WHONET与我

WHONET虐我千百遍,我待WHONET如初恋。

WHONET是微生物工作者不可缺少的统计软件，仰慕已久，一直想掌握它。它的强大在于它能够剔除同一患者的重复菌株，据说几乎能够统计你想要的各种科室、各种标本的各种细菌的各种抗生素的各种结果。可惜我一直没有进修机会。

时间追溯到2017年2月，我们微生物室顺利通过了CHINET（国家耐药监测网）基层版的选拔面试，面试结束后，专家表示我们将会在不久的将来，接受多轮培训及考核。但上海华山抗生素研究所的胡付品教授，连同其他三位教授专家，也指出了我们全国11家初试通过单位的实验数据中存在一些问题（很高兴，这些问题我和微生物室的同事们费了好大劲，目前已全部改正）。

我预感到雨后春笋般的新知要来了，放弃休息时间去接受它们，心中不禁有些微的惶恐和期待。

我们果真在2017年4月接受了上海华山抗生素研究所的专家培训，来自全国二级医院微生物室的11个人感受了上小课的优待。回来后的两个月的时间，我便陷入这虐恋深渊。每天钻研设置WHONET及Baclink软件，痛并快乐。痛是因为WHONET设置很复杂，对其一无所知，一切都要独自去问，去学，偶尔孤独无助时会想放弃，但又深知我不会不能放弃。快乐是一步步向着理想的结果靠近，并且发现其实强大的支持就在身后不远处。

从上海回来后，我和微生物室的同事们便按照学习内容及考核要求逐步执行下去，该买质控菌株的买菌株，按规范保存菌种和进行试验，该调整药敏厂家的调整（比如流感嗜血杆菌、肺炎链球菌板条换成康泰的），该增加实验方法的增加（比如凝固酶阴性的葡萄球菌的头孢西丁纸片试验，流感嗜血杆菌的五、十因子，beta内酰胺酶试验，肺炎链球菌的头孢曲松E-TEST）。

为了更换厂家后仍能将结果传到LIS系统，我不得不修改原来的厂家的软件设置，失败后又找厂家升级软件，由于软件不匹配，现在报告流感嗜血杆菌和肺炎链球菌的结果时都需要特别注意删除个别药物。

这些都给微生物室的同事们增加了许多工作量，但是同事们为了发出准确的报告结果，都毫无怨言，非常支持我如此折腾，比心比心。

WHONET设置我走了哪些路？

我们11家单位在这次培训中获得了胡教授编写的WHONET设置“宝典册”，近距离接受了胡教授以及杨洋老师的培训，掌握了基础的操作。

但是回到本单位，发现WHONET，Baclink设置没那么简单。当然一路走完，发现也不是那么难了。在改进试验结果的同时，我边学，边实践，走了一些弯路。因为要求字段需要患者的住院号，姓名，性别，年龄，标本类型，等等信息，我更改了阳性登记本的表格内容，做标本的同事每天处理完阳性标本后，要对着电脑一个一个查找阳性患者年龄进行信息登记，发报告的同事第二天再一项一项录入，确保患者信息的完整，以便分析。

后来知道不用这么麻烦，和WHONET绑定安装的Baclink，这个软件的功能在于它能将LIS导出的TXT格式的详细的患者信息及结果，转换成EXCEL格式。但我当时并不知道，一看是TXT格式，就晕了，心想完了，咱医院是不是没有购买这个功能啊？！就想请LIS工程师帮忙改一下格式设置，结果LIS工程师毫不客气，直接回绝了。后来我又找本单位信息科的赵巍，帮我导成EXCEL格式，在此表示非常的感激。

后来，偶然的一次，我在朋友圈搜索自己保存的“WHONET”相关图片材料时，发现了微生物大讲堂在2016年9月发布过两篇WHONET及Baclink设置的初、高级视频，是乐清市人民医院林雪峰老师讲授的，非常实用，我后来还在Qq上向他提问，发现牛人其实比我想象的谦逊。通过反复听课，我才知道原来LIS导出的格式就是TXT的，再由Baclink将TXT导成EXCEL格式，再由WHONET对EXCEL分析，我按照视频所讲，对Baclink导入TXT，Baclink软件自动识别一个患者信息，由我来进行字段格式的对应，比如住院号字段对应住院号，姓名对应姓名，年龄对应年龄，出生年月日、科室、标本、细菌、药物、结果等等一一对应，设置好一个患者，其它的患者，软件就能根据字段分隔，自动识别代入，但是我们的LIS导出的患者信息又和视频里的不太一样，“字段分隔符”是“TAB空格”，而视频里的是“逗号”，我尝试了许久，都搞不定，我再次怀疑我们的LIS导出的文件有问题。我硬着头皮找LIS工程师，他不加我微信，我只好在电话里描述了问题，他没有指导我，说给我发设置说明书，我按照说明一步步操作，终于全部设置好了，可是“年月日”的格式怎么又和说明书不一样了，纠结了两日，我又给LIS工程师打电话，等我终于把问题阐述明白了，他告诉我直接手动改就行了，就这么简单。

设置好格式，Baclink还需要录入抗生素、细菌、科室、标本类型的英文代码字典，保证软件能够识别TXT里的中文，统一转换成英文，才能用WHOENT进行分析。又是几天忙活。有的细菌代码怎么也找不到，后来在迪尔工程师巫伟军的指导下，顺利找到，原来迪尔的电脑里有相关文件。

Baclink设置好，不要忘记还要设置WHONET的科室、标本、抗生素代码字典。有些药物没有CLSI折点，比如头孢哌酮/舒巴坦，需要自己输入。

好在这些麻烦的工作只是一次性的，只要把那6个“设置文件”保存好，即使更换电脑也不怕了。

WHONET软件很多统计功能，我只是小试牛刀，还未深切领教。将来有机会好好切磋。当中可能还有一些需要注意的细节。

WHONET软件也有一定的局限，比如不能统计MDR（三类及以上抗生素耐药，每一类中有一种耐药就算这一类耐药），但从根本上，MDR不可能准确统计出来，因为我们不可能把所有种类药物都做了，软件也不可能把所有药物都囊括，PDR（全耐药）也是同样道理不能统计。ESBLs本院也无法统计，因为我们的原始数据没有保留ESBLs试验的药物（头孢他啶、头孢他啶棒酸以及头孢噻肟、头孢噻肟棒酸）结果，只能每天手工累计。

以此文告慰我过去的2个月的努力的汗水，虽然这些工作暂时几乎可能没有任何物质回报，为了获得更加准确的分析数据统计，值得。在此感谢那些途中结识的同道和前辈，以及微生物室同事们的辛苦付出。为你们点赞！