PyG官方手册入门学习-数据处理+基于PyG实现2层GCN模型

PyTorch Geometric（torch_geometric）简介小桥流水---人工智能机器学习算法深度学习人工智能 pytorch 人工智能 python
在深入探讨PyTorchGeometric（通常简称为PyG）之前，我们先了解一下它的背景和应用。PyG是基于PyTorch的一个扩展库，专为图数据和图网络模型设计。图网络是深度学习领域的一种强大工具，它能够处理结构化数据，如社交网络、分子结构、交通网络等。PyTorchGeometric的主要功能数据处理与加载：图数据的简化表示：PyG提供了一种高效的方式来表示和存储图数据。主要是通过Data对
深入理解PyTorch中的MessagePassing 小桥流水---人工智能深度学习机器学习算法人工智能 pytorch 人工智能 python
深入理解PyTorch中的MessagePassing图神经网络（GraphNeuralNetworks，简称GNNs）在近年来已成为处理图形数据的一种强大工具，广泛应用于社交网络分析、蛋白质结构预测、知识图谱增强等多个领域。PyTorchGeometric（PyG）是基于PyTorch的一个库，专为图神经网络的研究和实现而设计。在PyG中，MessagePassing类是实现图神经网络层的核心组
Task04：数据完整存储与内存的数据集类+结点预测与边预测任务实践 cherry_7
数据完整存储与内存的数据集类一、InMemoryDataset基类简介在PyG中，通过继承InMemoryDataset类来自定义一个数据可全部存储到内存的数据集类。classInMemoryDataset(root:Optional[str]=None,transform:Optional[Callable]=None,pre_transform:Optional[Callable]=None,
Datawhale组队学习GNN-task04 数据完整存储与内存的数据集类+节点预测与边预测任务实践 79f3c66c2fe7
DataWhale开源学习资料:https://github.com/datawhalechina/team-learning-nlp/tree/master/GNN6.1数据完全存于内存的数据集类学习在PyG中如何自定义一个数据完全存于内存的数据集类。InMemoryDataset基类简介根文件夹（root）raw_dirprocessed_dir传递的三个函数：transformpre_tra
【深度学习】pytorch 与 PyG 安装（pip安装）何为xl 深度学习 python 深度学习 pytorch pip
【深度学习】pytorch与PyG安装（pip安装）一、PyTorch安装和配置（一）、安装CUDA（二）、安装torch、torchvision、torchaudio三个组件（1）下载镜像文件（2）创建一个新的虚拟环境（3）加载.whl文件并测试安装是否成功二、PyG安装（一）安装torch_scatter、torch_sparse、torch_cluster、torch_spline_conv
在Conda中搭建PyTorch+DGL+PyG时需要仔细查看的几个关于版本的网页蛐蛐蛐 conda pytorch 人工智能
这方面的问题我总结过很多次了，例如：基于Conda的PyTorchGeometric报“段错误(核心已转储)”的解决方法_段错误,核心已转储yolov5-CSDN博客但是现在还是能遇到问题，例如今天在一个新的Ubuntu上复现别人论文里的实验，就还是出现了问题。因为这个repo用到了DGL（我也是用DGL和PyG比较多），报了一些诸如：cannotimportname'Mapping'from'c
jupyter出现问题ModuleNotFoundError: No module named ‘exceptiongroup‘ 我的心永远是冰冰哒 jupyter python windows
今天使用pyg的jupyter环境发现这个环境没法用,所以只能把这个kernel给重删了然后再装，操作记录如下查看kerneljupyterkernelspeclist注意不是jupyterkernel--list需要加关键字spec,删除kerneljupyterkernelspecremovepyg当重新安装这个kernel时可能会出错python-mipykernelinstall--nam
使用Python的pygame库实现下雪的效果软件技术爱好者 Python学习 python 开发语言
使用Python的pygame库实现下雪的效果关于Python中pygame游戏模块的安装使用可见https://blog.csdn.net/cnds123/article/details/119514520先给出效果图：源码如下：importpygameimportrandom#初始化pygamepygame.init()#设置屏幕尺寸width,height=800,600screen=pyg
一条命令解决安装torch_scatter torch_sparse torch_cluster torch_spline _Lyang_ 深度学习深度学习 python pytorch
在相应环境下输入pipinstallpyg_libtorch_scattertorch_sparsetorch_clustertorch_spline_conv-fhttps://data.pyg.org/whl/torch-2.0.0+cu118.html该命令安装了pyg_lib包以及一些与PyTorch相关的包（torch_scatter、torch_sparse、torch_cluster
【GNN2】PyG完成图分类任务，新手入门，保姆级教程 Dream of Grass 图神经网络 ML 分类人工智能 pytorch 图论
上次讲了如何给节点分类，这次我们来看如何用GNN完成图分类任务，也就是Graph-level的任务。【GNN1】PyG实现图神经网络，完成节点分类任务，人话、保姆级教程-CSDN博客图分类就是以图为单位的分类，举个例子：每个学校都有社交关系网，图分类就是通过这个社交网络判别这个学校是小学、初中、高中还是大学。实现方法就是通过利用图的结构信息，对图进行嵌入（embed），也就是用向量来表示这个图，使
一个Pygame的Hello World示例程序北辰Charih pygame python 开发语言
创建一个标题为HelloWorld的窗口，窗口中间显示有Pygame的Logo的python代码importsysimportpygamedefmain():pygame.init()screen=pygame.display.set_mode((800,400))pygame.display.set_caption("HelloWorld")logo=pygame.image.load("pyg
【GNN 1】PyG实现图神经网络，完成节点分类任务，人话、保姆级教程 Dream of Grass 图神经网络 ML 神经网络人工智能图神经网络图论
我们来做一个节点分类的任务，选择的数据集是KarateClub，Karate是空手道的意思，所以这就是一个空手道俱乐部的数据。简而言之，这个数据集，包含34个节点，156条无向无权边，结点总共分为4类，此外，每个节点还有34个特征，也就是说还有34个指标来描述空手道俱乐部的每个成员。欸？特征数怎么和节点数一样，没错，就是one-hot编码。下图是论文原图，颜色表示了类别。数据集的详细说明这个数据集
pygarm windows 安装_飘云阁(PYG官方) Windows PowerShell实战指南（第2版）PDF - Powered by Discuz!... 铁扇公子 pygarm windows 安装
第1章背景介绍11．1为什么要重视PowerShell11．2本书适用读者31．3如何使用本书31．4搭建自己的实验环境41．5安装WindowsPowerShell51．6在线资源71．7赶紧使用PowerShell吧7第2章初识PowerShell82．1选择你的“武器”82．2重新认识代码输入132．3常见误区152．4如何查看当前版本152．5动手实验162．6进一步学习16第3章使用帮助
pyg安装和初步试用句_4cef
图的基本概念学习GNN之前需要掌握图的基本概念，这些概念基本都在数据结构这门课中涉及，需要再简单过一遍。1.有向图、无向图、有权图、无权图2.节点的度degree（出、入）3.节点邻接节点表示为N（）4.子图和连通分量（连通分量属于子图的一种，但是联通分量中任意节点之间都存在路径且所有边的节点都存在与连通分量中）5.节点s→t之间的最短路径表示两结点中所有路径集合中取长度最短的路径6.连通图的直径
pyg库自定义图数据集图学习的小张图数据挖掘学习路线 python
PyG提供了torch_geometric.data.Data用于构建图，包括5个属性，每一个属性都不是必须的，可以为空。Data(x,edge_index,edge_attr,y）x:存储每个节点的特征，形状是[num_nodes,num_node_features]，一般是floattensor。edge_index:用于存储节点之间的边，形状是[2,num_edges]，一般是longt
学习php中使用composer下载安装firebase/php-jwt 以及调用方法徊忆羽菲 Php Composer php 学习 composer
学习php中使用composer下载安装firebase/php-jwt以及调用方法1、安装firebase/php-jwt2、封装jwt类1、安装firebase/php-jwtcomposerrequirefirebase/php-jwt安装好以后出现以下文件:2、封装jwt类根据所使用的php框架，在指定目录创建Token.php'pyg',//签发人(官方字段:非必需)'exp'=>tim
解决PyG 报错 from torch_geometric.nn.pool.topk_pool import topk, filter_adj zoe_ya 图神经网络
问题：使用Pytorch的PyG搭建图神经网络报错cannotimporttopk,filter_adjfromtorch_geometric.nn.pool.topk_pool解决版本问题语法变化topk=>SelectTopkfilter_adj=>FilterEdgesfromtorch_geometric.nn.pool.connectimportFilterEdgesfromtorch_
torch_cluster、torch_scatter、torch_sparse三个包的安装 PS Ma python异常错误 python 深度学习 pytorch
涉及到下面几个包安装的时候经常会出现问题，这里我使用先下载然后再安装的办法：pipinstalltorch_clusterpipinstalltorch_scatterpipinstalltorch_sparse1、选择你对应的torch版本：https://data.pyg.org/whl/2、点进去然后，选择对应的版本就选择他们一一对应的的包下载即可，然后再pipinstallXXX.whl安
详解PyG中的ToSLIC变换 Yuetianw 深度学习
详解PyG中的ToSLIC变换PyG是一个基于PyTorch的图神经网络库，提供了丰富的数据处理、图转换和图模型的功能。本文将介绍PyG中的一个图转换函数ToSLIC，它可以将一张图片转换为一个超像素图，并生成相应的数据对象。前言PyG是一个开源的Python库，用于深度学习任务中的图神经网络（GNN）建模和训练。该库包括多个GNN模型和与图相关的数据结构和算法。在本篇文章中，我将介绍PyG中的T
图深度学习框架PyG（Pytorch-Geometric）代码实战总是重复名字我很烦啊图机器学习图深度学习图网络系列深度学习 pytorch 人工智能
PyG代码实战PyG安装图神经网络的通用代码框架撰写指南GCN代码框架GraphSAGE代码框架空手道俱乐部(karateclubdataset)GCN代码实战准备工作读取数据可视化GCN训练损失下降曲线论文引用数据集(coradataset)GCN代码实战准备工作读取数据可视化MLP和GCN代码对比MLP和GCN准确度对比和GCN结果可视化构建PyG数据格式单图和多图情景下的代码框架雅虎电商数据
实战-----基于 PyTorch 的 GNN 搭建海阔＆天空742 pytorch 人工智能 python
目录1.图的表示2.图卷积网络（GCN）的搭建3.图注意力网络（GAT）的搭建4.PyG基础：图数据的操作1.torch_geometric的安装2.图数据的属性3.基准图数据库及基本操作4.图数据的可视化5.实验总结1.图的表示在开始讨论特定的图神经网络操作之前，我们首先来考虑如何表示图。在数学上，图G定义为一组节点/顶点V和一组边/链接E：G=（V，E）的二元组。每条边链接两个顶点，如下图所示
mac M2 pytorch_geometric安装我的心永远是冰冰哒 macos pytorch 人工智能
我目前的环境是macM2，我在base环境中安装了pytorch_geometric,仅仅做测试用的，不做真正跑代码的测试首先我的base环境的设置如下：pipinstallpyg_libtorch_scattertorch_sparsetorch_clustertorch_spline_conv-fhttps://data.pyg.org/whl/torch-2.1.0+cpu.htmlpipi
图神经网络：PYG库基本操作 Q天马A行空Q #图神经网络GNN 神经网络 pytorch 深度学习
文章说明：1)参考资料：PYG的文档。文档超链。2)博主水平不高，如有错误还望批评指正。文章目录一.图的数据处理二.常见的基准数据集三.小批量的计算方式四.数据变换五.后记一.图的数据处理导入对应的库fromtorch_geometric.dataimportDataimporttorch创建图数据的第一种方式，简单易懂不过多的赘述edge_index=torch.tensor([[0,1,1,2
普通邻接矩阵转换成edge_index的COO稀疏矩阵形式，格式为[2, num_messages] weixin_46269351 python 矩阵深度学习
普通邻接矩阵转换成edge_index的COO稀疏矩阵形式，格式为[2,num_edges]。平时我们接触的邻接矩阵adj的形式要么是稠密矩阵（原始二维矩阵），但是在使用PyG框架的时候会发现格式不对，需要形式为[2,edges]的coo_matrix。首先，把adj转为普通的coo_matrix矩阵：adj=sp.coo_matrix(adj)(0,633)1(0,1862)1(0,2582)1
PyG 将普通矩阵(dense)转化为稀疏矩阵(edge_index, edge_weight) 夕风残叶笔记 pytorch
PyG将普通矩阵(dense)转化为稀疏矩阵(edge_index,edge_weight)edge_index,edge_weight=torch_geometric.utils.dense_to_sparse(adj)
pyG edge_index矩阵转普通邻接矩阵，COO稀疏矩阵，包含同质图和异质图 hmtccss pytorch pyG python
搜这个转化实在难找，在此记录一下！**pyG的edge_index转COO同质图**importtorch_geometrictorch_geometric.utils.to_scipy_sparse_matrix(data.edge_index)异质图importnumpyasnp#假如异质图size：N*Mfromscipy.sparseimportcoo_matrixrow=(hetedat
PyG edge index 转换回邻接矩阵 Yonggie pytorch python scipy pytorch 邻接矩阵
PyG的edgeindex形式是[(node1,node2),(node1,node3)...][(node_1,node_2),(node_1,node_3)...][(node1,node2),(node1,node3)...]这种edgepair。naive直接for循环，吧edgeindex里面的位置填充1：importtorchdefedge_index_to_adjacency_mat
GNN打卡1 今天我伏笔了吗 GNN
首先，简单回顾了图论方面的知识，其中拉普拉斯矩阵是图卷积节点嵌入的基本原理。其次，搭建了环境。最后，学习了PYG中Data和dataset的使用。data.Data类用来表示图数据集，有很多方便的函数和属性。dataset模块里面则包含了很多现成的数据集供使用。作业：classNewData(torch_geometric.data.Data):def__init__(self,node_org=
PyG MessagePassing机制源码分析发呆的比目鱼 PyTorch框架人工智能深度学习机器学习
PyGMessagePassing机制源码分析Google在2017发表的论文NeuralMessagePassingforQuantumChemistry中提到的MessagePassingNeuralNetworks机制成为了后来图机器学习计算的标准范式实现。而PyG提供了信息传递（邻居聚合）操作的框架模型。其中，□\square□表示可微、排列不变的函数，比如说sum、mean、maxγ\g
PYG(Pytorch Geometric)中文说明书——第3章TUTORIALS Afresco o pytorch 人工智能 python
本文为pyg官网的中文翻译（官方原版链接https://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/），并加入了一些其他网上大佬和自己的理解。如有翻译理解不当之处还请各位多多指出，非常感谢！3.1CreatingMessagePassingNetworks将卷积算子推广到不规则域通常表示为邻域聚合或消息传递方案。用表示第（k-1）层中节点i的特征，表示节点
PHP如何实现二维数组排序？ IT独行者二维数组 PHP 排序　
二维数组在PHP开发中经常遇到，但是他的排序就不如一维数组那样用内置函数来的方便了，（一维数组排序可以参考本站另一篇文章【PHP中数组排序函数详解汇总】）。二维数组的排序需要我们自己写函数处理了，这里UncleToo给大家分享一个PHP二维数组排序的函数：代码： functionarray_sort($arr,$keys,$type='asc'){ $keysvalue= $new_arr
【Hadoop十七】HDFS HA配置 bit1129 hadoop
基于Zookeeper的HDFS HA配置主要涉及两个文件,core-site和hdfs-site.xml。测试环境有三台 hadoop.master hadoop.slave1 hadoop.slave2 hadoop.master包含的组件NameNode, JournalNode, Zookeeper，DFSZKFailoverController
由wsdl生成的java vo类不适合做普通java vo darrenzhu VO wsdl webservice rpc
开发java webservice项目时，如果我们通过SOAP协议来输入输出，我们会利用工具从wsdl文件生成webservice的client端类，但是这里面生成的java data model类却不适合做为项目中的普通java vo类来使用，当然有一中情况例外，如果这个自动生成的类里面的properties都是基本数据类型，就没问题，但是如果有集合类，就不行。原因如下： 1)使用了集合如Li
JAVA海量数据处理之二（BitMap）周凡杨 java 算法 bitmap bitset 数据
路漫漫其修远兮，吾将上下而求索。想要更快，就要深入挖掘 JAVA 基础的数据结构，从来分析出所编写的 JAVA 代码为什么把内存耗尽，思考有什么办法可以节省内存呢？啊哈！算法。这里采用了 BitMap 思想。首先来看一个实验：指定 VM 参数大小： -Xms256m -Xmx540m
java类型与数据库类型 g21121 java
很多时候我们用hibernate的时候往往并不是十分关心数据库类型和java类型的对应关心，因为大多数hbm文件是自动生成的，但有些时候诸如：数据库设计、没有生成工具、使用原始JDBC、使用mybatis(ibatIS)等等情况，就会手动的去对应数据库与java的数据类型关心，当然比较简单的数据类型即使配置错了也会很快发现问题，但有些数据类型却并不是十分常见，这就给程序员带来了很多麻烦。 &nb
Linux命令 510888780 linux命令
系统信息 arch 显示机器的处理器架构(1) uname -m 显示机器的处理器架构(2) uname -r 显示正在使用的内核版本 dmidecode -q 显示硬件系统部件 - (SMBIOS / DMI) hdparm -i /dev/hda 罗列一个磁盘的架构特性 hdparm -tT /dev/sda 在磁盘上执行测试性读取操作 cat /proc/cpuinfo 显示C
java常用JVM参数墙头上一根草 java jvm参数
-Xms：初始堆大小，默认为物理内存的1/64(<1GB)；默认(MinHeapFreeRatio参数可以调整)空余堆内存小于40%时，JVM就会增大堆直到-Xmx的最大限制 -Xmx：最大堆大小，默认(MaxHeapFreeRatio参数可以调整)空余堆内存大于70%时，JVM会减少堆直到 -Xms的最小限制 -Xmn：新生代的内存空间大小，注意：此处的大小是（eden+ 2
我的spring学习笔记9-Spring使用工厂方法实例化Bean的注意点 aijuans Spring 3
方法一： <bean id="musicBox" class="onlyfun.caterpillar.factory.MusicBoxFactory" factory-method="createMusicBoxStatic"></bean> 方法二：
mysql查询性能优化之二 annan211 UNION mysql 查询优化索引优化
1 union的限制有时mysql无法将限制条件从外层下推到内层，这使得原本能够限制部分返回结果的条件无法应用到内层查询的优化上。如果希望union的各个子句能够根据limit只取部分结果集，或者希望能够先排好序在合并结果集的话，就需要在union的各个子句中分别使用这些子句。例如想将两个子查询结果联合起来，然后再取前20条记录，那么mys
数据的备份与恢复百合不是茶 oracle sql 数据恢复数据备份
数据的备份与恢复的方式有: 表,方案 ,数据库; 数据的备份: 导出到的常见命令; 参数说明 USERID 确定执行导出实用程序的用户名和口令 BUFFER 确定导出数据时所使用的缓冲区大小，其大小用字节表示 FILE 指定导出的二进制文
线程组 bijian1013 java 多线程 thread java多线程线程组
有些程序包含了相当数量的线程。这时，如果按照线程的功能将他们分成不同的类别将很有用。线程组可以用来同时对一组线程进行操作。创建线程组：ThreadGroup g = new ThreadGroup(groupName); &nbs
top命令找到占用CPU最高的java线程 bijian1013 java linux top
上次分析系统中占用CPU高的问题，得到一些使用Java自身调试工具的经验，与大家分享。 (1)使用top命令找出占用cpu最高的JAVA进程PID:28174 (2)如下命令找出占用cpu最高的线程 top -Hp 28174 -d 1 -n 1 32694 root 20 0 3249m 2.0g 11m S 2 6.4 3:31.12 java
【持久化框架MyBatis3四】MyBatis3一对一关联查询 bit1129 Mybatis3
当两个实体具有1对1的对应关系时，可以使用One-To-One的进行映射关联查询 One-To-One示例数据以学生表Student和地址信息表为例，每个学生都有都有1个唯一的地址(现实中，这种对应关系是不合适的，因为人和地址是多对一的关系)，这里只是演示目的学生表 CREATE TABLE STUDENTS (
C/C++图片或文件的读写 bitcarter 写图片
先看代码： /*strTmpResult是文件或图片字符串 * filePath文件需要写入的地址或路径 */ int writeFile(std::string &strTmpResult,std::string &filePath) { int i,len = strTmpResult.length(); unsigned cha
nginx自定义指定加载配置 ronin47
进入 /usr/local/nginx/conf/include 目录，创建 nginx.node.conf 文件，在里面输入如下代码： upstream nodejs { server 127.0.0.1:3000; #server 127.0.0.1:3001; keepalive 64; } server { liste
java-71-数值的整数次方.实现函数double Power(double base, int exponent)，求base的exponent次方 bylijinnan double
public class Power { /** *Q71-数值的整数次方 *实现函数double Power(double base, int exponent)，求base的exponent次方。不需要考虑溢出。 */ private static boolean InvalidInput=false; public static void main(
Android四大组件的理解 Cb123456 android 四大组件的理解
分享一下，今天在Android开发文档-开发者指南中看到的: App components are the essential building blocks of an Android
[宇宙与计算]涡旋场计算与拓扑分析 comsci 计算
怎么阐述我这个理论呢？。。。。。。。。。首先：宇宙是一个非线性的拓扑结构与涡旋轨道时空的统一体。。。。我们要在宇宙中寻找到一个适合人类居住的行星，时间非常重要，早一个刻度和晚一个刻度，这颗行星的
同一个Tomcat不同Web应用之间共享会话Session cwqcwqmax9 session
实现两个WEB之间通过session 共享数据查看tomcat 关于 HTTP Connector 中有个emptySessionPath 其解释如下： If set to true, all paths for session cookies will be set to /. This can be useful for portlet specification impleme
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springmvc Spring3 MVC @ResponseBody返回，jquery ajax调用中文乱码问题解决 Spring3.0 MVC @ResponseBody 的作用是把返回值直接写到HTTP response body里。具体实现AnnotationMethodHandlerAdapter类handleResponseBody方法，具体实
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这里先解释一下WAMP是什么意思。W:windows，A：Apache，M：MYSQL，P：PHP。也就是说本文说明的是在windows系统下搭建以apache做服务器、MYSQL为数据库的PHP开发环境。工欲善其事，必须先利其器。因为笔者的系统是WinXP，所以下文指的系统均为此系统。笔者所使用的Apache版本为apache_2.2.11-
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什么是POJO？ gupeng_ie java POJO 框架 Hibernate
POJO--Plain Old Java Objects(简单的java对象) POJO是一个简单的、正规Java对象，它不包含业务逻辑处理或持久化逻辑等，也不是JavaBean、EntityBean等，不具有任何特殊角色和不继承或不实现任何其它Java框架的类或接口。 POJO对象有时也被称为Data对象，大量应用于表现现实中的对象。如果项目中使用了Hiber
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根据这篇guide创建了一个简单的spring boot应用，能运行且成功的访问。但移植到现有项目（基于hbase）中的时候，却报出以下错误： SEVERE: A child container failed during start java.util.concurrent.ExecutionException: org.apache.catalina.Lif
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nginx的安装与配置,中途遇到问题的解决 qifeifei nginx
我使用的是ubuntu13.04系统，在安装nginx的时候遇到如下几个问题，然后找思路解决的，nginx 的下载与安装 wget http://nginx.org/download/nginx-1.0.11.tar.gz tar zxvf nginx-1.0.11.tar.gz ./configure make make install 安装的时候出现
用枚举来处理java自定义异常 tcrct java enum exception
在系统开发过程中，总少不免要自己处理一些异常信息，然后将异常信息变成友好的提示返回到客户端的这样一个过程，之前都是new一个自定义的异常，当然这个所谓的自定义异常也是继承RuntimeException的，但这样往往会造成异常信息说明不一致的情况，所以就想到了用枚举来解决的办法。 1，先创建一个接口，里面有两个方法，一个是getCode, 一个是getMessage public
erlang supervisor分析 wudixiaotie erlang
当我们给supervisor指定需要创建的子进程的时候，会指定M,F,A,如果是simple_one_for_one的策略的话，启动子进程的方式是supervisor:start_child(SupName, OtherArgs),这种方式可以根据调用者的需求传不同的参数给需要启动的子进程的方法。和最初的参数合并成一个数组，A ++ OtherArgs。那么这个时候就有个问题了，既然参数不一致，那

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