插件 | 人人-点点点-光速下载 NCBI/ENA NGS原始数据

今天有趣，看到两个微信群讨论到 Mol Plant 网站上 TBtools 的文稿是Most Read，亦即期刊主页上去看 TBtools 文稿的人相对较多。

基于期刊网站数据，TBtools 正式文稿发表后，目前被引 28 次。

不过事实上，TBtools 2020年元旦至今引用应是超过 500【已然实现了之前的Typo，那会计算错了，以为日均2个Citations，不过现在已经是事实】。平均到 8 个月，那么每个月也要有 60+ 个引用。换句说，保守起见，TBtools 正式文稿发表至今，多少也要有 100+ 个引用才正常。

然而，现在两个月只有 28 个，说明，其实很多人依旧不知道 TBtools 已经发表了。我尝试在 google scholar 检索，确实检索不到 MP 文稿。不时还是有人会在 用户交流群 或者是 公众号 上问题引用文件。于是，这里继续放出一个链接，希望大家如果使用 TBtools 并方便引用时， 直接引用 MP 文稿，跳转以下链接即可：

https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(20)30187-8

回到主题。

写在前面

最近学位论文七七八八，于是我也可以拿出撰写过程中产生的一些想法，逐一验证（换句话说，先保证毕业，新的想法看情况再说）。既然要验证，就需要分析一些数据 更或者说 下载一些公开可获取的测序数据。要快速下载这些数据，其实比较麻烦：

1. Aspera 是最优选择
2. 在审计服务器下的主机用不了，意味着 SCAU 校园机房的服务器用不了，所以只能本地下
3. 本地最好是用 Linux，那么要配置环境，Sad！
4. 本地 Windows 或者 Mac 也可以，但是一样，环境又得搞，麻烦
5. 最后，还要输入命令！....麻烦啊

知道我的人都很清楚，我是一个正经的懒人。于是我决定必须打包起来，这样所以 TBtools 用户，包括我，就可以光速下载测序数据，而不用浪费时间去折腾。
于是，Ascp GUI Wrapper - 插件小九？就产生了。

获取与安装插件

首先，这个插件只支持 Windows 和 MacOS 用户（因为 TBtools 的Linux 操作平台用户不超过 10 个，所以我是不会管他们的）。获取插件的方式很简单，直接加到任一 TBtools 用户交流群（最新QQ群号：1009773095） ，在群共享下载即可。
Ascp GUI Wrapper 是一个 Wrapper，所以是一个打包插件，文件格式为 .zip。

安装插件时，打开 TBtools，点击插件安装菜单，

随后，拖拽放置 .zip 文件

点击打开，即可安装完成

使用插件

打开 TBtools，并跳转到插件菜单

即可看到界面

image.png

按 Note 中的链接要求准备链接，存储在文件中，或者直接 黏贴进去。设置输出目录，点击 Start，然后等着就是了。
如果你想知道进度，那么 About 菜单下，找到 Debug Log，打开看看就是了。

恩，一切过分简单

如何获得链接

最好的获得方式，其实还是 TBtools。具体请参考两篇推文：
挖掘SRA的辅助小工具（NCBI高通量测序数据收录库）
https://mp.weixin.qq.com/s/amsG4dEYwXU-DyRVvI9d7A
以及
公开可获取~没有下载不到的测序原始数据！
https://mp.weixin.qq.com/s/CS04e0QRjq0B-NZUfCpUAg
现在这两个功能，都已经优化，自动输出 Aspera 的链接。当然了，你得更新 TBtools 到目前最新版 v1.0532 或者更新的版本。

写在最后

人是懒人~ 但还是要做点省时省事的。
大伙用了 TBtools，忘了或者不方便引用没关系，记得多推广，越多人用的工具，只会变得越稳健，已经功能丰富和强大。
但如果你方便在论文中引用，请还是引用 Mol Plant 文稿，点击阅读文本，跳转期刊文稿页面（似乎...变成开放获取的，印象我们没选开放获取....）
总之，祝大伙科研顺利了。