效忠刘宋寻阳政权的庾业，在长塘湖夹湖口两岸修筑城堡，部队有七千人，与刘延熙互为呼应。建康将领沈怀明、张永与据守晋陵的军队正面对峙，很长时间无法决出胜负。
外监朱幼举荐参军督护任农夫，说他骁勇有胆力，明帝配给他四百人，让他增援东部战场。
任农夫从延陵出发，攻击长塘湖，庾业的筑城工事还没有完工，任农夫率军急行挺进，猛烈进攻，大破庾业军。庾业放弃城堡，逃回到义兴。
任农夫接收他们遗留下来的武器、船只，向义兴进军，增援吴喜。吴喜渡过荆溪，攻打义兴城池，同时派出军队，分别攻打其他营垒。他站在高处挥动小旗发令，像是指挥很多军队同时进攻的样子。义兴城的军队大为恐慌，各营垒霎时崩溃，刘延熙投河自尽，吴喜于是攻克义兴。
沈怀明、张永、萧道成等人驻防在九里以西的地方，与东部军相互僵持。东部军听到义兴战败的消息，上上下下都非常惊恐。
明帝派江方兴、王道隆前往晋陵，视察东部战场形势。孔觊的部将孙昙瓘、程扞宗修筑了五个城堡，互相连接。程扞宗堡垒的泥土还没有凝固的时候，王道隆对各位将领说：“程扞宗的城堡尚未完成，眼下正是下手的良机，上符合皇上的圣旨，下振奋众人的士气。”
于是，王道隆率各将领发动急攻，攻克堡垒，杀了程扞宗，张永等人乘胜进攻孙昙瓘。孙昙瓘大败，与晋陵袁标一起弃城逃跑，晋陵遂被攻克。
吴喜进军到达义乡时，孔璪驻扎在吴兴南亭，王昙生正在孔璪这里商讨事情，孔璪听说建康的官军已经逼近，十分恐惧，吓得从床上跌下来，说：“他们悬赏捉拿的就是我，今天再不逃走，肯定会被他们活捉的！”
于是，孔璪与王昙生放弃城池，投奔钱塘，吴喜于是进入吴兴。
任农夫率军攻打吴郡，顾琛也弃郡投奔会稽。明帝因为晋陵、义兴、吴兴、吴郡四郡都已经平定，就命吴喜帅领沈怀明等人继续东征，攻打会稽；命张永等人北上，攻打彭城；命江方兴等人南下，攻打寻阳。
吴喜进军到达钱塘，孔璪与王昙生又逃往浙东，吴喜派任农夫率军去进攻黄山浦，东部军沿岸安营扎寨，被任农夫打败。吴喜从柳浦渡口进军，攻下西陵，斩了庾业。
会稽人心惶惶，将领士卒大多逃亡，孔觊也无法制止。上虞县令王晏趁机起兵攻击郡城，孔觊逃往嵴山，他的部下张绥查封了州府及仓库，等待吴喜。
第二天一早，王晏先行入城，杀死了张绥，在王府别墅中逮捕寻阳王刘子房，然后放纵士兵大肆抢劫，官府仓库全被抢空，又抓住了孔璪斩首。
嵴山村民捆绑住孔觊，送给王晏，王晏对他说：“这次背叛朝廷，都是孔璪一个人策划的，与你并不相干，只要你写一份自首状，我会替你向上申诉。”
孔觊说：“江东战场的决策，全被都是由我一人做主，把责任推给别人，自己求得活命，那是你这种人才做得出来的。”王晏大怒，于是将孔觊斩首。顾琛、王昙生、袁标等人都向吴喜投降，请求处分，吴喜都予以宽大处理。东部战场叛军军官共有七十六人，除了作战阵亡的十七人外，其他的人都得到了宽恕。
薛索儿围攻申阐，很久都没有攻克，他令申令孙进城说服申阐，申阐出来投降后，薛索儿把申令孙和申阐一并杀掉了。
寻阳方面的邓琬其人性情昏庸，人品卑劣，贪财而又吝啬，他掌握大权之后，父子二人卖官鬻爵，派他家的婢女奴仆到市场上贩卖货物赚钱。他傲慢自大，不可一世，宾客上门求见，有达十几天都见不到面的，内部事务全部委托给中书舍人褚灵嗣等三人，这一群卑劣小人，横行霸道、作威作福，于是，士民怨恨，内外离心。
邓琬命孙冲之任前锋，率龙骧将军薛常宝、陈绍宗、焦度等一万人为前锋，进驻赭圻。孙冲之在行军途中上疏给刘子勋说：“船只已准备妥当，粮秣武器已配备齐全，三军踊跃，士兵争先效命。现在就要顺流起航，直取白下，请命陶亮率兵马随后跟上，分别占领新亭、南州，那么就可以一次平定天下了。”
刘子勋于是加授孙冲之为左卫将军，任命陶亮为右卫将军，指挥郢、荆、湘、梁、雍五个州的部队，攻击二万人，同时东下。陶亮本无谋略才干，听说建康方面是派的建安王刘休仁亲自率军逆江而上，殷孝祖也随后会赶到，便不敢前进，驻扎在鹊州。
殷孝祖妻子儿女全部被叛军所杀，自认为天下之大，没有比他更忠心的了，常常欺辱其他将领，建康军中有父子兄弟在寻阳政权辖区的，殷孝祖打算都逮捕审批，于是，军心涣散，将士愤懑，不肯听从他的指挥。
宁朔将军沈攸之对内安抚官兵，对外同其他将领和睦相处，大家对他十分信赖。殷孝祖每次出战，常常携带显示他高贵身份的云盖和战鼓，军中同僚以及士卒都说：“殷孝祖可以说是不怕死的将领了，他跟敌人作战，却带着豪华的仪仗队，自己暴露自己，敌人如果挑出十个神射手同时射箭，他想不死，又怎么可能呢！”
几天后，建康军队水陆并进，攻打赭圻，陶亮率军前来增援，殷孝祖在交战中果然被流箭射中阵亡，范潜率五百人向陶亮投降，建康方面军心震动，人们都认为沈攸之应该接替殷孝祖的指挥权。
当时，建安王刘休仁驻军虎槛，派江方兴、刘灵遗各率三千人马，前往赭圻。沈攸之认为殷孝祖既已阵亡，陶亮一定会乘胜进攻，官军第二天如果再不主动发起攻势，就会向敌人暴露出自己力量薄弱。江方兴的名望和地位跟自己相等，绝不可能接受自己的指挥，而军事行动不能统一，是导致失败的原因。
于是，沈攸之就率部下的将领去拜访江方兴，说：“现在，四面八方都起兵叛乱，朝廷所占据的不过百里之地，朝廷所依赖的也只有殷孝祖一人。不想，刚刚兵戈相接，他就陈尸马下，文武官员全部都很沮丧，朝野人士提心吊胆，朝廷大事能否成功，只看明日一战。如果战而不胜，朝廷就会全盘瓦解。有关明日之战，将领中有人说应该由我指挥，可我自问魄力不够，才能和谋略都不如你，所以我们现在打算推举你为统帅，大家同心协力。”
江方兴十分喜悦，满口承诺。沈攸之告辞出来，各位将领都抱怨他，沈攸之却说：“我只希望拯救国家，岂能计较官职高低！而且，我能向他低头，他却一定不肯向我低头，怎么可以自己先内斗起来！”
寻阳方面孙冲之对陶亮说：“殷孝祖是一员悍将，一战就把他杀死，天下大事已经定了，不必再战，现在就应该直接进攻京城。”陶亮不同意。
第二日，江方兴率领各路将领进攻，建安王刘休仁又派郭季之、杜幼文、垣恭祖、段佛荣等三万人前去增援助战。双方自凌晨厮杀到中午，寻阳方面军队大败，江方兴等人一直向北追击到姥山才回来。