bam/sam数据格式——转载

1.bam文件读取

samtools view xxx.bam

samtools view xxx.bam |less

2.bam和sam的区别与一致

sam是带有比对信息的序列文件（即告诉你这个reads在染色体上的位置等），用于储存序列数据（SAM  format is a generic format for storing large nucleotide sequence alignments. ）。

BAM is the compressed binary version of the Sequence Alignment/Map (SAM) format. 生物信息中的二进制文件主要是为了节约空间，计算机机可读。可以用samtools工具实现sam和bam文件之间的转化。

二者都是fastq文件经过序列比对或者mapping后输出的格式（其储存的信息都是一致的）

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