

  • 使用OSCA进行eQTL分析 只看不写_nathan
    Nathan写于20200807。OSCA（OmicS-data-basedComplextraitAnalysis）是杨老师2019年发表的用于分析多组学数据复杂性状的软件。OSCA发表文献OSCA主要可以做以下几个事情：计算表观标记(或者基因表达)数据个体之间的表观组（转录组）的亲缘关系基于混合线性模型的方法检测DNA甲基化（或者基因表达）标记与复杂性状之间的关联(使用MOA和MOMENT方法
  • 2020-05-04 eigenMT 程凉皮儿
    eigenMT：解释变异间连锁不平衡的eQTL研究的有效多重检验调整简介特征最小二乘法是顺式eQTL研究中一种计算效率较高的多重检验校正方法。通常，现代顺式eQTL研究可以正确地使用排列对单个基因进行跨越数千个变异位点的多重测试。这种校正方法虽然准确，但对于大规模队列测序/大样本测序，需要数天到数周的高计算成本。与其相比，我们的方法减少了数量级的计算负担，同时保持了较高的精度。为了做到这一点，我们
  • 2022-02-13 图灵基因
    NatureGenetics|多变量eQTL方法发现精神疾病潜在机制原创风不止步图灵基因2022-02-1307:03收录于话题#前沿分子生物学技术撰文：风不止步IF=38.33推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：文章综合分析确定候选因果变体，并阐明精神分裂症、双相情感障碍和阿尔茨海默病基础基因的潜在调节机制。2022年1月20日，西奈山伊坎医学院的PanosRoussos博士等人在《Naturegeneti
  • 不会做QTL分析，也能轻松找sQTL、eQTL、meQTL | 癌症研究数据库推荐 尐尐呅
    单核苷酸多态性（SNPs）是人类最常见的遗传变异，是研究疾病遗传基础的宝贵资源。在相关疾病研究中，常常涉及将基因表达的变异与基因型联系起来的表达数量性状位点（eQTL）分析；与表观调控相关的DNA甲基化数量性状位点（meQTL）分析；影响剪接调控的剪接数量性状位点（sQTLs）分析。科研萌新不会做QTL分析，如何找eQTL、meQTL、sQTL？给大家推荐3个非常好用的癌症研究数据库套装：Panc
  • post-GWAS：使用coloc进行共定位分析(Colocalization) 橙子牛奶糖 GWAS
    GWAS找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点如何影响表型。常见的一个解释方法是共定位分析。主流的共定位分析包括：1）GWAS和eQTL共定位；2）GWAS和sQTL共定位；3）GWAS和meQTL共定位；4）GWAS和pQTL共定位；其中，GWAS和eQTL共定位应用最为广泛。具体来说，当检测到GWAS信号和eQTL共定位时，我们会认为GWAS信号上的位点可能通过改变基因表达的生物学过程影响表
  • 本周最新文献速递20210613 橙子牛奶糖
    本周最新文献速递20210613文献一文献题目：Leveragingsupervisedlearningforfunctionallyinformedfine-mappingofcis-eQTLsidentifiesanadditional20,913putativecausaleQTLs不想看英文题目：利用监督学习对顺式eQTL进行功能性精细定位，鉴定了额外的20,913个因果eQTL杂志和影响
  • 本周最新文献速递20220123 橙子牛奶糖
    本周最新文献速递20220123一、精细解读文献一文献题目：Multi-ancestryeQTLmeta-analysisofhumanbrainidentifiescandidatecausalvariantsforbrain-relatedtraits不想看英文题目：人脑的多血统eQTL荟萃分析确定了大脑相关性状的候选因果变异位点杂志和影响因子：NatGenet(IF:38.33;Q1)研究意
  • Matrix eQTL分析 杨博士聊生信
    目前针对QTL分析有很多软件，比如Plink、Merlin、R/qtl、FastMap等等,今天给大家分享一下如何使用MatrixeQTL进行分析。首先我们先了解一下什么是eQTL以及eQTL的分类。表达数量性状基因座（expressionQuantitativeTraitLoci,eQTL）：指染色体上一些能特定调控mRNA和蛋白质表达水平的区域，其mRNA/蛋白质的表达水平量与数量性状成比例关
  • 2022-05-10 图灵基因
    Science背靠背|单细胞eQTL作图解析自身免疫性疾病原创图灵基因图灵基因2022-05-1009:27收录于合集#前沿生物大数据分析在细胞水平上，遗传变异在自身免疫中所起的作用尚不清楚。这在一定程度上是由于缺乏大量的单细胞表达数据。获取这些数据在人数和每个人的细胞数量方面面临着挑战。现在，两个研究小组对免疫细胞进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq），并将数据与自身免疫疾病相关基因变异的
  • 本周最新文献速递2021-03-21 橙子牛奶糖
    本周最新文献速递一文献题目：Whole-organismeQTLmappingatcellularresolutionwithsingle-cellsequencing不想看英文题目：使用单细胞测序数据定位细胞类型eQTL杂志和影响因子：Elife（7.081区）研究意义：表达数量性状基因座（eQTL）具有细胞类型特异性，其效应在不同细胞类型有所差异。哺乳动物组织的复杂性使得细胞类型eQTL的研究
  • 生信笔记5-GWAS与eQTL 江湾青年
    引言GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段，彼此之间存在很多的区别与联系。GWAS全基因组关联分析（GenomeWideAssociationStudy，GWAS）是指在全基因组层面上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，是通过对大规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记（如SNP或CNV等）分型，进而将基因型与可观测的性状，即表型，进行群体水平的统计学分
  • 利用10X单细胞eQTL定位确定自身免疫性疾病的细胞类型特异性基因控制 Evil_Genius
    周二了，新的一周，虽然内心一直想躺平，一直想回家，但是最终还是屈服，坐起来好好工作，不知道30岁一事无成算不算就是失败的人生，人是不是总是在矛盾中前进，也不知道前面有什么，或许更差，或许有机遇。今天要分享一个新的内容，文章在Single-celleQTLmappingidentifiescelltype–specificgeneticcontrolofautoimmunedisease,2022年
  • 10X单细胞联合eQTL信息揭示细胞类型特异性分子和遗传与lupus的关联 单细胞空间交响乐
    hello，大家好，又是新的一周，上海的疫情仍然居高不下，太原也开始封城，不知道什么时候才是尽头。时间很快，猝不及防，我们还是好好学习，不负韶华。今天我们继续分享一下单细胞和eQTL的联合分析，上一篇关于这个的联合分析在利用10X单细胞eQTL定位确定自身免疫性疾病的细胞类型特异性基因控制，这一篇要分享单细胞联合eQTL揭示细胞类型特异性分子和遗传与lupus的关联，文章在Single-cellR
  • 多组学联合分析-Matrix eQTL Richard_Zhou
    找到MatrixeQTL这个包，看下文章MatrixeQTL:ultrafasteQTLanalysisvialargematrixoperations（https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts163）eQTL（表达数量性状位点）计算transcript-SNP的关系，即分析SNP与基因的表达是否相关。由于计算数量巨大，很多人都用较小的数据来做。因此该作
  • eQTL 又是一只小菜鸟
    归纳几篇eQTL相关文章。1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL就是控制数量性状表达位点，即能控制数量性状基因（如身高基因）表达水平高低的那些基因的位点。数量性状基因座：控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用D
  • SCAN | 查看基因的eQTL及SNP是哪些基因的eQTL fatlady
    简介该数据库包含针对SNP（人类）的两类注释内容：基于位置关系，给出该SNP位于基因哪个区域（如intronic,intergeni,etc）。如果该SNP与某基因的变异之间存在LD，则该位于intergenic的SNP也会被注释到该基因。MD：已报道的多个SNP位点之间的LD，利用TUNA计算，数据来自HapMap。功能注释：该SNP是否影响基因表达（i.eeQTLs）eQTL：SNP与表达量直
  • 群体遗传分析方法：LD,FST,eQTL wo_monic
    LD(连锁不平衡):计算使用plink,FST(遗传分化指数):计算使用vcftools,可视化分为箱线图和散点图，单组比较使用在染色体上的散点图，多组比较使用箱线图。FST的原理，计算方法，可视化的方法https://www.jianshu.com/p/bb0beec0ed63haploPS和XP-EHH平均测序深度：等位基因频率：vcftools使用说明：1.https://www.dazhu
  • 2020-04-28 eMAGMA 基于基因的关联分析（准备工作） 程凉皮儿
    本教程是手把手教你如何使用eMAGMA的指南，eMAGMA是一种通过将SNP分配给组织特异性eGenes来进行eQTL基因测试的方法，如Gerringetal.,2019a,Gerringetal.,2019b所述。在这里，我们提供了使用eMAGMA方法的脚本和文件，该方法使用全基因组汇总统计数据生成与疾病相关的eGenes列表。在本教程中，我们将展示如何使用GWAS关于严重抑郁障碍(MDD)的汇
  • 生信随手记2020-02-10：awk命令字符串操作 猫叽先森
    复现lncRNA文献时，作者使用了一个叫做AnimalQTL的数据库。TheAnimalQuantitativeTraitLoci(QTL)Database(AnimalQTLdb)strivestocollectallpubliclyavailabletraitmappingdata,i.e.QTL(phenotype/expression,eQTL),candidategeneandassoc
  • MirSNP:miRNA相关SNP位点数据库 生信修炼手册
    欢迎关注”生信修炼手册”!在SNP研究领域，通过GWAS或者eQTL等手段，发现了大量与疾病或者某种复杂性状相关的SNP位点，而这些SNP的具体功能还需要进一步分析和挖掘。有科学家发现，SNP位点可以通过影响miRNA,从而引起疾病的发生与发展，所以研究miRNA相关的SNP位点是非常有意义的。MirSNP数据库就是一个存储了miRNA相关SNP位点的数据库，网址如下http://bioinfo.
  • 文献解读--通过RNA测序解析玉米籽粒复杂的调控网络 正踪大米饭儿
    1.文章概述本篇要解读的文献是一篇发表较早，却比较经典的文章。是2013发表于NatureCommunication上的一篇eQTL的文章。文章截图玉米基因组非常复杂，其重复性序列高达85%。作者通过对368份玉米多样性材料授粉后15天的籽粒进行RNA测序分析，获得了28769个基因的表达量，这些基因数约占玉米注释基因的60%，同时还获得了360万来自基因内的SNP标记。该项研究把基因表达量作为表
  • eQTL qt
    首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL就是控制数量性状表达位点，即能控制数量性状基因（如身高基因）表达水平高低的那些基因的位点。   数量性状基因座：控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行定位，与连续变化的数量性状表型有密切关系 表达数量性状基因座（expressi
  • 解决R速度太慢问题 Forever_YCC
    R的速度慢一直被人诟病，最近做一个比较大的dataset的分析，跑得实在太慢，发现症结是R的dataframe的index太慢：以下为测试：gene_list=1:100000 eQTL_mat=matrix(nrow=length(gene_list),ncol=7)#创建一个matrix eQTL_df=as.data.frame(matrix(nrow=length(gene_list)
  • github中多个平台共存 jackyrong github
    在个人电脑上，如何分别链接比如oschina,github等库呢，一般教程之列的，默认 ssh链接一个托管的而已，下面讲解如何放两个文件 1） 设置用户名和邮件地址 $ git config --global user.name "xx" $ git config --global user.email "[email protected]"
  • ip地址与整数的相互转换(javascript) alxw4616 JavaScript
    //IP转成整型 function ip2int(ip){ var num = 0; ip = ip.split("."); num = Number(ip[0]) * 256 * 256 * 256 + Number(ip[1]) * 256 * 256 + Number(ip[2]) * 256 + Number(ip[3]); n
  • 读书笔记-jquey+数据库+css chengxuyuancsdn htmljqueryoracle
    1、grouping ,group by rollup, GROUP BY GROUPING SETS区别 2、$("#totalTable tbody>tr td:nth-child(" + i + ")").css({"width":tdWidth, "margin":"0px", &q
  • javaSE javaEE javaME == API下载 Array_06 java
    oracle下载各种API文档： http://www.oracle.com/technetwork/java/embedded/javame/embed-me/documentation/javame-embedded-apis-2181154.html JavaSE文档： http://docs.oracle.com/javase/8/docs/api/ JavaEE文档： ht
  • shiro入门学习 cugfy javaWeb框架
    声明本文只适合初学者，本人也是刚接触而已，经过一段时间的研究小有收获，特来分享下希望和大家互相交流学习。 首先配置我们的web.xml代码如下，固定格式，记死就成 <filter>         <filter-name>shiroFilter</filter-name> &nbs
  • Array添加删除方法 357029540 js
         刚才做项目前台删除数组的固定下标值时，删除得不是很完整，所以在网上查了下，发现一个不错的方法，也提供给需要的同学。 //给数组添加删除             Array.prototype.del = function(n){
  • navigation bar 更改颜色 张亚雄 IO
    今天郁闷了一下午，就因为objective-c默认语言是英文，我写的中文全是一些乱七八糟的样子，到不是乱码，但是，前两个自字是粗体，后两个字正常体，这可郁闷死我了，问了问大牛，人家告诉我说更改一下字体就好啦，比如改成黑体，哇塞，茅塞顿开。       翻书看，发现，书上有介绍怎么更改表格中文字字体的，代码如下    
  • unicode转换成中文 adminjun unicode编码转换
      在Java程序中总会出现\u6b22\u8fce\u63d0\u4ea4\u5fae\u535a\u641c\u7d22\u4f7f\u7528\u53cd\u9988\uff0c\u8bf7\u76f4\u63a5这个的字符，这是unicode编码，使用时有时候不会自动转换成中文就需要自己转换了使用下面的方法转换一下即可。 /** * unicode 转换成 中文
  • 一站式 Java Web 框架 firefly aijuans Java Web
    Firefly是一个高性能一站式Web框架。 涵盖了web开发的主要技术栈。 包含Template engine、IOC、MVC framework、HTTP Server、Common tools、Log、Json parser等模块。 firefly-2.0_07修复了模版压缩对javascript单行注释的影响，并新增了自定义错误页面功能。 更新日志： 增加自定义系统错误页面功能
  • 设计模式——单例模式 ayaoxinchao 设计模式
    定义          Java中单例模式定义：“一个类有且仅有一个实例，并且自行实例化向整个系统提供。”   分析          从定义中可以看出单例的要点有三个：一是某个类只能有一个实例；二是必须自行创建这个实例；三是必须自行向系统提供这个实例。   &nb
  • Javascript 多浏览器兼容性问题及解决方案 BigBird2012 JavaScript
    不论是网站应用还是学习js,大家很注重ie与firefox等浏览器的兼容性问题，毕竟这两中浏览器是占了绝大多数。 一、document.formName.item(”itemName”) 问题 问题说明：IE下，可以使用 document.formName.item(”itemName”) 或 document.formName.elements ["elementName&quo
  • JUnit-4.11使用报java.lang.NoClassDefFoundError: org/hamcrest/SelfDescribing错误 bijian1013 junit4.11单元测试
            下载了最新的JUnit版本，是4.11，结果尝试使用发现总是报java.lang.NoClassDefFoundError: org/hamcrest/SelfDescribing这样的错误，上网查了一下，一般的解决方案是，换一个低一点的版本就好了。还有人说，是缺少hamcrest的包。去官网看了一下，如下发现：    
  • [Zookeeper学习笔记之二]Zookeeper部署脚本 bit1129 zookeeper
    Zookeeper伪分布式安装脚本(此脚本在一台机器上创建Zookeeper三个进程，即创建具有三个节点的Zookeeper集群。这个脚本和zookeeper的tar包放在同一个目录下，脚本中指定的名字是zookeeper的3.4.6版本，需要根据实际情况修改)：   #!/bin/bash #!!!Change the name!!! #The zookeepe
  • 【Spark八十】Spark RDD API二 bit1129 spark
    coGroup package spark.examples.rddapi import org.apache.spark.{SparkConf, SparkContext} import org.apache.spark.SparkContext._ object CoGroupTest_05 { def main(args: Array[String]) { v
  • Linux中编译apache服务器modules文件夹缺少模块(.so)的问题 ronin47 modules
    在modules目录中只有httpd.exp，那些so文件呢？ 我尝试在fedora core 3中安装apache 2. 当我解压了apache 2.0.54后使用configure工具并且加入了 --enable-so 或者 --enable-modules=so (两个我都试过了) 去make并且make install了。我希望在/apache2/modules/目录里有各种模块，
  • Java基础-克隆 BrokenDreams java基础
            Java中怎么拷贝一个对象呢？可以通过调用这个对象类型的构造器构造一个新对象，然后将要拷贝对象的属性设置到新对象里面。Java中也有另一种不通过构造器来拷贝对象的方式，这种方式称为 克隆。         Java提供了java.lang.
  • 读《研磨设计模式》-代码笔记-适配器模式-Adapter bylijinnan java设计模式
    声明： 本文只为方便我个人查阅和理解，详细的分析以及源代码请移步 原作者的博客http://chjavach.iteye.com/ package design.pattern; /* * 适配器模式解决的主要问题是，现有的方法接口与客户要求的方法接口不一致 * 可以这样想，我们要写这样一个类（Adapter）: * 1.这个类要符合客户的要求 ---> 那显然要
  • HDR图像PS教程集锦&心得 cherishLC PS
    HDR是指高动态范围的图像，主要原理为提高图像的局部对比度。 软件有photomatix和nik hdr efex。 一、教程 叶明在知乎上的回答： http://www.zhihu.com/question/27418267/answer/37317792 大意是修完后直方图最好是等值直方图，方法是HDR软件调一遍，再结合不透明度和蒙版细调。 二、心得 1、去除阴影部分的
  • maven-3.3.3 mvn archetype 列表 crabdave ArcheType
    maven-3.3.3 mvn archetype 列表 可以参考最新的：http://repo1.maven.org/maven2/archetype-catalog.xml   [INFO] Scanning for projects... [INFO]                
  • linux shell 中文件编码查看及转换方法 daizj shell中文乱码vim文件编码
    一、查看文件编码。     在打开文件的时候输入:set fileencoding     即可显示文件编码格式。 二、文件编码转换     1、在Vim中直接进行转换文件编码,比如将一个文件转换成utf-8格式       &
  • MySQL--binlog日志恢复数据 dcj3sjt126com binlog
    恢复数据的重要命令如下 mysql> flush logs; 默认的日志是mysql-bin.000001，现在刷新了重新开启一个就多了一个mysql-bin.000002                  
  • 数据库中数据表数据迁移方法 dcj3sjt126com sql
    刚开始想想好像挺麻烦的，后来找到一种方法了，就SQL中的 INSERT 语句，不过内容是现从另外的表中查出来的，其实就是 MySQL中INSERT INTO SELECT的使用   下面看看如何使用   语法：MySQL中INSERT INTO SELECT的使用 1. 语法介绍       有三张表a、b、c，现在需要从表b
  • Java反转字符串 dyy_gusi java反转字符串
           前几天看见一篇文章，说使用Java能用几种方式反转一个字符串。首先要明白什么叫反转字符串，就是将一个字符串到过来啦，比如"倒过来念的是小狗"反转过来就是”狗小是的念来过倒“。接下来就把自己能想到的所有方式记录下来了。 1、第一个念头就是直接使用String类的反转方法，对不起，这样是不行的，因为Stri
  • UI设计中我们为什么需要设计动效 gcq511120594 UIlinux
    随着国际大品牌苹果和谷歌的引领，最近越来越多的国内公司开始关注动效设计了，越来越多的团队已经意识到动效在产品用户体验中的重要性了，更多的UI设计师们也开始投身动效设计领域。 但是说到底，我们到底为什么需要动效设计？或者说我们到底需要什么样的动效？做动效设计也有段时间了，于是尝试用一些案例，从产品本身出发来说说我所思考的动效设计。 一、加强体验舒适度 嗯，就是让用户更加爽更加爽的用
  • JBOSS服务部署端口冲突问题 HogwartsRow java应用服务器jbossserverEJB3
    服务端口冲突问题的解决方法，一般修改如下三个文件中的部分端口就可以了。   1、jboss5/server/default/conf/bindingservice.beans/META-INF/bindings-jboss-beans.xml   2、./server/default/deploy/jbossweb.sar/server.xml   3、.
  • 第三章 Redis/SSDB+Twemproxy安装与使用 jinnianshilongnian ssdbreidstwemproxy
    目前对于互联网公司不使用Redis的很少，Redis不仅仅可以作为key-value缓存，而且提供了丰富的数据结果如set、list、map等，可以实现很多复杂的功能；但是Redis本身主要用作内存缓存，不适合做持久化存储，因此目前有如SSDB、ARDB等，还有如京东的JIMDB，它们都支持Redis协议，可以支持Redis客户端直接访问；而这些持久化存储大多数使用了如LevelDB、RocksD
  • ZooKeeper原理及使用 liyonghui160com
               ZooKeeper是Hadoop Ecosystem中非常重要的组件，它的主要功能是为分布式系统提供一致性协调(Coordination)服务，与之对应的Google的类似服务叫Chubby。今天这篇文章分为三个部分来介绍ZooKeeper，第一部分介绍ZooKeeper的基本原理，第二部分介绍ZooKeeper
  • 程序员解决问题的60个策略 pda158 框架工作单元测试
    根本的指导方针 1. 首先写代码的时候最好不要有缺陷。最好的修复方法就是让 bug 胎死腹中。 良好的单元测试 强制数据库约束 使用输入验证框架 避免未实现的“else”条件 在应用到主程序之前知道如何在孤立的情况下使用   日志 2. print 语句。往往额外输出个一两行将有助于隔离问题。 3. 切换至详细的日志记录。详细的日
  • Create the Google Play Account sillycat Google
    Create the Google Play Account Having a Google account, pay 25$, then you get your google developer account. References: http://developer.android.com/distribute/googleplay/start.html https://p
  • JSP三大指令 vikingwei jsp
    JSP三大指令   一个jsp页面中，可以有0~N个指令的定义！ 1. page --> 最复杂：<%@page language="java" info="xxx"...%>   * pageEncoding和contentType：     > pageEncoding：它
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他